猪肝基因组DNA分离纯化及鉴定

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1、猪肝基因组DNA的分离纯化及鉴定摘要利用十二烷基硫酸钠(SDS)裂解猪肝组织细胞,用氯仿、异戊醇抽提蛋白质以分离核酸,然后用盐溶法分离出DNA,用冷乙醇沉淀,最后分别用紫外分光光度法和二苯胺显色法测定DNA纯度,并比较二者的结果。关键词:DNA纯化鉴定紫外分光光度法二苯胺Separation,purificationandidentificationofgenomicDNAinporklivercellsAbstract:Inourexperimentthelysisofporklivercellsis

2、accomplishedwithsodiumdodecylsulfate(SDS).Andtheproteinisseparatedwithchloroformandisoamylalcoholandthenucleicacidisobtained.ThenDNAisseparatedbyconcentrationofNaCl.Finallytheultravioletspectrophotometryisusedtodeterminethepurity.Keywords:DNA;Purificatio

3、n;Determination;ultravioletspectrophotomentry;Diphenylamine核酸研究的首要方法是分离和测定。核酸制备中需要注意的共同问题是防止核酸的降解和变性,要尽量保持其在生物体内的天然状态。故必须采用温和的条件,防止过酸、过碱、避免剧烈搅拌,尤其重要的是防止核酸酶的作用。天然核酸都具有生物活性,这是检验其质量的重要指标。物理化学指标也常用来评定核酸的品质,这些指标包括:相对分子质量,紫外吸收,沉降系数,电泳迁移率,粘度等。制备方法的不同因材料的不同而有很大差

4、异1。本实验用新鲜猪肝为材料,用盐溶法提取、冷乙醇纯化(沉淀)DNA,并用紫外分光光度法测定其纯度,获得了较好的效果。1材料与方法1.1实验材料1.1.1溶液与试剂新鲜猪肝4g;SC缓冲液:2.94g柠檬酸钠和9.0g氯化钠溶于1L蒸馏水,并用盐酸调至pH=7.0;5%SDS溶液;95%冷乙醇(于冰箱中冷藏后使用);氯仿;异戊醇;DNA标准溶液;二苯胺试剂:1g结晶二苯胺溶于100mL分析纯冰醋酸中,加10mL60%过氯酸,混匀,临用前加1mL1.6%乙醛溶液。1.1.2实验仪器冷冻离心机;烧杯;量筒;

5、玻璃棒;三角烧瓶;离心管;紫外分光光度计。1.2DNA的提取1.2.1实验原理根据RNA与DNA在一定浓度的氯化钠溶液中的溶解度不同进行分离:在0.14M的1氯化钠溶液中,RNA核蛋白溶解度大,而DNA核蛋白溶解度小;相反在1M的氯化钠溶液中,DNA核蛋白的溶解度大,而RNA核蛋白的溶解度小,从而使DNA和RNA核蛋白分开。然后用蛋白质变性沉淀剂去除蛋白,使核酸释放出来,再利用核酸不溶于乙醇的性质将核酸析出,达到分离DNA和RNA的目的。1.2.2实验步骤①取新鲜猪肝4g,用SC溶液洗血,剪碎后加入8m

6、LSC溶液掏碎,装入离心管,4000rpm离心10min;②弃去上清液,下层加入5mlSC溶液混匀,同上离心;③弃去上清液,下层沉淀转入三角瓶,加入20mlSC溶液,3mLSDS溶液混匀,加15mL氯仿/异戊醇混匀,然后边加1.2g固体氯化钠边混,充分振荡30min;④4000rpm离心20min后,小心取出离心管,观察到有三层,取上层水相;⑤加入等体积氯仿/异戊醇,振荡10min后4000rpm离心20min;⑥取上清液,加等体积95%冷乙醇,边加边用玻璃棒沿一个方向搅拌,玻璃棒上会缠绕DNA,用少量

7、无水乙醇洗一次,沥干,加1mLSC溶液溶解后放入小离心管,于4℃冰箱待用。1.3DNA含量测定(紫外分光光度法)1.3.1实验原理核酸、核苷酸及其衍生物都具有共轭双键系统,能吸收紫外光,而由于各组分结构上的差异,其紫外吸收有一定的区别。通常选用260nm的紫外波长来测定核酸或核苷酸。浓度为1μg/mlDNA的天然DNA水溶液在260nm处的吸光度为0.020,也就是说在测得A260=1时,DNA的浓度c=50μg/ml;而RNA测得A260=1时,RNA的浓度c=40μg/ml。核酸的纯度可以通过测A2

8、60/A280来确定:纯DNA的A260/A280=1.8;纯RNA的A260/A280=2.0。如果DNA的A260/A280小于1.8,说明有蛋白质污染;如果DNA的A260/A280大于1.8,说明有RNA污染。1.3.2实验步骤①1mlSC溶液溶解DNA,8000rpm离心5分钟后,将上清转移到5ml离心管中,用1ml0.01MNaOH溶液加入沉淀中,使其充分溶解,并再次离心5分钟,上清与第一次溶解液合并备用;②A260测定:以SC

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