PCR产物的胶回收分离纯化

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时间:2019-07-04

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1、PCR产物的胶回收分离纯化一、实验仪器1、琼脂糖凝胶电泳系统2、紫外观察分析仪3、离心机4、单面刀片5、恒温水浴锅二、试剂1、DNA回收试剂盒2、50×TAE3、ddH2O三、步骤1在紫外灯下切分含DNA的琼脂糖块,尽可能除去多余的琼脂糖.放入1.5ml离心管中。4.称量胶块重量,计算胶块体积。计算胶块体积时,以1mg=1μl进行计算。5.向胶块中加入胶块融化液DR-IBuffer,DR-IBuffer的加量如下表:凝胶浓度DR-IBuffer使用量1.0%3个凝胶体积量1.0%~1.5%4个凝胶体积量1.5%~2.0%5个凝胶体积量6.均匀混合后75℃加热融化

2、胶块(低熔点琼脂糖凝胶只需在45℃加热)。此时应间断振荡混合,使胶块充分融化(约6~10分钟)。注)胶块一定要充分融化,否则将会严重影响DNA的回收率。7.向上述胶块融化液中加入DR-IBuffer量的1/2体积量的DR-IIBuffer,均匀混合。当分离小于400bp的DNA片段时,应在此溶液中再加入终浓度为20%的异丙醇。8.将试剂盒中的SpinColumn安置于CollectionTube上。9.将上述操作7的溶液转移至SpinColumn中,12,000rpm离心1分钟,弃滤液。注)如将滤液再加入SpinColumn中离心一次,可以提高DNA的回收率。1

3、0.将500μl的漂洗液RinseA加入SpinColumn中,12,000rpm离心30秒钟,弃滤液。11.将700μl的RinseB加入SpinColumn中,12,000rpm离心30秒钟,弃滤液。注)请确认RinseB中已经加入了指定体积的100%乙醇。12.重复操作步骤11。13.将SpinColumn安置于新的1.5ml的离心管上,在SpinColumn膜的中央处加入25μl的灭菌蒸馏水或ElutionBuffer,室温静置1分钟。注)把灭菌蒸馏水或ElutionBuffer加热至60℃使用时有利于提高洗脱效率。14.12,000rpm离心1分钟洗脱

4、DNA。将1.5ml离心管(DNA)贮存于-20℃。15琼脂糖凝胶电泳检测回收产物。制备:溶胶液:6MNaClO4(pH5.2),0.03MNaAC(pH5.2)溴酚红少许洗液:50mMTris-cl,0.1mMEDTA,pH8.0)70%乙醇存储液:TEbuffer(10mMTris-cl,0.1mMEDTA,pH8.0).注意事项1.电泳的buffer和gel都是新制的,切胶的台子清理干净,刀片最好洗净灭菌,总之一句话就是保证切下的带没有外源dna污染。2.切胶是要把整个目的片断所在位置的胶全部回收。为了减少胶的体积,可以用相对比较薄的胶来做,只要够点样即可

5、,也可采用薄而宽的梳子来跑胶。3.关于防护,在一般有机玻璃后就足够了,戴上防护面具以保护眼睛,如果戴树脂眼镜就可以了。要是非常害怕紫外照射,或者对于胶有特殊要求,例如要求不含EB,可以采用点marker和带刻度的尺子一起照相的方法来确定目的条带在胶上的位置进行切胶。4.按照正常程序点marker跑胶,然后切下有marker的胶,EB染色,紫外灯下与带刻度的尺子一起照相。由于要回收的带与marker间的相对位置已知,根据尺子来衡量未染色胶上目的带的位置即可。如果觉得很难判断,可以直接在marker边点少量的样,这样位置就容易确定了。

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