以关联分析发掘小麦整穗发芽抗性基因分子标记

《以关联分析发掘小麦整穗发芽抗性基因分子标记》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2014,40(10):17251732http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2014.01725以关联分析发掘小麦整穗发芽抗性基因分子标记朱玉磊王升星赵良侠张德新胡建帮曹雪连杨亚杰*常成马传喜张海萍安徽农业大学农学院/农业部黄淮南部小麦生物学与遗传育种重点实验室,安徽合肥230036摘要:利用分布于小麦全基因组的181对分子标记,分析264份自然群体的基因型,采用TASS

2、LE软件的GLM和MLM模型检测与整穗发芽抗性紧密关联的标记位点,发掘相关位点内的优异等位变异。在2012年和2013年室内整穗发芽率、2013年田间自然降雨整穗发芽率3个环境中,共关联到20个显著位点(P<0.05),分布于小麦染色体1AS、2DS、3AS、3BL、4AL、5AS、5BL、6BS、6DS、7AL和7BL上。分别位于2DS和7BL上的分子标记gwm102和barc340同时在3个环境下关联到,属于稳定的抗性位点;另有6个标记位点同时在2个环境下关联到;其余12个标记位点仅在1个环境下关联到。位于7BL上的barc340标记位点为一新报道位点。从重复关联的8个标记位点内共检测出

3、10种优异等位变异。barc28-229bp和barc28-217bp对提高整穗发芽抗性效应最显著,主要分布在地方品种中(如遂宁坨坨麦等),而gwm102-142bp和barc186-199bp效应虽然相对较小,但多分布在推广品种中(如扬麦158等),有利于穗发芽抗性分子育种的直接应用。关键词:小麦;穗发芽;休眠;分子标记;关联分析ExploringMolecularMarkersofPreharvestSproutingResistanceGeneUsingWheatIntactSpikesbyAssociationAnalysisZHUYu-Lei,WANGSheng-Xing,ZHAO

4、Liang-Xia,ZHANGDe-Xin,HUJian-Bang,CAOXue-Lian,*YANGYa-Jie,CHANGCheng,MAChuan-Xi,andZHANGHai-PingKeyLaboratoryofWheatBiologyandGeneticImprovementinSouthYellow&HuaiRiverValley,MinistryofAgriculture/CollegeofAgronomy,AnhuiAgriculturalUniversity,Hefei230036,ChinaAbstract:Toimprovepre-harvestsprouting(P

5、HS)resistanceinwheatbreeding,itisimportanttoexploremarkerlociandeliteallelesassociatedwithPHSresistanceusingintactspikes.Inthisstudy,atotalof181markerswereusedto264genotypemateri-als.Generalandmixedlinearmodels(GLMandMLM)wereusedtoanalyzePHSphenotypicdatainthreeenvironments(2012-inhouse,2013-inhous

6、eand2013-infield).Theresultsshowedthattwentymarkerswereidentifiedbyassociationanalysis,andlo-catedonchromosomes1AS,2DS,3AS,3BL,4AL,5AS,5BL,6BS,6DS,7AL,and7BL.Themarkersgwm102on2DSandbarc340on7BLweredetectedstablyinthreeenvironments,amongwhichbarc340waslikelytobenovelandneedstobefurtherstudiedthroug

7、hbiparentallinkagemappinganalysis.Sixmarkersweredetectedintwoenvironments,andtheotherlocilinkedwith12markersweredetectedonlyinoneenvironment.Atotaloftenelitealleleswerefurtherexploredamongtheeightlociwithre