小麦普通腥黑穗病菌分子检测

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1、ICS 65.020.01B16     DB37山东省地方标准DB37/T3630—2019     小麦普通腥黑穗病菌分子检测方法MoleculardetectionmethodsofTilletiafoetida&Tilletiacaries2019-07-23发布2019-08-23实施山东省市场监督管理局   发布DB37/T3630—2019目  次前言II1范围12术语和定义13仪器设备14主要试剂15分子检测15.1小麦种子中小麦普通腥黑穗病菌冬孢子基因组DNA提取15.2菌瘿中冬孢子基因组DNA提取25.3引物序列25.4PCR

2、扩增25.5电泳检测25.6检测结果判断36结果判定37样品保存38档案保存33DB37/T3630—2019前  言本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。本标准由山东省农业农村厅提出并监督实施。本标准由山东省农业标准化技术委员会归口。本标准起草单位:山东省植物保护总站、山东农业大学。本标准主要起草人:于金凤、刘存辉、商明清、孙晓凤、杨勤民、金扬秀、李洪刚、张德满、张莉、谢传峰、徐鲁、成文华。3DB37/T3630—2019小麦普通腥黑穗病菌分子检测方法1 范围本标准规定了小麦普通腥黑穗病菌的分子检测方法。本标准适用于小麦普通腥黑穗病

3、菌的分子检测。2 术语和定义下列术语和定义适用于本文件。2.1 小麦普通腥黑穗病菌 Tilletiafoetida&Tilletiacaries指引起小麦普通腥黑穗病的病原菌统称,包括小麦光腥黑穗病菌(Tilletiafoetida)和小麦网腥黑穗病菌(Tilletiacaries)两种。2.2 小麦普通腥黑穗病菌分子检测 MoleculardetectionofTilletiafoetida&Tilletiacaries指依据小麦光腥黑穗病菌(Tilletiafoetida)和网腥黑穗病菌(Tilletiacaries)的ITS序列,设计特异性

4、引物,经PCR扩增获得特异性片段,依据特异性片段的有无进行判断检测。3 仪器设备摇床、显微镜、普通离心机、电热恒温水浴锅、移液器、超净工作台、PCR仪、电泳仪、凝胶成像系统、锥形瓶、离心管、盖玻片、载玻片、电子天平等。4 主要试剂除特别说明外,本标准所用试剂均为分析纯。CTAB缓冲液、Tris饱和酚、氯仿、异戊醇、异丙醇、乙醇、TE缓冲液、PCR缓冲液、dNTPs、TaqDNA聚合酶、DNAmarker、1×TAE缓冲液、琼脂糖、DNALoading缓冲液、溴化乙锭、3mol/LNaOH溶液、1mol/LHCl溶液等。5 分子检测5.1 小麦种子

5、中小麦普通腥黑穗病菌冬孢子基因组DNA提取5.1.1 称取50g小麦种子放入250mL锥形瓶中,加入100mL无菌去离子水,试验重复3次。5.1.2 摇床200rpm振荡5min后,静置10min。收集洗涤悬浮液于100mL离心管,8000rpm离心10min,弃上清,留沉淀。3DB37/T3630—20191.1.1 加入1.5mL无菌水,充分混匀,转至2mL离心管中,10000rpm离心5min,弃上清。1.1.2 用1mL无菌水冲洗100mL离心管2次,洗涤液一并转移至2mL离心管,10000rpm离心2min,弃上清。1.1.3 加入1m

6、L浓度为3mol/L的NaOH溶液,65℃恒温水浴30min。取出离心管,用1mol/LHCl溶液中和,10000rpm离心2min,吸出上清液,加无菌水冲洗沉淀4次,离心,吸出上清液。1.1.4 向离心管内加入700μL预热至65℃的CTAB缓冲液,65℃水浴1h,每隔15min颠倒混匀1次。1.1.5 待冷却至室温,加入等体积的Tris饱和酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1),充分混匀,抽提2次~3次。1.1.6 10000rpm离心10min,将上清液转移至新的2ml离心管中,加入等体积的氯仿∶异戊醇(24∶1),充分混匀,抽提2次~3次。1

7、.1.7 10000rpm离心10min,吸取上清液至1.5mL离心管中,加入等体积预冷至-20℃的异丙醇,轻轻颠倒混匀,室温放置30min。1.1.8 12000rpm离心15min,弃上清液,留沉淀。1.1.9 加入1mL70%乙醇冲洗管底的沉淀,12000rpm离心5min,弃上清液,重复2次。1.1.10 12000rpm离心30s,去除残余的乙醇。1.1.11 置于超净操作台内干燥约15min。1.1.12 加入30~50μLTE缓冲液溶解DNA。注:也可采用经验证等效的该DNA提取试剂盒,按照试剂盒使用说明书提取。1.2 菌瘿中冬孢子

8、基因组DNA提取取小麦病穗中的菌瘿,用镊子压破,释放并收集里面的冬孢子,转至2mL离心管,采用CTAB法(详见5.1.5~5.1.14)

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