《microRNA定量检测》PPT课件

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1、August04,2021MicroRNA定量检测--技术讲座南宁科迪生物技术有限公司04August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA2主要内容microRNA基础知识介绍12microRNA数据库及其应用3microRNA定量检测4microRNA功能验证04August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA31.MicroRNA的特征及功能2.MicroRNA的作用原理及解决方案MicroRNA基础知识1MicroRNA基础知识介绍04August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA4MicroRNA的发

2、现Lin-14Lin-41.C.elegansLeeRC，FeinbaumRL，AmbrosV．TheC．elegansheterochronicgenelin-4encodessmallRNAswithantisensecomplementaritytolin-14．Cell．1993，75：843-8542.C.elegans：let-7ReinhartBJ，SlackFJ，BassonM，etal．The21-nucleotidelet-7RNAregulatesdevelopmentaltiminginCaenorhab

3、ditiselegans．Nature.2000，403：901-90604August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA5MicroRNA的特征22-23nt（19-24nt）单链调控基因表达稳定存在存在于细胞质中04August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA6MicroRNA的特征04August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA7MicroRNA的功能•发育•Timing(Leeetal.1993)•Cellproliferation(Brenneckeetal.2003)•Stemcell&n

4、euron(Krichevskyetal.2003;Hatfieldetal.,2005)•细胞凋亡(Baehrecke,2003)•疾病•肿瘤(Luetal.2005)•原癌miRNA(Heetal.2005)•脑肿瘤(Ciafreetal.2005;Chanetal.2005)•白血病(Calinetal.2002;2004)•糖尿病(Poyetal.2004)•胆固醇的生物合成(Krutzfeldtetal.2005)•DNA甲基化与染色质修饰(Baoetal.2004)04August2021南宁科迪技术讲座之Micro

5、RNA8MicroRNA的作用原理04August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA9MicroRNA的作用原理04August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA10microRNA研究解决方案-发现新MiRNA发现新的microRNA分离MicroRNATaKaRaD304RNAisoforSmallRNAmicroRNA克隆TaKaRaDRR065SmallRNACloningKit测序Solidsequence04August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA11microRNA研究解决方案-MiR

6、NA的检测目前有很多与癌症临床诊断相关的研究在进行中。定量PCR的方法由于其灵敏度高，需要样品量少，而被广泛应用。MicroRNA的检测方法04August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA12microRNA研究解决方案-MiRNA的检测MiRNA的定量检测数据库查询MiRNA功能验证04August2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA13MicroRNA数据库及其应用2MicroRNA数据库及其应用1.microRNA数据库2.microRNA数据查询与使用3.microRNA靶基因的预测与验证04August

7、2021南宁科迪技术讲座之MicroRNA14microRNA靶标数据库数据库名字数据库描述数据库类型网页链接targetScantargetScan搜寻动物的microRNA靶基因。database,webserverhttp://www.targetscan.orgstarBasestarBase从高通量的CLIP-Seq实验数据（CLIP-Seq和HITS-CLIP）和降解组实验数据中（degradomesequencing）搜寻micorRNA的靶标。提供了各式各样的可视化界面去探讨microRNA的靶标。databas

8、ehttp://starbase.sysu.edu.cnPicTarPicTar联合的microRNA靶标预测。database,webserver,predictionshttp://pictar.mdc-berlin.de/PITAPITA基于靶位点的可接性