斑马鱼肌间骨的自动提取

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时间:2019-05-20

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1、硕士论文斑马鱼肌问骨的自动提取摘要斑马鱼作为脊椎鱼类的一种,因为它在疾病建模和药物发明领域的巨大潜力,近年来逐渐成为了研究的热点。作为整个斑马鱼生物研究的一部分,本文的主要目的在于利用先进的图像处理技术,实现对斑马鱼肌间骨的自动提取。肌间骨作为斑马鱼生长过程中的重要指标,对于我们判断斑马鱼胚胎是否正常发育具有十分重要的意义。首先,本文对斑马鱼图像进行了分割实验,在分析了阈值分割、边缘检测、种子生长、分水岭等传统图像分割的基础上,本文提出了一种基于阈值和算子生长的改进型算法,实现对斑马鱼软体部分的准确分割。接着,本文

2、按照面积和周长的度量标准完整地提取出了斑马鱼的软体部分。紧接着,本文对图像进行方向旋转,这样有利于肌间骨的准确提取。我们需要将肌间骨投射到坐标轴上,并根据旋转角度和阈值做出相应的调整。最后本文提出了一种基于平均间距的斑马鱼肌间骨提取算法,取得了良好的效果。关键词:阈值分割,算子运算,角度优化,像素遍历Abs仃act硕士论文AbstractAsoneofthemostvaluablefish,zebmfishhastremendouspotentialapplicationsindiseasemodelingandm

3、edicineinvention.Theaimofthispaperistoproposeanadvancedmethodtoimplementtheautomaticdetectionandrecognitionofsomitesofzebrafish.First,variouskindsofimagesegmentationmethodsarediscussedsuchasthresholdsegmentation,edgedetection,seedgrowthmethod,outlinetakingandw

4、atershedmethod.Baseonthealgorithmwementionedabove,anovelmethodisproposedtorealizetheimagesegmentationofzebrafish,whichisfastandrobustcomparedtootherexistedalgorithms.Thenbyusingsquarestandard,thewholemainpartofzebrafishistakenout.Makingarotatetowardstheimageis

5、veryimportant.Thusthesomitesareprojectedintothehorizontalaxisandwebegintotakethesomites.Intheend,anewmethodisproposedtotakethesomites,whichisbasedonaveragedistancestandard.Theexperimentsshowthatthealgorithmiseffectivetowardsthezebrafishimage.Keyword:thresholds

6、egmentation,operatorcomputation,angleoptimization,pixeltraversalII声明尸明本学位论文是我在导师的指导下取得的研究成果,尽我所知,在本学位论文中,除了加以标注和致谢的部分外,不包含其他人已经发表或公布过的研究成果,也不包含我为获得任何教育机构的学位或学历而使用过的材料。与我一同工作的同事对本学位论文做出的贡献均已在论文中作了明确的说明。研究生签名:盘!!垫!当≥一口侔6月却日学位论文使用授权声明南京理工大学有权保存本学位论文的电子和纸质文档,可以借阅或

7、上网公布本学位论文的部分或全部内容,可以向有关部门或机构送交并授权其保存、借阅或上网公布本学位论文的部分或全部内容。对于保密论文,按保密的有关规定和程序处理。研究生签名:.耋壹箜J..歹年占月哆日硕士论文斑马鱼肌间骨的自动提取1.绪论斑马鱼又称蓝条鱼、花条鱼,原产于印度、孟加拉国。起初斑马鱼只是用于观赏,但是后来随着科学研究的深入,人们意外发现斑马鱼基因和人类基因的相似度竟然达到87%。这也就意味着在斑马鱼身上的实验结果在多数情况下都可以适用于人体,因此它受到了科学家的格外重视。同时,因为斑马鱼的胚胎是透明的,所以

8、科学家可以很容易观察到药物对斑马鱼内部器官的影响,这是斑马鱼相比较其他实验动物的又一个重要优势。除此之外,雌性斑马鱼可以一次产卵数百枚,这些胚胎可以在24小时内发育成形,这就使得科学家在同一代鱼身上进行不同的实验,这有利于科学家研究病理演化过程并及时发现病因。1.1斑马鱼研究现状由于基因技术的突飞猛进,人类在与疾病的斗争当中又有了新的武器。正是基因工程的存在

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