分子遗传学基因组及基因组学

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1、第二章基因和基因组2.病毒基因组2.1病毒基因组的结构多样性（1）双链DNA病毒基因组（2）单链DNA病毒基因组（3）正链RNA病毒基因组（4）负链RNA病毒基因组（5）双链RNA病毒基因组（6）反转录病毒基因组2.2反转录病毒基因组的结构与功能2.3重叠基因与病毒基因组中特征序列的结构和功能重叠基因黏性末端末端丰余循环排列回文序列末端反向重复序列分段基因组帽子和poly(A)结构2.3原核生物基因组2.3.1大肠杆菌基因组Escherichiacoli基因组大小为4.7×106bp双链环状DNA分子，拟核结构；具有操纵子结构，K-12MG1655

2、有2584个操纵子,其中推定的2192个操纵子中，73％仅有1个基因，16.6%有2个，4.6％有3个，6％有4个或更多个基因。在2405个已知启动子的操纵子中，68％只有1个启动子，20％有2个，12％有3个或更多个启动子；6.数个操纵子还可以由一个共同的调节基因（regulatorygene）即调节子（regulon）所调控；7.除了编码rRNA的rrn基因是多拷贝,一般情况下结构基因都是单拷贝；8.不编码的基因组DNA部份所占比例比真核细胞基因组少得多；9.在基因组中编码顺序一般不会重叠.功能分类基因数目所占百分数调节功能/可能调节45/13

3、31.05/3.10细胞结构/推定的膜蛋白182/134.24/0.30推定的结构蛋白420.98噬菌体、转座子、质粒872.03运输和结合蛋白/推定的运输蛋白281/1466.55/3.04能量代谢2435.67DNA复制、重组、修饰和修复1152.68转录、RNA合成、代谢和修饰551.28翻译、翻译后蛋白质修饰1824.24细胞作用（包括适应、保护）1884.38辅助因子、辅基和载体的生物合成1032.04运输的伴侣蛋白90.21核苷酸的生物合成和代谢581.35氨基酸的生物合成和代谢1313.06脂肪酸和磷脂的代谢481.12碳化合物的分解

4、代谢1303.06主要的中间代谢1884.38推定的酶2515.85其他的已知基因（已知的基因产物或表型）260.61推定的、未分类的、未知的蛋白163238.06总计4288100.00*功能分类基因数目所占百分数调节功能/可能调节45/1331.05/3.10细胞结构1824.24推定的膜蛋白130.30推定的结构蛋白420.98噬菌体、转座子、质粒872.03运输和结合蛋白2816.55推定的运输蛋白1463.04能量代谢2435.67DNA复制、重组、修饰和修复1152.68转录、RNA合成、代谢和修饰551.28翻译、翻译后蛋白质修饰18

5、24.24细胞作用（包括适应、保护）1884.38辅助因子、辅基和载体的生物合成1032.04运输的伴侣蛋白90.21核苷酸的生物合成和代谢581.35氨基酸的生物合成和代谢1313.06脂肪酸和磷脂的代谢481.12碳化合物的分解代谢1303.06主要的中间代谢1884.38推定的酶2515.85其他的已知基因（已知的基因产物或表型）260.61推定的、未分类的、未知的蛋白163238.06总计4288100.00*代码基因产物类型数目百分比2e/pe酶/推定的酶1094/39033.3t/pt运输蛋白/推定的运输蛋白337/25413.3r/p

6、r调节蛋白/推定的调节蛋白241/1649.1m/pm膜蛋白/推定的膜蛋白43/2105.7f/pf蛋白因子/推定的蛋白因子150/604.7sps结构蛋白成分/推定的结构蛋白成分89/372.8c/pc传递蛋白推定的传递蛋白/77/422.7nRNA1563.5lp脂蛋白461.0cp细胞作用561.3l引导肽110.3su共同的假基因741.6i起始位点(oriC)1<0.1h共同的噬菌体/插入序列(包括15个假基因)3046.8d部分信息1463.3o未知功能47110.6总计44531100.0接合是通过细菌细胞直接的接触，遗传信息从给体单

7、向转移到受体从而实现遗传重组的过程。接合能传递大段的DNA，在细菌的遗传重组中是效率最高的。转化也称遗传转化（genetictransformation）是指同源或异源的游离DNA分子（质粒和染色体DNA）被自然或人工感受态细胞摄取，并得到表达的基因转移过程转导是通过噬菌体感染将DNA或RNA转入宿主细菌细胞并产生新性状的过程。普遍性转导（generalizedtransduction）普遍性转导是通过噬菌体将给体菌的任何一种遗传标记转入受体菌的过程。噬菌体细菌时，细菌染色体断裂成许多小片段。在噬菌体DNA装入外壳蛋白组成新的噬菌体时，大约在105

8、~107次装配中有一次装配错误。误将宿主细胞残留的DNA片段装入噬菌体的外壳蛋白中，成为一个转导性的噬菌体。该转导性噬菌体