本科毕业论文--辽育白牛肌肉生长发育标记基因MSTN靶向MicroRNA鉴定

《本科毕业论文--辽育白牛肌肉生长发育标记基因MSTN靶向MicroRNA鉴定》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、学号：毕业论文（2014届本科）题目：辽育白牛肌肉生长发育标记基因MSTN靶向MicroRNA鉴定学院：畜牧兽医学院专业：动物科学姓名：指导教师：完成日期：2014年6月12日目录摘要1Abstract2前言31试验材料与方法81.1试验动物与来源81.1.1血液样品81.1.2肌肉组织样品81.2试验所需药品和试剂81.3主要仪器设备91.4主要试剂的配制91.5DNA的提取101.5.1天根血液试剂盒提取全血基因组101.5.2肌肉组织DNA提取111.5.3DNA浓度和纯度的检测111.6引物设计121.6.1辽育白牛MSTN基因引物为I-5-1片段的

2、PCR扩增121.6.2PCR反应条件的优化131.6.3PCR反应体系建立132结果与分析152.1序列鉴定152.1.1序列分析152.1.2电泳结果152.2测序结果162.2.1MSTN基因3′-UTR生物信息学特征162.2.2MSTN靶标miRNA分析172.2.3MSTN靶标miRNA结构183.讨论与结论203.1讨论203.2结论20参考文献21致谢23沈阳农业大学学士学位论文摘要为了研究辽育白牛肌肉生长发育标记基因MSTN靶向MicroRNA鉴定，本试验通过对辽育白牛DNA的提取睾丸组织DNA提取、DNA浓度和纯度的检测、引物设计以及测序

3、结果，试验结果表明利用在线软件查找牛的miRNA，牛的靶标miRNA库包含687个相关miRNA，用MicroInspector软件将MSTN基因与牛的miRNA结合情况分析后发现MSTN基因的3′-UTR可以结合5个miRNA（图25）。发生突变后结合的miRNA的情况没有发生变化，分别在+5819bp位与bta-miR-2451MIMAT结合，分别在+5222bp位与bta-miR-210MIMAT0结合，在+5136bp位与bta-miR-769MIMAT0结合，在+5609bp位与bta-miR-2288MIMAT结合，在+5187bp位与bta-m

4、iR-27a-5pMIM结合，结合的自由能几乎相近，其中bta-miR-2451MIMAT的结合自由能最高为-21.4，所有与MSTN结合的5个miRNA的碱基序列以及在MSTN基因上对应的靶标序列和结合自由能见表详情见表7。发生SNPs后MSTN基因的miRNA结合情况没有发生改变，可见+5304bp位点A到C的突变，+5378bp位点C到G的突变，+5387bp位点位点C到T的突变并没有对MSTN基因与miRNA的结合造成影响，也许并非是功能突变。使用RNAhybrid分析列表中前两个miRNA二级结构，bta-miR-2451序列为5′-augaggu

5、gcucuggagagugga-3′，且长度为22bp，其靶标前体长度为32bp，mfe值为-28.2。bta-miR-210序列为5′-acugugcgugugacagcggcuga-3′，且长度为23bp，其靶标前体长度为32bp，mfe值为-24.9。关键词：辽育白牛；DNA；结合；二级结构；MSTN；MicroRNA23沈阳农业大学学士学位论文AbstractInordertostudyLiaoYuwhitecowmusclegrowthanddevelopmentofmarkergenesMSTNMicroRNAtargetingidentifie

6、d,throughtheextractingofLiaoYuwhitebull'sDNA,testiculartissue'sDNA,thetestingofDNAconcentrationandpurity,eachorganization'stotalRNAextractionandprimerdesigningandsequencing,theresultsshowsthattheusingofonlinesoftwaretofindcattlemiRNA,targetscattlemiRNAlibrarycontains687relatedmiRNA

7、,withtheusingofMicroInspectorsoftware,theMSTNgeneandmiRNAbindingcattleareanalyzed,andfinding3'-UTRMSTNgenecanbecombinedwithfivemiRNA(Figure25).ThesituationafterthemiRNAbindingmutationsdoesnotchange,andeachbitinthe+5819bpbta-miR-2451MIMATbindingwerecombinedwiththebitinthe+5222bpbta-

8、miR-210MIMAT0,andat+5136bp