东海陆架沉积物古菌多样性研究【毕业论文】

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1、中文摘要本科毕业论文（20届）东海陆架沉积物古菌多样性研究专业：生物科学i中文摘要目录摘要iAbstractii引言11.材料与方法21.1实验材料21.1.1实验样品21.1.2主要生化试剂（盒）21.1.3主要试剂及培养基配制31.1.4实验仪器41.2实验方法51.2.1样品DNA的提取51.2.216SrDNA基因的PCR扩增61.2.3PCR产物的纯化61.2.4重组载体的构建71.2.5重组载体的转化71.2.6重组子的克隆81.2.7基因文库克隆的鉴定81.2.8系统发育分析81.2.9温度梯度凝胶电泳(TGGE)分析82.结果与分析102.1样品DNA的提取1

2、02.216SrDNA基因扩增与纯化102.3克隆文库的构建与鉴定112.4系统发育分析122.4.1古菌多样性分析122.4.2古菌各类群分布分析142.4.3古菌系统发育分析162.5温度梯度凝胶电泳（TGGE）结果163.讨论173.1实验方法的改进173.1.116SrDNA基因扩增体系的优化173.1.2核酸序列分析方法研究古菌多样性的优缺点183.2古菌群落特征分析183.2.1古菌群落垂直分布特征分析183.2.2古菌多样性分析19参考文献20附译文：南海西沙海槽表层沉积物微生物多样性22附译文原文32致谢44i中文摘要摘要[摘要]海底沉积物中蕴含大量的微生物类

3、群，它们是海洋生态系统的重要组成部分。通过对海洋沉积物古菌多样性的研究，有助于人们更深入地了解海洋。本文利用基于16SrDNA的分子生物学技术对东海陆架表层沉积物的古菌进行了研究，结果表明：沉积物中古菌序列分属两个大类：泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota)。以MarineCrenarchaeoticGroupI(MGI，51.1%）和MiscellaneousCrenarchaeoticGroup(MCG，37.2%)为主要类群，其余还有少量MarineBenthicGroupC(MBGC，4.3%)、MarineBenthicGro

4、upA(MBGA，1.1%)和AnaerobicMethanotrophicEuryarchaeota（ANME，1.1%）。通过研究发现东海陆架沉积物蕴含着大量的古菌资源，同时也为进一步研究海洋沉积物古菌多样性奠定基础。[关键词]东海陆架；沉积物；16SrDNA；古菌多样性i中文摘要i英文摘要Abstract[Abstract]Marinesedimentswereestimatedtocontainahugeamountofmicrobe,whichwasofgreatimportancetothemarineecology.Itwouldhelpusexplorethe

5、oceanbytheanalysisofarchaealdiversityinsediments.Weusedmoleculartechnologybasedon16SrDNAtostudythearchaealcommunityofmarinesedimentsfromtheEastChinaSea.Theresultshowedthatallthearchaeawereuncultivableandcouldbedividedintotwogroups,CrenarchaeotaandEuryarchaeota,respectively.Twoarchaeagroups,

6、MarineCrenarchaeoticGroupⅠ(MGI，51.1%)andMiscellaneousCrenarchaeoticGroup(MCG，37.2%),werethedominategroups.TheremainingwereMarineBenthicGroupC(MBGC，4.3%)、MarineBenthicGroupA(MBGA，1.1%)andAnaerobicMethanotrophicEuryarchaeota（ANME，1.1%）.ItrevealedthatthesedimentsoftheEastChinaSeacontainalargea

7、mountofarchaea.Meanwhileitwouldlayafoundationforthedeepresearch.[Keywords]theEastChinaSea;Sediments;16SrDNA;archaealdiversityii引言21引言引言海洋是一个巨大的生态系统，海洋中的各种微生物是构成海洋生态系统的基本元素，而海洋沉积物是海洋历史的见证，在漫长的地质年代里，由河流和大气输入海洋的物质以及人类活动中落入海底的东西，这些物质包括软泥沙、灰尘、动植物的遗骸、宇宙尘埃等[1]。