资源描述：
《束永前ngs肺癌临床应用束永前》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、1NGS在肺癌精准医疗中的应用江苏省人民医院--束永前高通量测序技术的发展及研究报道高通量测序技术在肿瘤临床的应用1目录 TableofContents3DNA测序技术的演化和爆发性增长DNASequencingTechnologyhasGrownRapidlyandExponentially4一代二代三代SequencingGetsCheaperandFaster单人全基因组测序成本（美金）：HGP:$3Billion2004:$30,000,0002008:$100,0002010:$10,0002011:$4,0002014:$1,000??
2、?:$100测序成本迅速下降，超过了摩尔定律CostisDecreasingExponentially,BeatingMoore’sLaw562013年NEJM发表的临床文献，43%运用高通量技术目前高通量测序大量应用于国内外临床癌症研究21世纪的癌症分型需要病理和分子联合进行–ASCO2014,Chicago,Dr.MStratton(英国首相医学顾问）7在不同病理类型中，肺癌驱动基因突变谱存在明显的差异NSCLC腺癌基因突变谱：亚洲研究与欧美人群不同，EGFR依然是亚裔腺癌最常见的驱动基因KohY,etal.2013ASCOAbstract75
3、72.WuYL,etal.2011.140例日本肺腺癌370例中国肺腺癌BRAFM+2%PI3KM+4%C-METAmp5$PTENM+6%EML4-ALK7%KRAS7%EGFRM+40%未知29%KRAS17.6%EGFR43%PIK3CA14.1%MLH14.9%STK116.3%CTNNB15.6%GNAS0.7%PTPN110.7%VHL11.4%SMAD41.4%早期肺腺癌中EGFR突变率和晚期相似ZhangX,etal.2013ASCOAbstract1547.YangPC,etal.2012ASCOAbstract1534.2013
4、ASCO早期NSCLCICANEGFR突变状态(%)2012ASCO晚期NSCLCPIONEEREGFR突变状态(%)8023：NTRK1基因融合作为肺癌新的癌基因靶点结论在肺腺癌中通过NGS/FISH发现了一种新的癌基因NTRK1融合需要开展更多研究以明确NTRK1融合在肺癌中的发生率和特征该研究提示需要在NTRK1融合阳性患者中开展前瞻性Trk抑制剂的临床研究35例泛阴性(EGFR,KRAS,ALK,ROS1)肺腺癌样本新的Break-ApartFISH检测第2代测序技术(CLIA认证实验室)对表现为新NTRK1基因融合的细胞进行转录及药理抑制
5、分析56例泛阴性(EGFR,KRAS,ALK,ROS1,RET)肺腺癌样本DoebeleRC,etal.2013ASCOAbstract8023.3/91(3.3%)肺鳞癌驱动基因突变研究71肺鳞癌病人标本NGS和定量PCR检测突变和基因扩增基因名称突变频率TP5359.2%PI3KCA19.7%FGFR21.4%HRAS2.8%APC1.4%KRAS1.4%MET1.4%EGFR4.2%AKT11.4%PTEN1.4%SMAD41.4%KIF5B-RET1.4%FGFR31.4%基因名称变异类型频率CDKN2A缺失/突变/甲基化72%PI3KCA
6、突变16%PTEN突变/缺失15%FGFR1扩增15%EGFR扩增9%PDGFRA扩增/突变9%CCND1扩增8%DDR2突变4%BRAF突变4%ERBB2扩增4%FGFR2突变3%KohY,etal.2013ASCOAbstract7572.GovindanR,etal.2012ASCOAbstract7006.2013ASCO178例肺鳞癌标本127例（75%）患者确认潜在治疗靶点检测基因拷贝数，外显子突变，mRNA表达和启动子甲基化2012ASCO40.9%的鳞癌患者存在联合基因突变，表明了鳞癌患者基因型的复杂性12NSCLC中FGFR1基因
7、拷贝数增加475例已行手术切除的I-III期NSCLC多因素分析，在校正吸烟、性别和肿瘤大小后，伴FGFR1基因扩增的I/II期肺鳞癌患者的OS显著长于FGFR1未扩增的患者（HR=0.26;95%CI:0.08-0.84,P=0.02）18%的脑转移出现FGFR1拷贝数增加，而相应原发部位无增加TangXM,etal,etal.2013ASCOAbstract7552.FISH&IHC检测FGFR1基因扩增13手术切除的肺鳞癌患者中FGFR1扩增对预后的影响63例经组织病理学证实、临床已切除肺鳞癌评估FGFR1状态与临床特征#和DFS*之间的关系
8、FGFR1扩增定义为FGFR1拷贝数≥2.2xCEP8拷贝数结果：FGFR1扩增与年龄(p>0.99)、性别(p>0.99
