《质粒DNA提取鉴定》PPT课件

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1、质粒DNA提取、鉴定暨大医学院生化教研室质粒(plasmid)存在于细菌染色体外的小型环状双链DNA分子,可在宿主细胞中自主复制,并在细胞分裂时传给子代。与染色体DNA相比,质粒结构简单,分子大小不等。小的不到1.0×106道尔顿,大的则超过200×106道尔顿。质粒含有某些染色体所没有的基因,编码某些功能蛋白质(表达某种遗传性状,如抗药性(抗氨卞青霉素、抗四环素等),耐受重金属,产生细菌素等等)。即很多质粒往往都赋予其宿主细胞一定的表型。质粒分类:严紧型(每个细胞1-5个质粒)质粒的复制与宿主染色体复制同步进行,因

2、而一个宿主细胞中只有一个或几个质粒拷贝。当宿主蛋白合成被抑制,染色体复制停止,质粒的复制也停止;松弛型(每个细胞10-200个质粒)质粒的复制受“松弛型控制”。当宿主蛋白质合成受抑制(如加入氯霉素),染色体复制停止时,质粒仍可大量复制。此时,一个宿主细胞中质粒数目可多至数千个拷贝。具备基因工程质粒载体的条件:①多克隆位点(multiplecloningsite,MCS),一段短的序列上有多种限制性内切酶切口,每种只有一个切口。②选择性标记,如抗药性。③本身分子量不宜过大,有一定容量。④有一定的抄本数(copynumb

3、er)——每个宿主菌可能容纳的最多质粒数。pBR322质粒(4.36kp),最早应用于基因工程的载体,现在仍在广泛应用。•序列已全部清楚•数十个内切酶位点•2个抗药基因pBR322质粒(4363bp):主要包括:①限制性内切酶位点(插入外源基因);②含有terr、ampr抗药基因,可作为筛选标志。③含有复制起始点ori(赋予其复制特性)。pBR322共有24种限制性内切酶的单一的识别位点,其中7种酶(EcoRV,NheI,BamHI,SphI,SalI,XmaIII,NruI)的识别位点位于四环素抗性基因内部,2种酶

4、(ClaI,HindIII)的识别位点存在于这个基因的启动子内部。所以在这9个限制性内切酶位点上插入外源DNA通常都会导致四环素基因(tetr)的失活。3种酶(ScaI,PvuI,PstI)在氨卞青霉素抗性基因(ampr)内具单一的识别位点,在这个位点插入外源DNA则会导致ampr基因的失活。pUC18/19pUC载体系列是由大肠杆菌pBR322质粒与M13噬菌体改建而成的双链DNA质粒载体。即是将组建M13mp系列载体所用的LacZ片段插入到pBR322的一种缺失变种之中。E.coli的LacZ的N端146个AA残

5、基的编码基因,编码产物为β半乳糖苷酶的α片段。Lac-E.coli(突变型宿主细胞):可表达该酶的ω片段.单独存在的α或ω片段均无活性,只有宿主细胞与克隆载体同时共表达两片段,宿主细胞才有β半乳糖苷酶活性,使特异底物产生蓝色化合物(α-互补)。α互补的检测α片段ω片段α片段ω片段pUC18/19含有来自pBR322质粒复制起始点(ori),氨卞青霉素抗性基因(ampr)以及大肠杆菌β半乳糖苷酶基因(LacZ)的启动子及其编码α肽链的DNA序列,并且在LacZ基因中有一段多克隆位点(MCS)区段。另外与pBR322相比

6、,pUC质粒载体具有更小的相对分子量。而且无控制质粒复制的rop基因,使得其拷贝数大增。每个细胞可达500-700个拷贝。因此,由pUC质粒重组体转化的大肠杆菌细胞,可获得高产量的克隆DNA分子。pUC18/pUC19区别在多克隆位点以互为相反的方向排列,余相同。当外源的DNA片段插入到多克隆位点时,使α互补链破坏形成的是无活性的β半乳糖苷酶,于是被转化的大肠杆菌细胞,就在Xgal-IPTG培养基上形成白色菌落,而相反没有外源DNA插入的质粒转化大肠杆菌细胞,在Xgal-IPTG培养基上形成蓝色菌落。本次实验用pEC

7、-CTpEC-CT在pcDNA3基础上构建pEC-ct质粒:8.0kb有HindⅢ,BamHⅠ酶切点,可切出CD基因(1.2kb)质粒DNA提取和纯化步骤:培养细菌收集和裂解细菌纯化质粒DNA细菌的培养细菌培养从-20℃取出储存菌液,斜面划线接种于培养板。2.单克隆培养:挑取单个菌落,接种到培养瓶中,37℃培养24h。3.扩大培养:培养液3ml,接种于60mL的LB培养液(含Amp50μg/ml),振摇200rpm,37℃(4-6h),使A580=0.4-0.6。4.加氯霉素:加氯霉素,终浓度40μg/ml,继续培养

8、15-17h.本次实验用碱裂解法提取DNA包括:1.菌体收集2.菌体裂解、质粒DNA提取、纯化3.鉴定2人一组原理:碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不复性而呈

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