中国食源性副溶血性弧菌遗传多样性分析与冷胁迫研究

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1、博士学位论文中国食源性副溶血性弧菌遗传多样性分析与冷胁迫研究逆机理研究作者姓名谢腾飞学科专业微生物学指导教师吴清平研究员所在学院生物科学与工程学院论文提交日期2018年4月2日StudyongeneticdiversityandcoldstressoffoodborneVibrioparahaemolyticusinChinaADissertationSubmittedfortheDegreeofDoctorofPhilosophyCandidate：XieTengfeiSupervisor：ProfWuQingpin

2、gSouthChinaUniversityofTechnologyGuangzhou,China分类号：Q93学校代号：10561学号：201410105099华南理工大学博士学位论文中国食源性副溶血性弧菌遗传多样性分析与冷胁迫研究作者姓名：谢腾飞指导教师姓名、职称：吴清平研究员申请学位级别：理学博士学科专业名称：微生物学研究方向：食品微生物安全论文提交日期：2018年4月2日论文答辩日期：2018年5月24日学位授予单位：华南理工大学学位授予日期：年月日答辩委员会成员：主席：郭俊研究员委员：林章凛教授曾振灵教授胡超群

3、研究员傅建华教授华南理工大学学位论文原创性声明本人郑重声明:所呈交的论文是本人在导师的指导下独立进行研究所取得的研究成果。除了文中特别加以标注引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体己经发表或撰写的成果作品。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体,均己在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。作者签名:媳晡、日期:冫{冒年t月玷日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,即:研究生在校攻读学位期间论文工作的知识产权单位属华南理工大学。学校有权保存并向国家有关部

4、门或机构送交论文的复印件和电子版,允许学位论文被查阅(除在保密期内的保密论文外);学校可以公布学位论文的全部或部分内容,可以允许采用影印、缩印或其它复制手段保存、汇编学位论文。本人电子文档的内容和纸质论文的内容相一致。本学位论文属于:□保密,在~年解密后适用本授权书。√礻保密,同意在校园网上发布,供校内师生和与学校有共享协议的单位浏览;同意将本人学位论文提交中国学术期刊(光盘版)电子杂志社全文出版和编入CNKI《中国知识资源总库》,传播学位论文的全部或部分内容。”(请在以上相应方框内打吲)9V·△r作者签名:舳日期:%

5、l孑、磁坠指导教师签名:日期:氵钔pqr以Γ作者联系电话Π36∞⒆7电子邮箱:xhengfeixt1@qq·∞m联系地址(含邮编):广州越秀区先烈中路100号58栋SO5室(51oOT0)摘要副溶血性孤菌（Vibrioparahaemolyticus，VP），是弧菌科、孤菌属的革兰氏阴性菌，具有嗜盐性，广泛存在于海洋以及河口环境。主要通过食品传播，是遍布世界的食源性致病菌，人们食用污染的生的或未煮熟的海鲜而容易引起急性胃肠炎。本论文主要从全国熟食和水产品副溶血性弧菌污染调查和风险识别出发，研究分离株的血清型、耐药性、毒

6、力基因携带情况及分子分型等表型和遗传型特征。在此基础上，基因组测序获得代表性菌株较完整的遗传信息。最后，采用转录组与蛋白组联合分析，以揭示副溶血性弧菌在冷胁迫的整体调控过程。本论文的主要内容和研究结果如下：1、对全国43个城市的2531份水产品和熟食样品进行副溶血性弧菌的污染率和污染水平调查。显示整体污染率达到24.26%，平均MPN值为11.19MPN/g。夏季污染率为30.66%，显著高于冬季（17.66%）。南方地区的污染情况（尤其沿海地区）比北方地区严重（30.07%和13.99%）。水产品污染率较高（33.5

7、3%），在风险性较高的熟食样品中污染率也有5.79%，平均MPN值为1.62MPN/g。集贸市场的污染率（30.17%）显著高于超市，但监管较为严格的超市食品污染率也达到17.82%。因此，开展不同食品类型和环境中该菌污染的风险监测，并针对高风险节点开展风险评估和管理非常必要。2、完成39株熟食和150株华南地区水产品分离株的遗传多样性分析。熟食分离株的抗药性明显，有53.85%的菌株对超过两种抗生素有抗性；血清型O2最为普遍，发现有与大流行株相同的O3型；ERIC-PCR和MLST分型分簇明显，尤其MLST分型中发现

8、多个新的位点和ST型；华南地区水产品中副溶血性弧菌的污染率为43.75%，分离株中携带trh基因的比例为40.67%；40%为O2血清型；而ERIC-PCR分型揭示了不同来源菌株，临床株与食品株之间的相关性。链霉素、头孢唑啉和氨苄青霉素等耐药性最为明显，并且多重耐药菌株占有重要比例。3、完成19株副溶血性弧菌的全基因组测序，显示食