利用SSR标记定位东乡野生稻苗期耐冷性基因

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1、江西农业大学硕士学位论文利用SSR标记定位东乡野生稻苗期耐冷性基因姓名：钟平安申请学位级别：硕士专业：作物遗传育种指导教师：黄英金;谢建坤2003.6.1缩略语RFLP限制性片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)PCR聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction)STS序列标记位点(Sequence-TaggedSites)DAFDNA扩增指纹(DNAAmplificationFingerprinting)RAPD随机扩增多态性DNA(RandomlyAmplified

2、PolymorphicDNA)ALP扩增子长度多态。l生(AmplicomLengthPolymorphism)AFLP扩增片段长度多态性(AmplifiedFragmentLengthPolymorphism)SAP特异扩增子多态。l生(SpecificAmplicomPolymorphism)SSLP简单序列长度多态性(SimpleSequenceLengthPolymorphism)SSCP单链构象多态性(singleStrandConformationPolymorphism)RGA抗性基因同源序列(ResistanceGeneAn

3、alog)SCAR序列特异性扩增区(Sequence-CharacterizedAmplifiedRegion)cDNA互补DNA(ComplementaryDNA)SSR简单序列重复(SimpleSequenceRepels)QTL数量性状位点(QuantitativeTraitLocus)CAPS酶切扩增序列多态性(CleavedAmplifiedPolymorphicSequence)RIL重组自交系(RecombinantInbredLines)DH加倍单倍体(DoubledHaploids)BClFl回交一代群体(BackCros

4、sFt)NIL近等基因系(Near-IsogenicLines)MAS标记辅助选择(Marker．AssistedSelection)DY东乡野生稻(DongXiangWildRice)XB协青早B(XieQingZaoB)硕士学位论文：利用SSR标记定位东乡野生稻苗期耐冷性基因摘要低温冷(寒)害不仅在北方是威胁水稻生产的大敌，而且在南方也严重影响着早稻育苗与晚稻的抽穗扬花及灌浆，是我国长江中下游地区水稻生产的主要限制性因素之一。我国每年因低温损失30～50亿kg稻谷。为此，利用现代分子生物学技术对水稻耐冷基因进行标记、定位，研究其耐冷性的

5、遗传规律，对水稻耐冷育种有重大的理论和实践价值。目前水稻耐冷基因的分子标记和定位研究很少，且主要集中于粳稻耐冷基因源的耐冷基因定位，而对野生稻耐冷基因的定位研究至今未见报道。东乡野生稻是世界分布最北(28。14’N)的普通野生稻。它蕴藏着丰富的抗病虫及抗各种不良环境的抗性基因，尤其是其耐冷性极强，休眠芽能忍受极端最低温度一12．8℃。由于东乡野生稻具有丰富的抗逆特性，尤其是具备其它野生稻和栽培稻所没有的强耐冷性，因此，开展东乡野生稻耐冷基因的定位研究，弄清其耐冷基因在染色体上的具体位点，既可为耐冷基因的克隆提供素材，又能把与耐冷性密切相连锁

6、的分子标记提供于分子标记辅助选择育种，以提高水稻耐冷性育种效率，具有重要意义。本研究采用SSR分子标记技术，应用协青早B／东乡野生稻BC。F。群体的219个株系，结合人工气候箱稳定的空间条件．采用营养液培养，于1叶l心期进行耐冷鉴定，以苗期的死苗率作为衡量亲本及各BC．F．群体株系苗期耐冷性的指标，并将其作为数量性状进行基因定位。研究结果表明：1，在BC—F，群体中，死苗率呈连续分布，大部分株系的死苗率低于协青早B，而高于耐冷亲本东乡野生稻，表明东乡野生稻耐冷性为数量性状。由多个基因控制。2，根据前人公布的水稻SSLP图谱，对水稻第卜12染

7、色体上的SSR标记依次进行扩增，共扩增167对引物。其中143对引物扩增成功，用于检测双亲间的差异。应用于亲本检测和阳性标记筛选的143对微卫星引物中，56对引物在冷敏、耐冷DNA池和亲本间检测到差异性，依次用56对在冷敏、耐冷DNA池和亲本间检测到差异性的标记检测群体。应用单因素方差分析法分析56个标记的茁期死苗率，并估算有关的遗传参数。在56个检测到多态性的标记中，有5个标记为阳性标记(第4染色体上RMl31、RMl27、RM280和第8染色体上RM337、RMl52)，分别在第4、8染色体上检测到了一个可能与耐冷性有关的QTL。关键词

8、：东乡野生稻；SSR；苗期i耐冷性；基因定位硕士学位论文：IdentificationofQTLsforColdT01emncaatSeedlingStageinI螂iangWi