晶体结构解析步骤

晶体结构解析步骤

ID:42428380

大小:52.50 KB

页数:7页

时间:2019-09-14

晶体结构解析步骤_第1页
晶体结构解析步骤_第2页
晶体结构解析步骤_第3页
晶体结构解析步骤_第4页
晶体结构解析步骤_第5页
资源描述:

《晶体结构解析步骤》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库

1、晶体结构解析步骤StepstoCrystallographicSolution(基于SHELXL97结构解析程序和DOS版SHELXTL画图软件。在DOS下操作)注意:1.每一个晶体数据必须在D:/STRUCT下建立一•了目剥如D:STRUCTAAA),并将最初的数据备份一份于AAA目录下的子目录ORG;2.此处用了STRUCT.BAT批文件,它存在于C:根目录下,内有path=c:ix;c:exe;d:struct;c:windowssystem32(struct为工作目录,exe为SHELXL97程序,nix为S

2、HELXTL画图)3.在了解DOS下操作Z后,可在WIN的WINGX界面下进行结构解析工作,画图可用XP或DIAMOND软件进行。一.准备1.检查是否冇inf、dat和f2(设为sss.⑵文件2.用EDIT或记事木打开dat或inf文件,并于记录本上记录下相关数据(下而所说的记录均指记录于记录本上):®从%crystaldata项中,记下晶胞参数及标准偏差(cell);晶体大小(crystalsize);颜色(crystalcolor);形状(crystalhabit);测量温度(experimenttemperature);㊉从Rm

3、erge项中,记下Rint=?.????%;㊉从totalreflections项中,记下总点数;®从uniquereflections项中,记下独立点数3.双击桌面的DOS图标(或Win2000与WinNT的“命令提示符”)4.键入STRUCT(属于命令,大小写均可。下同)5.进入欲处理的数据所在的文件夹(上面的1~2工作也可在这Z后进行)6.键入XPREPsss.fZ(屏幕显示DOS的选择菜单)7.选择[4],冋车(下记为)8.输入晶胞参数VCF>(建议在一行内将6个参数输入,核対后VcQ)9.-•系列运行(对应的操作动作

4、均为按)之后,输入分子式(如,Cu2SO4N2C4H12e此分子式仅为估计Z用。注意:反应屮所冇元素都应尽可能出现,以避免后续处理的麻烦)10.退出XPREP运行Z前,机器要求输入文件名,此时一定要输入文件名,皑不与初始的文件名同名。另外,不耍输入扩展名。如可输入aaa11.检査是否产生有PRP、PAR和INS文件(PRP文件内有机器対空间群确尢的简要说明)12.更名:RENaaa.f2aaa.hkl13.用EDIT或记事本打开aaa.ins文件,在第二~三行屮,用实际的数据更改晶胞参数及英偏差(注意:当取向改

5、变了,晶胞参数也应随之对应),波长用实际波长。二.解结构14.键入SHELXSaaa或XSaaa,(INS文件屮,TREF为直接法,PATT为PaMersion法)15.XP,(aaa.res为缺省值,若其它文件应是文件名.扩展名,如aaa.ins)2.FMOL,(不要H原子时,为FMOLLESS$H,或FMOL后,KILL$H,)(读取各参数,屏幕上显示各原子的键合情况)3.MPLN/N,(机器认为

6、最好取向)4.PROJ,(随意转动,直至你认为最理想取向)2().PICK,vcr>(认为合理的位置投相应原子,如C原子键入CX,注意序号不能重复;不合理的用vcr>剔除,轩吋不确定用空格键放弃,完成或不再投原了时键入“/“)21.SORT……..(排序)如,SORT$Cu$N$C$H22.FILEaaa,(保存文件)23.EXIT,或QUIT,(退出XP程序)24.打开aaa.ins,删去原子序号之前的HKLF4这一行以及机器自动产生的REM行(借助WINGX界面不会产牛这一问题)25

7、.键入SHELXLaaa(此时的目的是用Fourier峰和差值Fourier峰找其它原了)26.用EDIT或记爭本打开aaa.LST文件(查看Fourier峰的大小,记住峰值大于5e/A3以上的峰如Q1〜Q8;如果前一次处理中有误,可能提示一些信息于文件中,请注意处理,去误存真)27.进行15~23步,投Qn(Fourier峰较大者)28.重复25~27步骤,直到解出完整结构模型(过程中可打开LST文件査看进行怡况)一.结构修正29.用EDIT打开aaa.ins,并完成:㊉删去原了序号之前的HKLF4这--行(修正时,不允许在

8、原了序号前有HKLF4;但HKLFn可放在END的前一行),以及机器白动产生的REM行;®在UNIT行后加入TEMP??(单位己设为。C)—•行;㊉加入SIZE(晶体的三维尺寸????????????,单位已设为mm)—

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文

此文档下载收益归作者所有

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文
温馨提示:
1. 部分包含数学公式或PPT动画的文件,查看预览时可能会显示错乱或异常,文件下载后无此问题,请放心下载。
2. 本文档由用户上传,版权归属用户,天天文库负责整理代发布。如果您对本文档版权有争议请及时联系客服。
3. 下载前请仔细阅读文档内容,确认文档内容符合您的需求后进行下载,若出现内容与标题不符可向本站投诉处理。
4. 下载文档时可能由于网络波动等原因无法下载或下载错误,付费完成后未能成功下载的用户请联系客服处理。