StepOneV2.X 相对定量简易操作流程

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1、appliedbiosystemsStepOne/StepOnePlus荧光定量PCR仪相对定量实验简易操作流程SDS2.2相对定量实验简易操作流程StepOne/StepOnePlus定量PCR仪相对定量实验简易操作流程1.双击桌面图标,或从Start>AllPrograms>AppliedBiosystems>StepOneSoftware>StepOneSoftwareV2.2开启软件。进入主界面后选择AdvancedSetup。2.进入Setup下的ExperimentProperties界面:2.1输入实验名称(ExperimentName)2.2确认仪器型号2.32.3在实

2、验类型中,选择Quantitation-ComparativeCT(ΔΔCT)1相对定量实验简易操作流程2.4选择试剂种类2.5确认运行模式3.进入Setup下的PlateSetup界面,设置基因(Target)及样本(Sample):3.1在左边界面中设置基因及样本。利用按钮添加新的基因,并在TargetName中编辑基因名称,Reporter和Quencher中选择所标记的荧光基团及淬灭基团。对于Quencher的选择,如果是MGB探针,请选择NFQ-MGB;如果是TAMRA探针,请选择TAMRA;如果是其他形式的非荧光淬灭基团(如BHQ),请选择None。2相对定量实验简易操作流

3、程也可利用其他按钮保存(SaveTarget)或删除(DeleteTarget)已添加的基因。利用按钮添加样本,在SampleName中编辑样本名称。3.2在右边界面中进行样品板的排布。利用鼠标单选或拖曳以选择反应孔,然后勾选左侧的基因及样本,同时在Task选项中指定该反应孔的类型(U代表未知样本,N代表阴性对照)。3相对定量实验简易操作流程3.3在SelectRelativeQuantitationSettings中(参看上图)选择对照样本及内参基因。4.在Setup下的RunMethod界面,设定反应条件。TM5.如果想使用StepOnePlus仪器上的VeriFlexBlock温

4、度梯度功能,需要先在TM界面下,勾选EnableVeriFlexBlock选项。此时Block即被分成六个区块。(此功能仅限StepOnePlus机型)4相对定量实验简易操作流程然后在RunMethod界面中,点击想要调整的温度步骤,在弹出的界面中,选择并设定每个区块的温度。两相邻区块的温度差异不能超过5度,即第一与第六区块最多可差异25度。6.点击,将文件存储成ExperimentDocumentSinglefiles(*.eds)格式,然后在Run界面中按下按钮,反应即开始进行。5相对定量实验简易操作流程7.实验结束后,点击界面右上角的Analyze按钮,软件将会显示实验结果:7.

5、1在扩增图中(见上图),可通过更改PlotSettings来改变扩增图的显示方式。如果想查看阈值线或基线,请将Threshold及Baseline打勾。7.2查看相对表达量结果时,利用PlotSettings选项,以不同方式显示表达量的结果。6相对定量实验简易操作流程7.3对于SYBRGreen法实验,可以在MeltCurve界面中查看熔解曲线。7.4检查QCSummary结果,可以快速查看实验中是否有反应孔存在异常情况。黄色三角中的数字1代表有一种异常情况,2代表有两种异常情况,以此类推。详细信息及解决方案可以在FlagDetails中看到。7相对定量实验简易操作流程8.分析之后的结

6、果,可以利用菜单中的File>Export功能,导出Excel格式的结果。若想存储图片,可直接在图片上单击鼠标右键,选择Saveas,存成JPEG格式的图片。8相对定量实验简易操作流程9

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