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《两个谷子CIPK基因在非生物逆境胁迫下的表达分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2016,42(2):295302http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2016.00295两个谷子CIPK基因在非生物逆境胁迫下的表达分析1,21,22222余爱丽赵晋锋王高鸿杜艳伟李颜方张正21,郭二虎梁爱华12山西大学生物技术研究所,山西太原030006;山西省农业科学院谷子研究所/特色杂粮种质资源发掘与育种山西省重点实验室,山西长治046011摘要:CI
2、PK是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,该蛋白在植物响应逆境胁迫过程中发挥重要作用。本文利用生物信息学方法从谷子基因组中鉴定出2个CIPK基因,命名为SiCIPK6和SiCIPK16。序列分析表明SiCIPK6基因组序列长1994bp,编码451个氨基酸;SiCIPK16基因组序列长1885bp,编码473个氨基酸,2个基因均无内含子和可变剪切。生物信息学分析显示这2个基因在蛋白质序列和结构上与其他物种CIPK基因一样非常保守。实时定量PCR分析表明SiCIPK6和SiCIPK16在ABA、低温、高温、干旱、高盐诱导下表达量均有所上调,SiCIPK6基因在ABA、干旱和盐处理时表达量上调
3、幅度较大,而SiCIPK16基因在低温、干旱和高温处理时表达量上调幅度较大。半定量PCR检测结果表明SiCIPK6和SiCIPK16两个基因在拔节、孕穗、灌浆期时均有表达,在相应生育时期受到干旱胁迫时它们表达量均有所提高。推测SiCIPK6和SiCIPK16基因在谷子的干旱或其他逆境胁迫中起一定作用。关键词:谷子;CIPK基因;逆境ExpressionAnalysisofTwoCIPKgenesunderAbioticStressinFoxtailMillet1,21,22222YUAi-Li,ZHAOJin-Feng,WANGGao-Hong,DUYan-Wei,LIYan-Fa
4、ng,ZHANGZheng,GUO21,Er-Hu,andLIANGAi-Hua12InsituteofBiotechnology,ShanxiUniversity,Taiyuan030006,China;MilletResearchInstitute,ShanxiAcademyofAgriculturalSciences/ShanxiKeyLaboratoryofGeneticResourcesandBreedinginMinorCrops,Changzhi046011,ChinaAbstract:CIPK(CBLinteractingproteinkinase)isatype
5、ofserineorthreonineproteinkinases,whichplaysanimportantroleinresponsetostress.Inthisstudy,weidentifiedtwoCIPKgenesdesignatedasSiCIPK6andSiCIPK16fromfoxtailmillet(Setariaitalica)genomeusingbioinformaticsmethods.ThesequenceanalysisshowedthatSiCIPK6hasalengthof1994bpinthegenome,encoding513aminoac
6、idsresidues,andSiCIPK16is1885bp,encoding473aminoacidsresidues.Thesetwogeneshavenoal-ternativesplicingandintron.ThecharacterspredictedbasedonthebioinformaticsanalysisrevealedthattheproteinsequencesandstructureofthetwoSiCIPKgeneswereveryconservativejustlikeCIPKgenesinotherspecies.Real-timePCRana
7、lysisdiscov-eredthattheexpressionofSiCIPK6andSiCIPK16wasup-regulatedbyABA,cold,heat,droughtandsaltstress,respectively.TheexpressionwasstronglyinducedbyABA,droughtandsalttreatmentsforSiCIPK6,andbycold,droughtandheattreatmentsforSiCIPK16.
