细胞遗传学93371

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1、细胞遗传学课程作业(外文翻译)细胞遗传学课程作业(外文翻译)孟富宣2011011170042011级研究生(2)班教师:何承忠教授二〇一一年十二月十九日7细胞遗传学课程作业(外文翻译)适应性和物种形成:Fst能告诉我们吗?总结遗传变异性的一种有用方式是通过评估不同的群体的近亲系数,最近几项研究也试图利用分布的Fst评估从个别基因位点检测自然选择的效应。然而,由于普遍的教条是高度依赖人类的历史,因此这个希望尚未完全实现。在这里,我回顾近来的理论结果表明Fst评估的分布通常预料到的是粗鲁无常的人类历史。我的建议是,在浮置板轨道的基础上进行分析为识别可能选择的候选基因提供了

2、有效的第一步,并探索如何把这一信息应用于生态与演化的研究上。引言现在Fst变得越来越实惠和快速,它从遗传学模型和非模型有机体的角度去调查样本,在它们的基因组有大量的基因座。一项发展很大程度上是源于生物群落的活动区。在这里,我重新评估旧观点来分析这些数据,首先提出了在多位点调查都很缺乏且难以获得;后来不可信的和被遗弃的。那么现在,这些丰富的数据的支持,偶尔抱歉的偷窥一下研究论文,充斥着各种质疑。不同类别的获得性的基因频率信息仍然参与自然选择并开发出各种各样的方法,试图用于推断选择的状态和模式。三个能被认同主要途径是:(1)详细的个体基因座和序列的选择模型;(2)在这里讨

3、论的Lewontin-Krakauer方法(见术语)是多基因座比较的最古老的方法;(3)替代模式中比较同义突变和非同义突变的位点。Nielsen(尼尔森)详细分析了各种方法的优点和不足之处。许多研究,推动了生物医学领域旨在阐明和特性化生化功能及表型效应的自然变化贯穿人类基因组,它们常常基于对比分析。基础医学关于功效的判断有不同的方法往往暗含首要目标。相比之下,在进化生物学上,几个有趣的假说,可以测试通过描述的数量、位置和适应性效果,适应趋异显示在在等位基因频率上,而不需要深入研究生理的细节。对于大多数的生物。我认为,最简单的实现目标的方法是用Lewontin-Krak

4、auer的方法,至少它出现在最近的版本,它可以普遍体现强健的人口历史的奇特。我引用最近理论结果,它暗示为什么事实并非如此令人惊讶,并且讨论可能的取样策略及其可以获得最大的能量的方法。我也把它应用到大纲图涵盖地区,特别是在对基因流和物种形成的模式的适应趋异学习。近亲系数和基因位点的识别受选择的限制选择的研究,特别是本地适应性,在基因层面上有着悠久的历史。例子包括学习当地的隐花草属对捕食鸟的反应,蜗牛Cepaeanemoralis和白桦尺蠖Bistonbetularia。在上世纪90年代和80年代之间适应性遗传学在很大程度上黯然失色,有兴趣通过对遗传变异的分析可能恢复群体

5、历史人口统计学,特别是线粒体DNA序列的变化,这是一个没有选择要求项目。专业术语:AFLP:扩增片段长度多态性。7细胞遗传学课程作业(外文翻译)一种核苷酸位置多态性的分析方法、通常结果是在一个主导标记系统里。一个经济实惠且能获得许多标记的方法。Ascertainmentbias:偏差在人口统计推论中由于运用(典型的)低突变率标记,如单点核苷酸多态性,他们曾在以前确定早期较小规模的研究。这样的发现将会形成一个单点核苷酸多型性偏差子集,在人口从第一次调查中的等位基因频率(否则他们也不会在第一位被发现)。Balancingselection:在等位基因频率选择倾向于一些维持

6、多态性的平衡。Inbreedingcoefficient:两个基因位点有一个相同亲本的概率。典型指的是两个基因在一个个体里,但目前的应用越来越广泛,就像这里一样。Lewontin–Krakauermethod:一种采用方差估计的方法,Fst确定是否存在非中性位点在等位基因频率的样品且在几个不同的种群中进行了调查。Multinomial-Dirichletformula:Multinomial-Dirichlet分布从一个狄利克雷分布多项式的样品给出了分布频率。狄利克雷分布是一个多元综合的β分布,这对造型比例有用。RFLP:限制性片段长度多态性。一个分析核苷酸位置多态性

7、的方法,使用PCR前这是一个重要的方法。Separation-of-timescales:简化的描述的一个复杂的系统过程,从那些发生缓慢的中分离出快速发生的。在任何时候,快速过程被认为是在它们的平衡价值观,然而缓慢的过程可以产生出这些功能的平衡价值观。SNP:单核苷酸多态性;通常从早期的,小规模的研究可以知道DNA多态性位点。Transientmodel:一个随着时间变化而很有兴趣的模型,而不是一个平衡模型。Lewontin和Krakauer回应了日益激烈的中立自然选择论者的争议,刺激Cavalli-Sforza早期的建议,提出了检测识别位点从属于选

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