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时间:2019-05-10
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1、第十章微生物系统进化与分类1界、门、纲、目、科、属、种种是最基本的分类单位每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科...一、通用分类单元2以啤酒酵母为例,它在分类学上的地位是:界(Kindom):真菌界门(Phyllum):真菌门纲(Class):子囊菌纲目(Order):内孢霉目科(Family):内孢霉科属(Genus):酵母属种(Species):啤酒酵母31种(species):是一个基本分类单位;是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近,与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。根据16SrRN
2、A序列分析,同源性>97%的两个原核微生物很可能是同一个种。典型菌株、模式种。2菌株(strain):表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一切后代(起源于共同祖先并保持祖先特性的一组纯种后代菌群)。因此,一种微生物的不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。菌株强调的是遗传型纯的谱系。例如:EscherichiacoliB和EscherichiacoliK1243亚种(subspecies):当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传形状,而又不足以区分成新种时,可以将这些菌
3、株细分成两个或更多的小的分类单元——亚种。变种是亚种的同义词,因“变种”一词易引起词义上的混淆,从1976年后,不再使用变种一词。通常把实验室中所获得的变异型菌株,称之为变种。如:E.colik12(野生型)是不需要特殊aa的,而实验室变异后,可从k12获得某aa的缺陷型,此即称为E.colik12的变种。4型(form):常指亚种以下的细分。当同种或同亚种内不同菌株之间的性状差异不足以分为新的亚种时,可以细分为不同的型。例如:按抗原特征的差异分为不同的血清型。5(一)生物的界级分类学说动物界植物界林奈动
4、物界植物界原生生物界Haeckel植物界动物界原始生物界菌界Copeland植物界动物界原核生物界原生生物界真菌界Whittaker五界上加上病毒界王大耜细菌域古生菌域真核生物域美国Woese二、微生物在自然界的地位776病毒界动物界植物界真菌界原核生物界原生生物界微藻类原生动物细菌古细菌放线菌衣原体支原体立克次氏体螺旋体蓝细菌病毒亚病毒朊病毒7生物的界级分类学说:是在认识发展过程中存在的对生物分类的不同阶段的不同观点。如:二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六界系统和三原界系统三原界系统是1978年由
5、R.H.Whittaker和L.Margulis提出的。所有生物存在一个共同祖先,由它分三条进化路线,就形成了三个原界:古细菌原界(Archaebacter)、真细菌原界、真核生物原界提出了内共生学说8三原界系统示意图910三、各大类微生物的分类系统纲要原核生物分类系统纲要——伯杰氏系统细菌学手册真菌界分类系统很多,各国采用不同的系统,比较混乱。近年来为较多人接受的是Ainsworth的纲要。11《伯杰氏手册》简介美国的《伯杰氏鉴定细菌学手册》编写者集国际学术界的权威学者,为各国微生物分类学界公认的一本经典
6、佳作。第一版1923年出版,后一直再版至今,先后修订出版了11个版本,1974年出版了第八版,1994年已出至第九版,由于G+Cmol%测定、核酸杂交和16SrRNA寡核苷酸序列测定等新技术和新指标的引入,使原核生物分类从以往以表型、实用性鉴定指标为主的旧体系向鉴定遗传型的系统进化分类新体系逐渐转变,现书名已改为《伯杰氏系统细菌学手册》,(Bergey’MamualofSystematicBacteriology),简称《系统手册》20世纪初德国Lehmann和Neumann的《细菌分类图说》前苏联克拉西尔
7、尼可夫的《细菌与放线菌的鉴定》法国A.R.Prevot的《细菌分类学》12生物学特性原核生物真核生物细胞结构细胞核无核膜、核仁,单个染色体,无组蛋白有核膜、核仁,多条染色体,DNA与组蛋白结合细胞壁大多数含肽聚糖无肽聚糖细胞膜一般无甾醇常含甾醇内膜简单,有中介体复杂,有内质网核糖体70S(50S+30S)80S(胞浆),70S(线粒体)线粒体无有其他细胞器无多种鞭毛结构简单复杂(“9+2”型)遗传特性细胞分裂方式横二分裂有丝分裂或减数分裂繁殖方式横二分裂无性或有性,方式多种遗传重组方式接合、转化或转导有性方
8、式生理生化氧化磷酸化部位细胞膜线粒体固氮作用有些有无胞吞/胞吐作用无有1314四、微生物的鉴定15数值分类法即统计分类法,在200年前M.Adanson(1727~1806,法国植物学家)发表的分类原理基础上结合现代计算机技术发展而来的。主要观点:在一个分类群中,其所含信息量越大,即分类所依据的性状越多,其分类效果也越好;顺序建立自然分类单元时,每个性状都是等权的;任何两分类实体间的整体相似性,都是由每一对的相似
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