二代测序原理与技术(IonProton)

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1、IonProton™Sequencer——基研生物国内率先引进二代半测序平台1

2、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidentialIonProtonSystem的测序原理IonProtonSystem2

3、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential芯片就是测序仪-----后光学原理半导体测序扩展迅速、反应灵敏符合半导体行业摩尔定律通用试剂与测序芯片自由组合测序速度快最快12小时测序时间3

4、IonTorrentbyLifeTechnologies™Proprieta

5、ryandConfidentialIonPI™芯片适用于全外显子组或全转录组测序IonPII™芯片适用于人类全基因组测序IonPI™ChipIonPII™Chip165Mwells660Mwells10Gbfor2Exomes20Xhumangenome目前实测：60-80M目前实测：240-320MFilteredReadsFilteredReads4hoursRunsinHours4

6、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential测序原理简单----后光学原理直接检测氢离子，无需荧光检测5

7、IonTorrentbyLif

8、eTechnologies™ProprietaryandConfidential高通量芯片内进行测序反应dNTPH+∆pH∆QSensingLayerSensorPlate∆VBulkDrainSourceSiliconSubstrateRothbergJ.M.etalNaturedoi:10.1038/nature102424种dNTP依次流过Ion芯片DNA聚合反应产生的氢离子的直接检测每个碱基的检测只需要几秒6

9、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential芯片示意图7

10、IonTorrentbyLifeTechn

11、ologies™ProprietaryandConfidential1.依次掺入四种碱基8

12、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential2.碱基配对结合9

13、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential3.释放氢离子10

14、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential4.读取模版碱基11

15、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential

16、5.连续两个相同碱基结合12

17、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential6.读取模版的连续两个相同碱基13

18、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential7.芯片上几十万、几百万甚至上千万个DNA片段同时读取序列信息14

19、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential7.芯片上几十万、几百万甚至上千万个DNA片段同时读取序列信息15

20、IonTorrentbyLifeTechnologies™Pr

21、oprietaryandConfidential新一代Ion半导体高通量测序平台原理及其特点IonProtonSystem的特点16

22、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential一天之内完成从样本制备到测序数据产生全部流程IonKitsIonProton™IonProton™SequencerProton™TorrentServerOneTouch2System17

23、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidential测序流程介绍制备测油包水收集纯上机测序数据分析序

24、文库相扩增化磁珠2小时5小时12小时0.5小时测序速度快，随到随测18

25、IonTorrentbyLifeTechnologies™ProprietaryandConfidentialIonProton与Hiseq2000技术指标比较CriteriaProtonHiseq2000测序原理电位检测原理光学检测原理单端测序读长200bp（还有提升空间）100bpHiseq2000公开的招标参数上描述单次测数据准确性单次测序原始数据准确性9