RNA提取注意事项

RNA提取注意事项

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1、RNA提取心得/经验/体会/纪律(RNA提取注意事项)!纪律一:杜绝外源酶的污染。 注意一:操作环境干净无灰尘,严格戴好口罩,手套。 注意二:实验所涉及的离心管,Tip头,移液器杆,电泳槽,实验台面等要彻底处理。 注意三:实验所涉及的试剂/溶液,尤其是水,必须确保RNase-Free。纪律二:阻止内源酶的活性 注意四:选择合适的匀浆方法。 注意五:选择合适的裂解液。 注意六:控制好样品的起始量。纪律三:明确自己的抽提目的 注意七:任何裂解液系统在接近样品最大起始量时,抽提成功率急剧下降。 注意八:RNA抽提成功的唯一经济的标准是后续实验的一次成

2、功,而不是得率。Rnase污染的10大来源1:手指头–手指头是外源酶的第一来源,所以必需戴手套并且频繁更换。另外,口罩也必需戴,因为呼吸也是一个重要的酶来源。戴手套口罩的另外的好处是保护实验人员。2:枪头,离心管,移液器–单纯的灭菌是不能灭活Rnase的,所以枪头和离心管要用DEPC处理,即使是标明为DEPC处理过的。移液器最好是专用的,用前用75%的酒精棉球搽拭干净,尤其是杆子;另外,一定不要使用褪头器。3:水/缓冲液–一定要确保无Rnase污染。4:实验台面–最起码要用75%的酒精棉球搽拭干净。5:内源Rnase–所有组织均含内源酶,故组织

3、用液氮速冻是降低降解的最好办法。液氮保存/碾磨方法的确不方便,但对有一些内源酶含量很高的组织,却是唯一的办法。6:RNA样品–RNA抽提产物可能都会含痕量的Rnase污染。7:质粒抽提–质粒抽提往往用到Rnase降解RNA,残留的Rnase要用ProteinaseK消化,PCI抽提。8:RNA保存–即使低温保存,痕量的Rnase亦会导致RNA降解。长期保存RNA的最好办法是盐/醇悬液,因为醇在低温时抑制所有的酶活性。9:阳离子(Ca,Mg)–在含这些离子时,80C加热5分钟会导致RNA被剪切,故如果RNA需要被加热,保存液需要含螯合剂(1mMS

4、odiumCitrate,pH6.4)。10:后续实验所用的酶–酶均有可能被Rnase污染。RNase和DEPC处理1:高压灭菌是可以灭活部分RnaseA的。实验证明:37C与RNA反应,没有灭菌的PBS,活性点为100pg/ml;灭菌后,活性点为100ng/ml。当然,灭菌后Rnase仍然不能认为没有残留。2:DEPC在水中半衰期为30分钟。0.1%的DEPC灭菌156分钟可以认为彻底破坏了DEPC。破坏后可以闻到一点气味。3:在1MTris,1MHEPES,1MMOPS中分别加入1ug/mlRnaseA和0.1%及1%DEPC实验。结果提示

5、,0.1%DEPC只对MOPS有效,而1%DEPC对三种试剂都有效。4:0.01%DEPC,0.1%DEPC,1%DEPC有效去除RnaseA 的浓度分别为:100ng/ml,500ng/ml,1ug/ml。但要注意,DEPC灭活后的副产品,对有些后续实验是有影响的。我也来谈谈RNA的提取,我觉得14楼说的方法很严格,但是有时候我们其实不必在过多的细节上太紧张。而在有些步骤一定要小心了。以下的内容,是讲给那些既想偷懒,有希望实验结果有保证的人听的,如果你是习惯于每一步都很严格的人的话,建议还是按照14楼的方法做,因为那样才是正途啊。 好了,下面

6、是给想偷懒,但又不想搞砸实验的战友看的。用最少的时间,Money,力气,来做出最好的结果,是我们的终极目标(PS:我相信一句话,懒人推动科技进步!个人愚见,大家不要拍我啊)。我是做植物的,所以以植物RNA提取为例子:一、关于器皿的处理: 枪头ep管最好是用DEPC处理一下,当然如果老板钱多的话,尽管用进口的RNase-Free的吧。这里,如果你想要偷点懒,也是有办法的,就是少处理一些ep管,因为后面我们会讲到,不是所有的ep管都一定要处理的。 研钵,这个东西按要求是要高温干燥处理的,但是在实际实验中,如果你不处理的话,也不会有太大的影响。因为在

7、一般我们要处理的材料上都会带有很多的RNA酶,设想一下,一个研磨碎了的细胞会释放多少RNA酶出来。所以,在研钵上残留的那些RNase,不是导致你RAN降解的原因。我的做法是,洗干净的研钵,和枪头等一起湿热灭菌即可。如果你真的很急的话,连湿热灭菌也免了。 关于手套、口罩和实验台。手套是一个很重要的东西,这个千万不能省,而且实验过程当中要勤换手套。因为,一般我们在做实验是时候,还要取用很多其他试剂、仪器。所以手套往往是最有可能污染你样品的东西。所以千万记得要换得勤快点。还有,顺便说一下,最好是戴两层PE手套,因为实验过程中,往往手上会出汗,戴一层手

8、套的话,往往脱下来,就很难戴上去了。戴上两层,外层的手套可以方便更换,免得戴不上,还把PE手套夹到ep管里面,这样可是很危险的!至于口罩,我认为,不戴

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