遗传图和基因定位

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1、遗传图和基因定位第一节真核生物基因定位基本方法遗传图制作一、基因定位1、交换率(crossovervalue)或重组率(recombinantfrequency)重组(recombination)亲本方式:SCscScsC重组方式:重组体(recombinant)重组率(RF)重组合配子数重组率(交换率)=亲本型配子数+重组型配子数2、重组率（交换率）的测定利用测交法重组合数重组率(交换率)=亲本型数+重组型数说明：(1)严格说，重组率≠交换率，∴重组率<交换率(2)重组率≤50%(3)若重组率=50%→自由组合假设：基因顺序A(a)B(b)C(c)Abc/aBCI交换

2、ABC(p%)II交换abc(q%)ABc/abCIIII,II双交换（p%）(q%)AbC/aBc问：哪些基因重组？怎样判断哪个位点在中间？AC重组率、交换率怎样算？3、基因定位（genemapping)三点测验法threepointtestcross果蝇眼形：棘眼ec,正常眼+翅形：截翅ct,正常翅+X连锁遗传横脉：缺失cv,有横脉+棘截有横脉正常眼正常翅缺横脉ecct+++cv♀×♂ecct+ecctcvecct+×♂F♀1++cv测交结果RF（%）表型校正表型实得数比例IIIec-ctec-cvcv-ctecct+ec+ct2125亲本型81.5%++cv+cv

3、+2207ec+cveccv+273单I10.1%√√+ct+++ct265ec++ec++217单II8.3%√√+ctcv+cvct223++++++5双交换0.1%√√ecctcveccvct3总计5318100%18.4%10.2%8.4%三点测验步骤：⑴确定亲本型和双交换型亲本型：ecct+++cv双交换型：+++ecctcv⑵确定基因顺序ec+cteccvctcv在中间符合+cv++++ecct+cv在中间eccvctIIIecctcv⑶统计各类型的百分数测交结果RF（%）表型校正表型实得数比例IIIec-ctec-cvcv-ctecct+ec+ct2125

4、亲本型81.5%++cv+cv+2207ec+cveccv+273单I10.1%√√+ct+++ct265ec++ec++217单II8.3%√√+ctcv+cvct223++++++5双交换0.1%√√ecctcveccvct3总计5318100%18.4%10.2%8.4%⑷计算重组率①计算ec-cv的重组率RF(ec-cv)=(273+265+5+3)/5318=10.2%RF(单I)=(单I数+双交换数）/总数=单I频率+双交换频率=10.1%+0.1%=10.2%②计算cv-ct的重组率RF(cv-ct)=(217+223+5+3)/5318=8.4%RF(单

5、II)=(单II数+双交换数）/总数=单II频率+双交换频率=8.3%+0.1%=8.4%③计算ec-ct的重组率RF（ec-ct)=(273+265+217+223)/5318=18.4%RF（ec-ct)=单I频率+单II频率=10.1%+8.3%=18.4%交换率(ec-ct)=RF(单I）+RF（单II）=10.2%+8.4%=18.6%(单I数+双交换数)+(单II数+双交换数)交换率(ec−ct)=总数交换率(ec-ct)=单I频率+双频率+单II频率+双频率=10.1%+8.3%+2×0.1%=18.6%交换率(ec-ct)=RF(ec-ct)+2×双交换

6、率=18.4%+2×0.1%=18.6%RF(ec-ct)=交换率(ec-ct)－2×双交換率=18.6%－2×0.1%=18.4%⑸确定基因距离—画遗传学图eccvct10.28.418.6图距单位（mapunit,mu),厘摩(centimorgan,cM)二、并发率(coincidence)和干涉(interference)理论双交换发生频率=单I交换率×单II交换率=10.2%×8.4%=0.86%观察双交换发生频率=（5+3）/5318=0.15%观察双交换发生频率0.15%并发率C(符合率)===0.17理论双交换发生频率0.86%干涉=1－C=1－0.17

7、=0.83C↑→干涉↓C=0→完全干涉C=1→互不干扰三、连锁群和连锁图1、连锁群(linkagegroup)连锁群数=染色体对数连锁群数<染色体对数?连锁群数>染色体对数???2、连锁图(linkagemap)染色体图(chromosomemap)遗传图(geneticmap)玉米：第1连锁群，sr-bm图距为172，但RF<50%2例(Example)bluntbreast’s：1Whatisthearrangementamongtheseloci?Andthedistancesbetweeneachtwoofthem?解（Solut