中国寄蝇科（双翅目）DNA条形码及线粒体全基因组研究

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1、＊？单位代码：１０１６６硕士学位论文中国寄蝇科（双翅目）ＤＮＡ条形码及线粒体全基因组研究论文作者：学科专业：动物学指导教师：张春田杨定培养单位：生命科学学院培养类别：全曰制完成时间：２０１８年５月３１曰沈阳师范大学学位评定委员会全日制研究生编号：类教育硕士别同等学力硕士学位论文题目：中国寄蝇科（双翅目）DNA条形码及线粒体全基因组研究培养单位：生命科学学院专业名称：动物学指导教师：张春田杨定教授研究生：李新.完成时间：2018年

2、05月16日沈阳师范大学研究生处学位论文独创性声明本人所呈交的学位论文是在导师的指导下取得的研究成果。据我所知，除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含其他个人己经发表或撰写过的研宄成果。对本文的研宄做出重要贡献的个人和集体，均己在文中作了明确说明并表示了谢意。－－作者签名：今私日期：２０１８６３ｚ［学位论文使用授权声明本人授权沈阳师范大学研宄生处，将本人硕士学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索；有权保留学位论文并向国家主管部门或其指定机构送交论文

3、的电子版和纸质版，允许论文被查阅和借阅；有权可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。保密的学位论文在解密后适用本规定。日期－－作者签名：２０１８６３：摘要寄蝇科（Tachinidae）昆虫是双翅目物种多样性最大的科之一，目前国际最新分类系统记录世界寄蝇科有4亚科58族1500属约8500个有效种，中国记录有4亚科42族285属1253种，占全世界属、种的19.00%，14.74%。寄蝇科内物种多样性高，外部形态复杂性和趋同现象使得寄蝇科昆虫鉴定困难，而且重复

4、性鉴定工作量巨大。DNA条形码物种鉴定利用COI前段658bp长度的标准目的基因进行快速的物种鉴定，其原理是假设物种内部遗传距离差异远小于物种间的遗传差异，依据遗传距离的不同进行物种的快速区分。本研究提取了143头中国寄蝇科昆虫的核酸序列，经PCR实验和筛选后，最终获得74形态种108条序列。使用8种方法（NJ树、jMOTU、ABGD、TaxonDNA、bPTP、BarcodingR、GMYC、BLOG）进行DNA条形码技术在寄蝇科昆虫快速鉴定的适用性研究，并构建寄蝇科DNA条形码数据库。各DN

5、A条形码鉴定程序鉴定结果如下：jMOTU鉴定成功率为94.44%；ABGD为91.67%；SpeciesIdentifier中BestMatch/BestCloseMatch/Cluster为98.03%,94.11%,81.48%；bPTP为79.63%；BarcodingR中的Bayesian、fuzzyId、bpNewTraining分别为96.55%，86.21%，89.66%；GMYC为89.81%；BLOG为73.68%。分析结果表明：DNA条形码技术在寄蝇科中的鉴定成功率高，但在一

6、些物种中存在鉴定模糊的问题，仍需要进行少量的人工辅助鉴定。从鉴定结果来看，TaxonDNA中的BestMatch方法鉴定成功率98.03%为最高，BarcodingR中的Bayesian方法鉴定成功率为96.55%。推荐使用这两种软件进行寄蝇科DNA条形码的分析研究和物种快速鉴定，而且前者操作难度更低。构建的数据库很好的鉴定出本实验涉及的寄蝇科昆虫，说明了数据库的有效性，为日后的研究提供实践基础。测定并注释了首个突颜寄蝇亚科线粒体全基因组代表种圆腹异突颜寄蝇Ectophasiarotundive

7、ntris(Loew,1858)，序列全长（不含控制区）为14,843bp，包含37个基因；构建圆腹异突颜寄蝇以及包括丽蝇科的丝光绿蝇Luciliasericata和麻蝇科的肥须麻蝇Sarcophagacrassipalpis作为外群共7种线粒体全基因组数据的NJ和ML方法的系统发育树，支持寄蝇科Tachinidae和追寄蝇亚科Exoristinae的单系性；突颜寄蝇亚科Phasiinae作为基部分支，与长足寄蝇亚科和追寄蝇亚科（Dexiinae+Exoristinae）为姊妹群。关键字：COI

8、分子鉴定；遗传距离阈值；线粒体全基因组；系统发育IAbstractTachinidaeisoneofthemostspeciesdiversefamiliesinDiptera,thelatestinternationaltaxonomysystemrecordthatthereare4subfamilies,58tribes,1500genera,about8500validspeciesofworld,and4subfamilies,42tribes,285genera,1253specie