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《核苷酸序列的模拟》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、核苷酸序列的模擬楊義清於國家理論科學中心﹙南區﹚1生物物理傳統的定義是以X-ray跟NMR來決定蛋白質結構等的問題。用物理的方法來解決生物系統中的問題，特別是以理論物理的方法。我感興趣的研究領域：核苷酸序列中各類特殊序列的成因。2TheNobelPrizeinPhysiologyorMedicine1962MauriceH.F.WilkinsFrancisH.C.CrickJamesD.Watson3DNA結構4Codingregion5CodonTable6microsatelliteDNA指單一核苷酸序列樣式所組成的序列，從頭到尾都是由連續的序列樣式所組成，中間沒有被其他鹼基打斷，所有的序
2、列樣式均介於2~6個鹼基之間。尚有SSRs﹙simplesequencesrepeats﹚和STRs﹙shorttandemrepeats﹚等這些代表連續重複序列的名稱。7WhyinterestinSSRs?Importantroleingeneticdisease,genomeorganization,andevolutionaryprocessesthemostwidelyusedmarkersforgeneticmapping,evolutionstudiesandforensicfingerprinting.thelengthpolymorphismofmicrosatelliters
3、isfrequentlyusedinmedicalpurpose.8MedicalPurposesgeneticmechanismofmoleculareventforevolutionandprogressionoftumor.suchasendometrialcarcinoma(Gurinet.al.,1999),hereditarynonpolyosiscolorectalcarcinoma(Eshleman&Markowitz,1996),thyroidtumor(Lazzereschiet.al.,1994),gastriccancer(Rhyuet.al.,1994),pancre
4、aticcancer(Hanet.al.,1993),andbladdertumor(Orlowet.al.,1994).910有關SSRs成因機制的研究Theresultsofmanyresearchersfavorthemodelofpolymerasetemplateslippage(Hendersonet.al.,1992;Morralet.al.,1991;Freudenreichet.al.,1997;Parker&Marinus,1992)OhtaandKimura(1973)introducedthestepwisemutationmodelwiththepolymeraset
5、emplateslippage,andthemicrosatellitelengthfollowsasimplerandomwalkwithareflectingbarrieratonerepeatunit.11Acontinuous-timeMarkovchainmodelthatincorporatesslippageeventsandpointmutations,astationarywasresulted(Kruglyaket.al.,1998;1999)Dokholyanet.al.(1997;1998)analyedasimplifiedmodelofunequalchromoso
6、malcrossingoverforexpressingthepower-lawdistributionNonlinearmodel12Han跟Li的研究﹙cond-mat/2025259﹚13smallworldD.J.WattsandS.H.Strogatz,Nature393,440-442(1998)14分析上所得到的結果SSR的長度分佈不是指數，也非對數SSR分布具有高度相關性(非隨機分布)這種影響已經不是slippage與pointmutation能夠形成的進一步的想法是提出一個機制來模擬，但是要具有生物上的證據Whatisthismechanism?15Microsatellit
7、eDNAEvolution161718AboutFuture學習到什麼的物理新知？如何藉由物理工具來協助生物學家瞭解各種分子生物學上長久存在的問題？19
