我国常见补血草属植物的叶绿体功能基因组研究

《我国常见补血草属植物的叶绿体功能基因组研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、分类号：P735学号：201500370001硕士学位论文我国常见补血草属植物的叶绿体功能基因组研究StudyonchloroplastfunctionalgenomicsofsomepopularspeciesinLimoniumMill研究生姓名：艾丽花指导教师：陈世华副教授学科门类：理学专业名称：海洋生物学论文提交日期：2018年4月1日烟台大学硕士学位论文摘要补血草属植物属于泌盐盐生植物，其叶绿体基因组研究对诠释此类植物的系统发育，适应盐胁迫相关的分子遗传机制具有重要意义。本研究选用采自黄渤海沿海滩涂地区的中华补血草，烟台补血草，采自内蒙地

2、区的二色补血草，青海地区的黄花补血草以及采自新疆地区的大叶补血草为实验材料。其中中华补血草和二色补血草在形态上不易区分、模式标本分布区域也非常相似，因此分别以同一区域形态差异较大的烟台补血草，中华补血草及不同区域的大叶补血草，黄花补血草为对照。利用分子生物学技术对其进行鉴定，并分析其叶绿体基因组组成、基因结构、编码区和非编码区序列组成、特点等，以此来确定它们之间的的系统发育、进化及系统发生与各物种耐受干旱及盐胁迫间的关系；其叶绿体基因功能的研究也对深入了解叶绿体编码基因在胁迫应答和光合作用中的功能具有重要意义。主要结果如下：1.5种补血草属植物的系

3、统进化分析。利用DNA条形码技术，基于核基因ITS，叶绿体基因psbA-trnH和trnL-trnF所建立的系统邻接树显示：对于中华补血草、烟台补血草、大叶补血草、黄花补血草、二色补血草及本地补血草样品1、2、3号8个样品，只有大叶补血草与其它7个样品亲缘关系较远，序列差异较大，用三对引物均可明显鉴别。而其他7个样品之间差别不大，无法利用ITS，psbA-trnH，trnL-trnF三对引物对其进行鉴定或对其系统进化关系进行分析。2.5种补血草属植物叶绿体基因组的高通量测序及叶绿体基因组组成、结构和功能分析。通过高盐低pH法对中华补血草叶绿体基因组

4、DNA进行提取和纯化，经高通量二代测序后，成功获得了5种中国常见补血草属植物的叶绿体基因组序列，通过对中华补血草叶绿体基因组组成进行分类，以及对5种补血草植物的叶绿体基因组组成进行比较分析，发现了66个共有蛋白编码基因，通过对66个共有基因进行比对，初步揭示了5种补血草属植物的进化关系。3.5种补血草属植物的耐盐、抗旱性分子机理探究。利用qRT-PCR技术分别对5种补血草属植物在200mmol/LNaCl盐胁迫和20％PEG-6000模拟干旱胁迫处理不同时间下atpA、psaA、psbA、petA、ndhA、POD、APXI烟台大学硕士学位论文和N

5、HX1基因的表达量进行分析，从分子层面对补血草属植物的耐盐抗旱机制进行了初步探究。关键词：补血草属植物；叶绿体基因组；DNA条形码；耐盐；抗旱II烟台大学硕士学位论文AbstractLimoniumMillbelongstosaltsecretinghalophytes.Thestudyofchloroplastgenomeisofgreatsignificancetothesystemdevelopmentofsuchplantsandthemoleculargeneticmechanismrelatedtosaltstress.Inthisst

6、udy,3species,Limoniumsinense(Girard)Kuntze,Limoniumbicolor(Bunge)Kuntze,LimoniumfranchetiiKuntzewerecollectedfromHuangbohaicoastalbeacharea,and2species,Limoniumgmelinii(Willd)KuntzeandLimoniumaureum(Linn)HillwascollectedfromXinjiangandQinghairegion.Thefirsttwospecieswerenoteas

7、ilydistinguishableinmorphology,andthedistributionareasofthemodelspecimenswerealsoverysimilar.Therefore,theywerecomparedwithLimoniumfranchetiiKuntze,Limoniumaureum(Linn)whitchcollectedfromthesameregionwhilehavingmarked,differencesinmorphology,andwithLimoniumgmelinii(Willd)Kuntz

8、ecollectedindifferentregionsasacontrol.Inordertodeterminethep