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《玉米穗行数全基因组关联分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2014,40(1):1−6http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2014.00001玉米穗行数全基因组关联分析**张焕欣翁建峰张晓聪刘昌林雍洪军郝转芳李新海中国农业科学院作物科学研究所/作物分子育种国家工程实验室,北京100081摘要:穗行数是玉米产量的重要组成性状,其遗传解析对高产育种具有指导意义。本文以203份主要玉米自交系为材料,2007年在新疆乌鲁木齐、吉林公主岭
2、和海南三亚进行穗行数测定;采用分布于玉米基因组的41101个单核苷酸多态性(SNP)标记对穗行数进行关联分析。共鉴定出9个与穗行数显著关联(P<0.0001)的SNP,分别位于染色体框1.02、1.10、7.03、8.02、9.06和10.03。8个SNP位于已定位的数量性状座位(QTL)区间内。在显著SNP位点LD区域内发掘出4个候选基因,分别编码含F-box结构域的生长素受体蛋白、玉米kn1蛋白、AP2结构域蛋白和富亮氨酸重复的跨膜蛋白激酶。采用全基因组关联分析策略发掘穗行数基因位点及候选基因,将为克隆控制玉米产量性状基因奠定基础。关键词:玉米;穗行数;全基因组关联分析;候选基因Gen
3、ome-wideAssociationAnalysisofKernelRowNumberinMaize*ZHANGHuan-Xin,WENGJian-Feng,ZHANGXiao-Cong,LIUChang-Lin,YONGHong-Jun,HAO*Zhuan-Fang,andLIXin-HaiInstituteofCropScience,ChineseAcademyofAgriculturalSciences/NationalEngineerLaboratoryofCropMolecularBreeding,Beijing100081,ChinaAbstract:Kernelrownum
4、ber(KRN)isoneofgrainyieldcomponentsinmaize(ZeamaysL.).Investigationofitsgeneticarchi-tecturewillhelpdevelophigh-yieldvarietiesinmaize.Inthisstudy,theKRNinapanelof203maizeinbredlineswasdetectedinUrumqiofXinjiang,GongzhulingofJilin,andSanyaofHainanin2007,andusedtoperformthegenome-wideanalysisforKRNu
5、singMaizeSNP50BeadChip.AtotalofnineSNPswerefoundtobesignificantlyassociatedwithKRNatathresholdofP<0.0001,whichwereonchromosomeBins1.02,1.10,7.03,8.02,9.06,and10.03,respectively.EightoftheseSNPswerelocatedintheQTLintervalsreportedpreviously.Meanwhile,fourcandidategeneswerescanned,encodingauxinsigna
6、lingF-boxcontainingprotein,kn1protein,AP2domaincontainingproteinandleucine-richrepeattransmembraneproteinkinaserespectively.Insum-mary,theseidentifiedgenesandSNPswillofferessentialinformationforcloningyield-relatedgenesinmaize.Keywords:Maize;Kernelrownumber;Genome-wideassociationanalysis;Candidate
7、gene玉米穗行数(kernelrownumber,KRN)形成于小的294份重组自交系(recombinantinbredline,RIL)[1]穗分化期,由小穗成对分生组织数目决定。穗行数群体检测出13个穗行数QTL,分别位于第1、第3、[5]是决定玉米产量的主要构成因素,属于数量性状,第4、第5、第8、第9和第10染色体。Lu等利[2]广义遗传力较高,其遗传解析对玉米高产育种具用掖478×丹340的150个F2:3
