生物信息学总结期末复习资料

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1、《生物信息学》复习要点总结题型：名词解释、选择、判断、计算、问答第一章生物信息学引论1、生物信息学；采用信息科学技术，借助数学、生物学的理论、方法，对各种生物信息（包括核酸、蛋白质等）的收集、加工、储存、分析、解释的一门学科2、生物信息指哪些？广义的说，生物信息生物信息不仅包括基因组信基因组信息，如基因的D7A序列、染色体定位，也包括基也包括基因产物（蛋白质或RNARNA）的结构和功能及各生物种间的进化关系等其他信息资源。3、序列图谱；DNA序列分析技术是一个包括制备DNA片段化及碱基分析、DNA信息翻译的多阶段

2、的过程。通过测序得到基因组的序列图谱4、大规模测序的基本策略；逐个克隆法:对连续克隆系中排定的BAC克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装（公共领域测序计划）针对•图谱的！！•全基因组乌枪法：在一定作图信息基础上，绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序，利用超级计算机进行组装5、功能基因组学；基因组学研究重心已开始从揭示生命的所有遗传信息转移到在分子整体水平对功能的研究上，即功能基因组学6、生物信息学的应用有哪些？基因组分析，基因组测序，拼接，基因的分离，基因组的结构，基因的序列到功能，比较基因组

3、学研究，蛋白质的结构与功能，分子进化研究，新药物设计，基因芯片疾病快速诊断，流行病学研究，人类基因组计划，寄生虫基因组计划：基因芯片7、什么事件大大促进了生物信息学的发展？（HGP）；人类基因组计划人类基因组计划准备用15年时间投入30亿美元，完成人全部24（22+X+Y）条染色体中3.2X109个碱基对的序列测定，主要任务包括做图（遗传图谱物理图谱以及转录图谱的绘制）、测序和基因识别，其根木任务是解读和破译生物体的生老病死以及与疾病相关的遗传信息。8、生物信息学中最重要的贡献是什么（序列比对算法）序刃比对章法

4、方法1、通过点矩阵进行序列比较“矩阵作图法”或“对角线作图”方法2、最长公共子序列问题（Longestcommonsubsequence,LCS）9、数据挖掘（datamining）；又称为数据库中的知识发现，就是从大量数据中获取有效的、新颖的、潜在有用的、最终可理解的模式的非平凡过程，简单的说，数据挖掘就是从大量数据中提取或“挖掘”知识。10、基因组测序完成的主要物种（如人，水稻，大肠杆菌，酵母，拟南芥，果蝇等）；11、基因组；基因组应该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部DNA分子。12、人类基因

5、组计划的主要任务：包括做图（遗传图谱物理图谱以及转录图谱的绘制）、测序和基因识别，其根本任务是解读和破译生物体的生老病死以及与疾病相关的遗传信息。第二章生物信息学的生物学基础1、碱性氨基酸：Asp（天冬氨酸），Glu（谷氨酸）和酸性氨基酸的种类：His（组氨酸），Arg（精氨酸）,Lys（赖氨酸）；2、蛋白质一级结构、二级结构、三级结构的概念；蛋旬畅一级纬级是指多肽链中氨基酸的序列（包括二硫桥的位置）二级结构是指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，也就是该段肽链主要骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧

6、链的构象。包括：a螺旋，B折叠-平行折叠反平行折叠，B转角-连接作用”U”型结构（大多Phe,Gly组成）,无规卷曲-没有确定规律性的肽链构象，但仍是紧密有序的稳定结构，无序结构三级结构:在二级结构基础上的肽链再折叠形成的构象。3、核昔酸序列中N表示什么？RGorA1令YTorCMAorC氨基KGorT酮基SGorC强氢键（3个氢键）WAorT弱氢键（2个氢键）11AorCorT非GBGorTorC非AVGorCorA非T（非U）DGorAorT非cNGorAorTorC任意碱基4、真核生物基因的一般结构？可以编

7、码的序列称为外显子不编码的序列称为内含子；增强子、终止子、启动子【TATA框（TATAbox）］tissueCCAATboxTATAboxspecificeleinents—j51UTRGTAGGTAG31UTRpromoterenlxajtTizerintron1introtl2C^pATGinitiationTAA,TGATAGstopcodon5、转录本；本质是mRNA6、启动子（promoter）；TATA盒7、EST：表达序列标签；一个完整基因的一个部分，在数据库中其长度一般从20到7000bp不等，由

8、于cDNA文库的复杂性和测序的随机性，有时多个EST代表同一基因或基因组，将其归类形成EST簇。8、cDNA具有与某RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA,或此DNA链与具有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链；9、内含子是基因内的间隔序列，不出现在成熟的RNA分子中，在转录后通过加工被切除；10、外显子外显子就是在成熟mRNA屮保留下的部分，也就是说成熟mRNA