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时间:2019-06-02
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1、Real-timePCR检测(protocol)4/4实验流程描述:收集生长状态良好的目的细胞,提取RNA,并反转录成cDNA采用realtimePCR方法检测目的基因的表达情况。实验材料:1.主要试剂REAGENTSCOMPANYCat.No.TrizolInvitrogen15596-026M-MLV逆转录酶promegaM1705dNTPspromegaU1240oligodT上海生工B0205RnaseInhibitorpromegaN2115Primer(R&F)上海吉凯SYBRMasterM
2、ixtureTAKARADRR041B2.主要仪器EQUIPMENTSCOMPANYCat.NoNanodrop分光光度计Thermo2000/2000C稳压电泳仪上海天能RealtimePCR仪器TAKARA公司TP800实验步骤:1总RNA抽提(根据Invitrogen公司的Trizol操作说明书进行)1)收集细胞,2000rpm离心5min,去上清,细胞沉淀中加入1mlTrizol,充分混匀后室温静置5min,然后转移至新的1.5mlEP管中;2)每管加入200μl氯仿,用手上下颠倒eppendo
3、rf管15s,室温静置10min;3)4℃,12800rpm,离心10min;4)吸取上层液体移至新的1.5mlEP管,加入等体积预冷的异丙醇,混匀后4℃静置10min;5)4℃,12800rpm离心10min后,弃上清;4/46)加入1ml75%乙醇(用DEPC水新鲜配制),洗涤沉淀;7)4℃,11800rpm离心5min,弃去大部分上清;8)4℃,11800rpm离心5min,弃去上清;室温干燥;9)待RNA沉淀基本透明时,加入RNase-free水(加入体积视RNA沉淀量而定)至完全溶解,Nano
4、drop2000/2000C分光光度计分析测定所抽提RNA的浓度及质量。2RNA逆转录获得cDNA(根据Promega公司M-MLV操作说明书进行)实验所需耗材均购自Axygen,具体步骤如下:1)将1μlOligodT(0.5μg/μl)和2.0μgTotalRNA加入到PCR小管中,补充RNase-FreeH2O至10ul;混匀后离心,70℃温浴10min;之后立即置于冰水混合物中冰浴,使OligodT和模板退火;2)按下表的比例配制反应体系(冰上进行),混匀,短暂离心;试剂每管加入量5×RTbuf
5、fer4μl10mMdNTPs2μlRnasin(40U/ul)0.4μlM-MLV-RTase(200U/ul)1μlRNase-FreeH2O2.6μl注:dNTPs是dATP,dCTP,dGTP,dTTP的混合,浓度为10mM3)上述体系在42℃水浴反应1h,然后在70℃水浴10min使RT酶失活;4)将得到的RT产物--cDNA置于-80℃保存备用。3Real-timePCR检测1)按下列比例配置反应体系:试剂每管加入量SYBRpremixextaq:10.0μl上游引物(2.5μM)0.5μl
6、下游引物(2.5μM)0.5μlcDNA1.0μl4/4RNase-FreeH2O8.0μl2)两步法进行Real-TimePCR,并制作熔解曲线,程序如下:4.数据分析见实验报告4/4
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