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1、实验一全基因组DNA的分离及纯化由于分离线粒休DNA繁琐、耗时、成本相对较高,目前很多研究采用先分的全基因组DNA,再用特异的引物扩增线粒体基因组的方法,因此获得高纯度全基因组DNA显得尤为重要。现在有很多的商品化试剂盒可以快速高效的从血液,组织中提取基因组DNA,简便快捷,DNA的得率和纯度都很高。我们就TaKaRaDNA提取试剂盒为例,介绍外周静脉血全基因组DNA提取的操作流程。目的:掌握试剂盒提取外周血细胞基因组DNA的方法。原理:本试剂盒是用于动物组织、植物材料、全血和培养细胞(Animaltissues/Plants/Blood/Culturedcells)等全基因组DNA
2、的广谱型小量纯化试剂盒。该试剂盒采用独特的细胞裂解系统,由细胞裂解液裂解细胞释放基因组DNA,然后使用特殊的相分离法除去蛋白质、多糖以及脂质等杂质,再结合DNA制备膜技术纯化基因组DNA。本试剂盒具有高效、快速、方使之特点,全套操作约需1小时便可完成。使用本试剂盒町从1〜100mg的动物组织、10〜200mg的植物材料、10〜200皿的全血(含抗凝剂)、10〉〜亦的培养细胞中纯化得到多至数十微克的髙纯度基因组DNA。此基因纟RDNA可用于PCR反应、Southern杂交以及RAPD、AFLP、RFLP等多种分子生物学实验。试剂:该DNA提収试剂盒包括:试剂Set(表4・1)和Colu
3、mnSet(表4・2)。表4・1DNA提取试剂盒试剂试剂Set试剂名称体积RNaseAl(50mg/ml)*165glSolutionA*245mlSolutionB*224mlSolutionC原液*31」mlDBBuffer24mlRinseA28mlRinseB*424mlElutionBuffer12ml注:*1RNaseA1为混浊溶液,使用吋请混匀后使用。*2若出现沉淀,请于65°C加热溶解,待恢复至室温厉使用。*3首次使用前,请将1・1ml的SolutionC原液移入125ml的SolutionC空瓶中,然后加入68.75ml的异丙醇、41.25ml的异丁醇,混合均匀,配
4、制成SolutionC溶液后使用。SolutionC溶液请于4°C保存。*4首次使用前,请添加56ml的100%乙醇,混合均匀。表4・2DNA提取试剂盒ColumnSet试管名称数量FilterCup50支SpinColumn50支CollectionTube(2ml)150支操作步骤:1)①取10〜250卩1的全血(含抗凝剂)加入至CollectionTube中。②加入500(il的SolutionA。③加入1pl的RNaseA1(使用时请混匀),激烈振荡15秒后,冰浴5分钟。2)加入400(11的SolutionB,振荡混合。3)加入1m啲4°C预冷的SolutionC溶液,充分
5、混匀后,12,000rpm离心3分钟。注)SolutionC溶液的制备方法请见笫一页中的说明。4)弃去上层有机相,再加入1ml的4°C预冷的SolutionC溶液,充分混匀后12,000rpm离心3分钟。5)弃去上层冇机相,然后将水相溶液(无色下层)转移至置于CollectionTube上的FilterCup中,12,000rpm离心1分钟。6)弃FilterCup,在滤液中加入400川的DBBuffer,混合均匀。7)将试剂盒屮的SpinColumn安置丁-CollectionTube上。将上述操作6混合溶液转移至SpinColumn中,12,000rpm离心1分钟,弃滤液。8)将
6、500(11的RinseA加入至SpinColumn中,12,000rpm离心1分钟,弃滤液。9)将700卩1的RinseB加入至SpinColumn111,12,000rpm离心1分钟,弃滤液。10)重复操作步骤9。11)将SpinColumn安置于CollectionTube上,12,000rpm离心1分钟。12)将SpinColumn安置丁噺的1.5ml的离心管上,在SpinColumn膜中央处加入50〜200(J的灭菌蒸饰水或ElutionBuffer,室温静置1分钟。13)12,000rpm离心1分钟洗脱DNA。加SolutionA.RNaseA1加SolutionB振蕩加
7、SolutionC下廛(水相)移至FilterCupVZ弃FilterCup向ig液中加入DBBuffer溶液移至SpinColumn相分离(上层显色.下屋透明)SpinColumn移至1・5mlTube加ElutionBuffer基因组DNA«液弃逹液鳥沪洗SE心呗n图4・1试剂盒提取全基因组DNA操作流程图利用该试剂盒可以从200卩1的外周血中提取1.0昭左右较高纯度的全因组DNA(包括核基因组DNA和线粒体基因组DNA)0相对来说,采用试剂盒提取全基