基因芯片技术在检测肠道致病菌方面的应用_2-3

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1、基因芯片技术在检测肠道致病菌方面的应用摘要:当前,基因芯片技术被广泛的应用于各种研究领域,如基因突变及多态性分析、细菌基因鉴定、致病分子机理、表达谱分析、DNA测序等多个方面。文中通过毒力因子的检测、通用引物结合基因芯片来检测肠道致病菌。随着基因芯片技术的发展,也会伴随着各种问题的产生,只有不断地发现问题,解决问题,改进基因芯片检测技术,才能不断的完善基因芯片检测技术。随着检测的目的的致病菌的种类的不断的增加、基因芯片技术检测方法不断创新,使得基因芯片检测技术不断的成熟和完善。关键词:基因芯片肠道致病菌检测Genechiptechnology

2、inthedetectionofintestinalpathogenicbacteriaABSTRACT:Atpresent,thegenechiptechnologyiswidelyappliedinvariousresearchfields,suchasgenemutationandpolymorphismanalysis,identification,pathogenicmolecularmechanismofbacterialgenes,expressionprofileanalysis,DNAsequencing,andothera

3、spects.Bydetectingthevirulencefactors,generalprimercombinationofgenechiptodetecttheintestinalpathogenicbacteria.Withthedevelopmentofgenechiptechnology,willbeaccompaniedbytheproductionofallkindsofproblems,onlybyconstantlytofindproblems,solvetheproblem,improvegenechipdetectio

4、ntechnology,toconstantlyimprovethegenechipdetectiontechnology.Withtypeofdetectionofpathogenicbacteriaofthepurposeofcontinuouslyincrease,genechiptechnologytodetectmethod,continuousinnovation,makinggenechipdetectiontechnologycontinuestomatureandperfect.Keywords:Genechip;Intes

5、tinalpathogens;Detection当前在食物生产全球化的大背景下,由于人们饮食习惯的改变以及世界的环境卫生状况越来越差,食品的安全性降低,引发了全世界人们的关注。由于食品安全性的降低,诱发了肠道致病菌的感染。因此,随着人们关注食品安全程度的越来越高,自然的关注到了肠道致病菌的感染。当前,世界上有很多的国家都非常注重这个问题,并采取了相应的措施。当前,切断导致病菌的传染途径,改善人们的生活条件和饮食条件已经成了刻不容缓的问题。本文所论述的正是基因芯片检测技术在肠道致病菌检测方面的应用。一、基因芯片技术简介20世纪80年代,基因芯片

6、技术诞生。它利用了生物化学、分子生物学等多个学科的现代技术,实现了样品监测分析过程中的连续化、集成化和微型化。Ye等学者详细的介绍了基因芯片技术在微生物方面的应用。基因芯片是指反向斑点杂交,特异探针以一定得方式固定在某种介质上,扫描时以点出现,每一个点代表一种特异性探针序列。这种技术可以检测多种片段,比如:基因组DNA、总RNA、aRNA、质粒RNA等等。标记的方法一般是利用荧光基因通过特定波长进行扫描检测。二、基因芯片技术检测肠道致病菌基因芯片技术不但提高了检测的水平,而且能够同时对多种致病菌进行鉴定,这是传统的检测方法如分子生物学、免疫学

7、技术所不能比拟的。不仅缩短了检测的周期,而且结果自动化分析,避免了由于操作人员的错误而导致错误的结果,是食品安全检测方面的重大技术突破。2.1检测肠道致病菌的毒力因子当前科研人员选取各种致病菌特异性的毒力因子作为检测的靶标。通过多重PCR的方法扩增多种致病菌,同时标记PCR产物,然后经过基因芯片杂交进行鉴定。Chizhikow等学者以多重PCR扩增与食源性致病菌相关的6种毒力因子为基础建立了一种基因芯片检测系统,和芯片杂交的方式鉴定了6种基因。目前这种技术路线应用于少数肠道致病菌鉴定方面,效果良好。本实验已经建立了一种用于甄别霍乱弧菌O139

8、的基因芯片和出血性大肠杆菌O157:H7,通过检测毒力基因以及SNPs位点,将霍乱弧菌O139和O1以及出血性大肠杆菌O157:H7和非H7。从实验结果不难看出,通

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