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时间:2019-08-23
《看图学软件之DNAStar-MegAlign入门篇》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、MegAlign提供6列队(alignment)方法,进行DNA和蛋白质序列的配对和多序列比较(multiplealignment)。多序列比较(multiplealignment)可以在MegAlign的worktable进行查看和编辑。可以根据队列(alignment)的结果制作进化树(Phylogenetictrees),并且,有关序列距离的数据和残基替代可以容易地作成表格。一般多序列比较(multiplealignment)的结果展示于队列(alignment)窗口,相似性和差异用彩色的直方图展示。打开方法与editseq一样,
2、只不过点选megalign图标,然后进入其界面选择File-EnterSequences首先进行2个序列比对,选中所需序列1和2,点击add,使从左侧添加到右边的框中,单击Done出现如图所示界面,选中1与2(可按control点选),之后选择Align-OnePair-ByWilbur-Lipmanmethod出现如图所示界面,即为blast结果,但画面不美观,可对其进行调整,点击鼠标所处位置按钮出现此对话框,里面可进行一系列设置,可根据自己喜好进行,使界面更美观形象设置后可看到错配碱基,如下,还是比较直观吧比对之后可对其进行结果查看
3、,点选View-Alignmentreport即可结果如图对于多序列的比对,添加序列与一对序列一样,不过选择的Align-Clustal或者JotunHein命令如点选JotunHein后,出现如图界面,图中红线部分代表同源序列(偷懒了,2个序列添加了2次变成4条之后点选View-PhylogeneticTree进行系统树分析出现如下结果,因我用序列太少,体现不出很好效果,欢迎大家自己尝试
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