《ubMed检索》PPT课件

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1、NCBI网站介绍www.ncbi.nlm.nih.govNationalCenterfor BiotechnologyInformation NCBI网站简介1988年,美国的参议员ClaudePepper发起1988年11月4日通过立法建立国立生物技术信息中心NCBI的任务:建立基于计算机的信息处理的关于分子生物学,生物化学,和遗传学知识的存储和分析的自动系统。并进行先进方法的研究。促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。促进全世界范围内的生物技术信息收集的合作NCBI生物信息整合系统Entrez用途Pu

2、bMed书目文献数据获取GenBank,EMBL等数据库的核酸序列;获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列;从核酸序列翻译到蛋白质的序列;蛋白质三维结构数据及大分子模式(MMDB)等其他生物信息数据库检索获取基因组图谱信息因特网上检索免费MEDLINE一.历史与背景INDEXMEDCUSMEDLARSONLINEMEDLINECDMEDLINEWEBMDLINEWeb(Free)检索特点:MEDLINEWeb(FREE)PubMed(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMe

3、d)BioMedNetEvaluatedMedline(http://www.bmn.com)HealthgateMedline(http://www.healthgate.com)PubMed数据类型:期刊论文、综述、以及与其他数据资源链接。特点:1.免费提供题录和文摘 2.可与提供原文的网址链接 (部分免费获取)3.提供检索词自动转换匹配 4.操作简便、快捷数据收录MEDLINE4300余种生物医学期刊,内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科。这些期刊来源于美国和世界上70多个国家和地区。文献

4、量达1千1百万条记录,并回溯到1966年。[indexedforMEDLIEN]Inprocesscitation提供MEDLINE尚未经规范处理的数据。获MeSH词后,再加入MEDLINE。记录中[inprocess]的标记。PublisherSuppliedCitations出版商直接向PubMed提供电子记录包括MEDLINE未收录的部分记录PubMed与MEDLINE的区别收录范围广:MEDLINE收录的部分生命科学相关文章的非医学专业期刊(物理、天文、化学等)收录记录新:在MEDLINE数据标引前的最新题录文献

5、类型全:提供电子原文链接(部分免费)在检索栏中输入:一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索)如:placentagrowthoxygengenbacevo著者姓名,姓在前,名在后,如:smithab刊名,可输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式如:clinexpimmunol布尔逻辑运算式:(运算符须大写)如:Stem[ti]ANDneuroscience二.PubMed基本检索功能自动转换检索词(automatictermmapping)自动对照规范词表,期刊名表,短语,著者名索引,依次寻找转换短语寻找转换单词转

6、换单词在上述四个字段寻找转换在所有字段中转换如:输入stem[ti]ANDneuroscienceDetails显示:(stem[ti]AND("neurosciences"[MeSHTerms]ORneuroscience[TextWord]))截词检索:treat*强迫短语检索:“brca1”(不再自动转换匹配和扩展检索)自动扩展检索系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索,如:输入“hypertensiontherapy,系统自动将高血压的药物治疗、饮食疗法,三.PubMed的辅助检索功能Limits(检索限制选择)

7、字段限制:著者、刊名、篇名、滤过(filter原文收藏处)等数据输入时间:默认检索可回溯到1966年,限制选择30天-10年7种文献类型限制:7种语种:12种子文档:(01年新增2种SpaceLifeSciencesandBioethics)Previw/index(检索策略预览)浏览检索式改变检索式(可用检索式编号#1OR#2)浏览索引(index)Index(索引字顺表)选择限制字段输入检索词(词根)在字顺表中选择检索词选用逻辑算符建立检索式点击GOHistory检索式回顾编辑检索式如#3ANDchildDetail

8、s显示检索词转换匹配运算详细过程用途:转换、确定规范词如:livercancerliverneoplasms修改检索策略修改检索策略1.检索框中随时修改2.“Limit”、“Preview/index”、“History”“Details”功能键实现。四.检索结果输出显示检索结果保存检索结果保存检索策略打印检索结果显

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