基于转录组数据的癌症凋亡机理的研究

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1、分类号：TP39单位代码：10183研究生学号：2015532098密级：公开吉林大学硕士学位论文(学术学位)基于转录组数据的癌症凋亡机理的研究ResearchontheMechanismoftheCancerApoptosisBasedontheTranscriptomeData作者姓名：杨柏楠专业：计算机应用技术研究方向：生物信息学指导教师：李瑛副教授培养单位：计算机科学与技术学院2018年5月基于转录组数据的癌症凋亡机理的研究ResearchontheMechanismoftheCancerApoptosisBasedontheTrans

2、criptomeData作者姓名：杨柏楠专业名称：计算机应用技术指导教师：李瑛副教授学位类别：学术硕士答辩日期：年月日未经本论文作者的书面授权，依法收存和保管本论文书面版本、电子版本的任何单位和个人，均不得对本论文的全部或部分内容进行任何形式的复制、修改、发行、出租、改编等有碍作者著作权的商业性使用（但纯学术性使用不在此限）。否则，应承担侵权的法律责任。吉林大学博士(或硕士)学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交学位论文，是本人在指导教师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或

3、撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》投稿声明研究生院：本人同意《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》出版章程的内容，愿意将本人的学位论文委托研究生院向中国学术期刊（光盘版）电子杂志社的《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》投稿，希望《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》给予出版，并同意在《中国博硕士学位论文评价数据库》和CNKI系列数据库中使用，同意按章程规定享受相关权益。论文级别：■硕士□博士学科

4、专业：计算机科学与技术学院计算机应用技术专业论文题目：基于转录组数据的癌症凋亡机理的研究作者签名：指导教师签名：年月日作者联系地址（邮编）：作者联系电话：摘要基于转录组数据的癌症凋亡机理的研究癌症是关乎人类健康的至要因素同时也是一个全球主要的死亡原因，据世卫组织统计，2004年全球癌症死亡人数达740万（约占所有死亡人数的13%）,若不予以适当干预，至2030年，死亡人数预计将达1200万。因此许多科学家和医务工作者长期致力于研究肿瘤发生发展的机理，试图找到有效的癌症预防、诊断、监测和治疗的手段。癌症是一种极其复杂、多方面的疾病，同时也是遗传易

5、感性、环境因素和生活方式综合作用的结果。癌症是一种不仅在基因组水平异常（基因突变、基因拷贝数异常，基因表达异常），同时也在表观基因组水平（基因甲基化）异常的高度异质性疾病,不同类型的癌症具有高度异质性，甚至在同一癌症患者中也是如此。随着生物信息学的不断发展以及人们对于癌症这一对人类威胁最大的疾病的重视，有关肿瘤的不同组学数据不断涌现，基于不同组学数据的肿瘤发生、发展及致病机理的研究引起了人们的广泛关注。凋亡途径的功能障碍是肿瘤的重要特征之一，逃避细胞凋亡（程序性细胞死亡）是癌症发生和发展的一个主要原因,对不同细胞凋亡异常机制的认识可以帮助我们找

6、到针对触发肿瘤细胞死亡的治疗策略。大量的科学研究结果表明，癌细胞的异常凋亡对早期癌症的发生和维持至关重要，而靶向凋亡过程在抗肿瘤治疗中将会起到重要作用。我们从GEO数据库下载了15种癌症的转录组数据，为了减少不同数据平台造成的数据偏差，转录组数据从同一平台选择。由于处理这种大规模数据需要慎重考虑质量、预处理（标准化）和每一步的高质量数据，我们收集了一个高质量的数据库，其中包括大量关于途径、主要生物学过程和转录因子、死亡结构域超家族以及与细胞凋亡有关的不同功能组的信息，并在不同尺度上系统的从基因水平、转录因子、GO通路水平上综合研究了这15种癌症

7、的细胞凋亡的失调机制，又对凋亡相关的基因预测了其是否可分泌入血液。从本文的综合分析来看，与细胞凋亡相关的差异表达基因对于大部分癌症显示出高度的特异性。在不同水平的生物功能和生物过程中，有一些特异性因素和共同因素能在不同范围内诱导细胞凋亡的失调。例如，所有的癌症似乎都经历了Toll信号传导途径失调和细胞凋亡诱导失调，但也有些癌症具有不同的特异性诱导机制，如胰腺癌是由氧化应激诱导的，脑癌是以响应化学刺激的方式诱导细胞凋亡，肝癌的细胞凋亡失调趋向于经历外源途径。I本研究表明，大规模水平上的多种癌症转录组数据的凋亡机制比较分析有助于探索肿瘤发生机制，为

8、临床提供更为有效的帮助。关键词：细胞凋亡,转录组,凋亡网络IIAbstractResearchontheMechanismoftheCancerApo