《ubMed检索系统》PPT课件

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1、PubMed检索系统PubMed是美国国立医学图书馆（NLM）所属国家生物技术信息中心（NCBI）开发的一个基于Web的生物医学文献检索系统，是NCBI检索体系Entrez的一个组成部分。1997年，NCBI在Entrez集成检索系统上开发了基于互联网，并以MEDLINE数据库为核心内容的PubMed检索系统，并免费向全世界开放。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Pubmed一、PubMed收录范围PubMed收录的期刊约2万种，其中MEDLINE收录了包括全世界80多个国家5200多种

2、生物医学期刊的1900多万条文献记录（每周都在增长中），绝大部分可回溯到1948年，部分早期文献可回溯至1865年。PubMed的部分文献可直接获取全文，包括PubMedCentral（PMC，收录期刊780余种）的文献，OA（OpenAccess）期刊的文献，以及部分出版商提供的免费期刊文献等2000余种。PubMed每条记录都有唯一的识别号PMID（PubMedUniqueIdentifier）。这些记录主要有四种形式：一、PubMed收录范围1MEDLINE是PubMed的主体，文献记录均使用美国国立医

3、学图书馆的《医学主题词表》（MeSH）进行主题标引。2In-ProcessCitations为加快报道速度，PubMed将尚未标引MeSH主题词、文献类型的最新文献记录先存入临时库中，完成加工处理后再转入MEDLINE。3PublisherSuppliedCitations是由出版商直接提供的电子版文献。由于MEDLINE不收录非生物医学文献，出版商提供的非生物医学期刊记录的文献就停留在PubMed临时库中。4OldMEDLINE收录部分1966年以前出版且未被MEDLINE收录的文献记录。PubMed主页二

4、、PubMed主页简介二、PubMed主页简介主页分检索区、主要功能区及辅助功能区三部分。检索区：基本检索、高级检索和帮助。主要功能区：使用介绍、PubMed工具及更多资源。辅助功能区：指南、其他数据库、常用数据库、特色数据库及相关信息二、PubMed主页简介三、PubMed主要特点㈠自动词语匹配（AutomaticTermMapping）在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行自动词语匹配后再检索。右下角Searchdetails可查看检索词转换情况。1主题

5、词转换词表（MeSHTranslationTable）包括ＭeSH主题词、副主题词、款目词、一体化医学语言系统（UMLS）。例：commoncold“commoncold”[ＭeSHTerms]OR（“common”[AllFields]AND“cold”[AllFields]）OR“commoncold”[AllFields]三、PubMed主要特点2期刊转换词表（JournalTranslationTable）收录刊名全称、MEDLINE刊名缩写以及国际标准刊号（ISSN）三种不同表达形式。例：newen

6、glandjournalofmedicine“NEnglJMed”[Journal]OR“newenglandjournalofmedicine”[AllFields]3短语词表（PhraseList）如果在上述两个词表中未找到匹配的词，系统则求助于短语词表。由MeSH、一体化医学语言系统、化学物质名称、篇名和文摘中出现多次的短语组成。三、PubMed主要特点4著者索引（AuthorIndex）当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，并且有1或2个字母在词后时，PubMed就会到著者索引中查找。若在上述四个表或

7、索引中仍未找到相匹配的词，PubMed就将短语分开，用AND将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找，直到找到相应的词为止。例：pressurepoint（“pressure”[MeSHTerms]OR“pressure”[AllFields]）ANDpoint[AllFields]三、PubMed主要特点㈡截词检索用截词符“*”表示。截词检索只限于单词，对词组无效。例如：flavor*flavored，flavorful，flavoring等㈢短语检索又称强制检索，即对检索词加上双引号（“”），把检索词作为

8、一个整体检索，关闭自动词语匹配功能。例：“singlecell”三、PubMed主要特点㈣布尔逻辑检索布尔逻辑运算符必须大写ANDORNOT优先级为：（）＞NOT＞AND＞OR三、PubMed主要特点三、PubMed主要特点㈤限定检索PubMed在首次检索的基础上，可以根据检索需求实现二次检索界面的限定检索：包括文本呈现方式（摘要、免费全文、全文）、出版日期、物种（人或其他动物）、文献类型（临床实验