药物代谢组学研究进展

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1、学报JournalofChinaPharmaceuticalUniversity2013,44(2):105-112105药物代谢组学研究进展11,2*341,2**黄寅,许风国,张伟,王俊南,张尊建12(中国药科大学药物质量与安全预警教育部重点实验室;天然药物活性组分与药效国家重点实验室,南京210009;34澳门科技大学中药质量研究国家重点实验室,澳门;新加坡国立大学公共卫生学院,新加坡117597)摘要药物代谢组学是在系统生物学背景下,代谢组学与药学紧密交叉、有机结合促生的一门新兴学科。它依托现代分

2、析技术、化学计量学和生物信息学技术,通过分析比较给药前后生物体液中小分子代谢物轮廓的改变来进行药物疗效和毒性的评价、预测。本文对药物代谢组学的研究流程和应用等方面的最新进展进行了系统概括,并对相关技术要点和存在的问题进行了讨论。关键词药物代谢组学;系统生物学;代谢通路;生物标记物中图分类号R242文献标志码A文章编号1000-5048(2013)02-0105-08Progressforpharmacometabolomicsanditsapplications11,2*341,2**HUANGYin,X

3、UFengguo,ZHANGWei,ONGChoonnam,ZHANGZunjian12MOEKeyLaboratoryofDrugQualityControlandPharmacovigilance;StateKeyLaboratoryofNaturalMedicine,ChinaPharmaceu-3ticalUniversity,Nanjing210009,China;StateKeyLaboratoryofTCMQualityResearch,MacauUniversityofScienceand

4、Technology,4Macau;SchoolofPublicHealth,NationalUniversityofSingapore,Singapore117597AbstractPharmacometabolomics,stemmingfrommetabolomics,isoneofthemostrecentlyemerged-omicssciences.Itcanbeappliedtomonitordrug-relatedalternationinmetabolicpathwaysandpre

5、dictthetherapeuticoutcomebycomparingthepre-andpost-treatmentmetaboliteprofilesundertheassistanceofmoderninstrumentalanalysis,chemometricsandbioinformatics.Thisreviewsummarizedtherecentprogressinpharmacometabolomicsanditsapplications.Thecriticaltechnicalpo

6、intsandpitfallsinvolvedinpharmacometabolomicpipelinewerealsodiscussed.Keywordspharmacometabolomics;systembiology;metabolicpathway;biomarkerThisstudywassupportedbyNationalNaturalScienceFoundationofChina(No.81274108);OpenProjectProgramofStateKeyLaboratoryof

7、NaturalMedicines,ChinaPharmaceuticalUniversity(No.SKLNMKF201220);JiangsuSpeciallyAppointedProfessorProgram(2012-2)代谢组学(metabolomics/metabonomics)是20世纪90体小分子物质即代谢组(metabolome)为研究对象,这些内年代末期迅速发展起来的一门新兴组学(-omics)学科,是源性小分子代谢物处于生物信息流的末端,它们的整体轮系统生物学(systembiolog

8、y)研究的重要组成部分,它主要廓包含着基因组(genome)、转录组(transcriptome)、蛋白质通过组群指标分析,定量研究生物体在内、外因素(如遗传组(proteome)变化及相互间协调作用的终极信息,能直接变异、疾病侵袭、药物干预、环境变化等)作用下,所含内源反映生物体的表型(phenotype)特征。性小分子代谢物(一般指MW<1000)种类、数量变化的动代谢组学是在问题导向和应用驱动下,现代分析技术[1-2]态

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