双色荧光杂交芯片在近交系小鼠遗传监测中的应用

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1、动物学研究2008，Feb.29(1)：10－16CN53-1040/QISSN0254-5853ZoologicalResearch双色荧光杂交芯片在近交系小鼠遗传监测中的应用1，*12111崔淑芳，瞿秀华，韩士忠,余琛琳,孙伟,汤球（1.第二军医大学训练部实验动物中心，上海200433;2.复旦大学生命科学院遗传研究所生物遗传工程重点实验室，上海200433）摘要：应用一种新的高通量SNP检测方法-双色荧光杂交芯片技术进行近交系小鼠遗传监测。应用双色荧光杂交芯片技术对4个品系近交系小鼠的多个基因组DNA样本进行S

2、NP分型，整合6个SNP位点的芯片杂交信息，对样本所属品系进行判断。研究结果表明SNP检测方法-双色荧光杂交芯片技术能够对选定的6个SNP位点进行高准确率分型；双色荧光杂交芯片技术是一种高通量SNP检测的良好工具，适合于对少量近交系品系来源的大样本量小鼠进行遗传污染监测和品系鉴定，并具有扩大应用的潜力。关键词：SNP；双色荧光杂交；小鼠中图分类号：Q341；Q524文献标识码：A文章编号：0254-5853-（2008）01-0010-07ApplicationofDual-colorFluorescenceHybr

3、idizationChipTechniqueintheMonitoringoftheGeneticQualityofInbredMiceStrains1，*12111CUIShu-fang，QUXiu-hua，HANShi-zhong，YUChen-lin，SUNWei，TANGQiu(1.ExperimentAnimalCenter,TrainingDepartment,SecondMilitaryMedicalUniversity,Shanghai200433,China;2.StateKeyLabofGenet

4、icEngineering,InstituteofGenetics,SchoolofLifeScience,FudanUniversity,Shanghai200433,China)Abstract:Thisstudyaimedtouseamicroarray-basedmethodforscoringanumberofgenomicDNAinparallelforoneSNPmarkeronaglassslideforthegeneticmonitoringofinbredmice.Weappliedthemeth

5、odtoidentifyinbredlaboratorymicestrainstovalidatethereliabilityandstabilityofthisgenotypingpanel.TheamplifiedPCRproductsfromfourinbredstrainswerespottedandimmobilizedontoamino-modifiedglassslidestogenerateamicroarray,whichwastheninterrogatedbyhybridizationwithd

6、ual-colorprobestodeterminetheSNPgenotypeofeachsample.Theresultsindicatedthatthismicroarray-basedmethodcouldeffectivelydeterminethegenotypeofthesixselectedSNPswithahighdegreeofaccuracy.ThisSNPgenotypingmethodisfeasibleformonitoringgeneticcontaminationincolonieso

7、flimitedgeneticdiversity.Moreover,anenlargedversionofthepanelcouldbeusedtoanalysealargenumberofstrains.Keywords:SNP;Dual-colorfluorescencehybridization;Mouse随着生命科学的不断发展，对实验动物遗传品杂交芯片技术在近交系实验动物遗传监测的可行质的要求也越来越高，对动物群体遗传的均一性和性。个体的差异性更为关注。如何对越来越多的近交系1材料与方法动物遗传质量进行监测，

8、是目前急需解决的问题。只有研制出更方便，更可靠的监测方法，才能保证1.1实验材料我国实验动物遗传质量的提高。基因芯片技术是90(1)低密度氨基修饰的基片，由上海联合基因年代初随着人类基因组计划而兴起的新技术，具有科技（集团）有限公司提供。高通量、大规模、平行性等特点，本研究首次将此(2)实验动物：4种不同品系2月龄近交系小鼠方法运用于近交系动物