《系统生物学》PPT课件

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1、Proteomicsanditsapplicationsforfoodauthentication andfood-technologyresearchReview马晓丹(13S027001)微生物专业Abstract这篇文章是食品技术应用蛋白质组学研究进展中的一个关键的概述,这可分为两大主题:(i)食品组分认证作为一种工具,必须符合食品标签法规和政策;(ii)食品技术的研究,主要是针对开发快速,可靠的方法来检测和识别食品的变质情况或者病原性微生物是否存在与食品中,同时也用于研究食品经过加工后,食物的成分是否发生改变。KeywordsFoodauthenticatio

2、nFoodomicsFoodprocessingFoodtechnologyHigh-intensityfocusedultrasound(HIFU)Massspectrometry(MS)MicroorganismdetectionPathogenProteomicsSelectedMS/MSionmonitoring(SMIM)Contents1.Introduction..................................2.Proteomics...................................2.1.Proteinidenti

3、ficationandcharacterization...2.2.Differentialproteomics...................2.3.Functionalproteomics....................2.4.Proteomicsworkflows....................2.5.MSanalysis............................3.Proteomicsinfoodauthenticity..................3.1.Discoveryphase.................

4、........3.2.Target-drivenphase.....................4.Proteomicsinfoodtechnology...................4.1.Proteomicsinfoodspoilageandmicrobiology4.2.Proteomicsinfoodprocessing.............5.Concludingremarksandfuturedirection...........References...................................1.介绍食品工业中的

5、技术进步在全球粮食市场中增加了消费者的利益。现如今,学术界和食品科学产业面临着新的挑战:⑴安全⑵维持机体的健康⑶抵抗特定疾病因素的发展蛋白质组学2.蛋白质组学蛋白质组学(Proteomics)一词,源于蛋白质(protein)与基因组学(genomics)两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识,2.1蛋白质鉴定和表征质谱(MS)是表征

6、和鉴定蛋白质的首选方法.蛋白质组的分析通常依赖于随后的MS的一个或多个分离步骤进行分析。在被称为肽质量指纹图谱的方法(PMF)的技术,如二维凝胶电泳(2-DE),是用于隔离一个未知的蛋白质,然后将其酶促消化成肽,并进行MS分析。另一种方法中,通常被称为肽碎片指纹(PFF),用串联质谱(MS/MS),可以将肽的碎片分离的更细,更明确地识别该蛋白。2.2差异蛋白质组学它是通过寻找各种因素引起的蛋白质表达差异,以解释细胞生理和病理机制,即主要通过比较分析不同状态下或近似物种间蛋白质的表达图谱,实现对体系内代谢调控的动态监测,从而揭示机体对内外界环境变化产生反应的本质规律2.

7、2差异蛋白质组学在蛋白质水平上的定量信息,例如在不同的样品中对某一特定蛋白做相对定量或者一种蛋白质的绝对定量,确定不同条件之间的差异,是非常有用的。相对定量可以用不同的方法来实现,可被分类为基于凝胶的,基于标签和无标签方法。2.3功能蛋白质组学功能蛋白质组学研究解决不同的蛋白质的功能性相互作用的综合分析。2.4蛋白质组学工作流程2.5质谱分析MS和生物信息学是已经彻底改变了蛋白质组学研究的两个工具,在一个实验中,能够高通量分析数千种蛋白质。简单地说,MS由在离子源[电喷雾电离(ESI)或基质辅助激光解吸电离(MALDI)]处分析物的电离和被分析物离子

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