大白菜遗传图谱构建及抗TuMV的QTL分析

《大白菜遗传图谱构建及抗TuMV的QTL分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、山东农业大学硕士学位论文大白菜遗传图谱构建及抗TuMV的QTL分析姓名：王美申请学位级别：硕士专业：蔬菜学指导教师：孟祥栋;樊治成2003.5.20关于学位论文原创性和使用授权的声明本人所呈交的学位论文，是在导师指导下，独立进行科学研究所取得的成果。对在论文研究期间给予指导、帮助和做出重要贡献的个人或集体，均在文中明确说明。本声明的法律责任由本人承担。‘本人完全了解山东农业大学有关保留和使用学位论文的规定，同意学校保留和按要求向国家有关部门或机构送交论文纸质本和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权山东农业大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或

2、其他复制手段保存论文和汇编本学位论文。保密论文在解密后应遵守此规定。论文作者签名：至盖导师签名：数戋日gl-趔：』：世摘要本研究以大白菜高抗TuMV白心株系91．112和高感TulVIV桔红心株系T12．19为亲本建立的100个小孢子培养DH系作为图谱构建群体，构建了AFLPs、RAPDs和SSRs分子标记连锁遗传图谱，并在此基础上进行了大白菜TuMV抗性基因的QTL定位。主要研究结果如下：(1)对不同标记用于遗传图谱构建的效率进行了评价。帆64对AFLP引物组合中筛选出20对扩增清晰、再现性好的多态性引物，平均每对AFLP引物组合扩增出13．2个多态性谱带：SSR从15个引物对中筛选

3、出6对多态性引物，产生17个多态性谱带，平均每个引物对扩增出2．8条多态性谱带；RAPD中从500个随机引物中筛选出99个多态性引物，共扩增出150个多态性位点，平均每个引物产生1．5，条多态性带。由此可以判断，多态性检出效率为AFLP>SSR>RAPD。y(2)对263个AFLP标记，150个RAPD标记和17个SSR标记共430个标记用JoinMap3．0软件进行分析k姆到一张包含376个标记10个连锁群的遗传图谱，图谱总长度为809．1c衍(235个AFLP标记，129个RAPD标记，10个SSR标记，1个SCAR标记和1个桔红心形态标记)，标记间平均图距为2．2cM。每个连锁群

4、上的标记数在7～91之间，长度位于26．4—145．9cM之问。y，(3)对DH群体标记的来源进行了分析。阳于构建图谱的235个AFLP标记中，来自91．112的标记较多，有144爪＼占61．3％；来自T12．19的标记有91个，占38．7％。10个SSR标记中，来自91-112的标记有6个，占60％，来自T12．19的标记占40％，可见SSR产生的标记也是主要来自91-112。而在RAPD扩增中，来自91．112和T12．19的标记分别为65个和64个，比例相当。但整体看来，在连锁群的376个标记中，来自91．112的标记215个，占57．2％，来自T12．19的标记160个，占42

5、．8％，两者比例基本持平。y王美：大白菜遗传图涪构建及抗TuMV的QTL分析(4)DH群体中不同的标记产生的偏分离比例也不相同。l所构建的lo个连锁群中，共产生149个偏分离标记，占39-8％，其中在Ⅺ．Ol水平上的偏分离标记占25．9％，在O．05水平上的占13．9％。AFLP共产生97个偏分离标记，占所有AFLP标记总数的42．2％。其中偏向91-112的有52个，占53．6％，偏向T12．19的有45个，占46．4％，有偏向91．112的趋势。SSR产生的标记中有29．4％的偏分离比例，偏向9l-112的占40％。RAPD共产生47个偏分离标记，占标记总数的33．3％，其中偏向9

6、1．112的有18’个，占38．3％。由此可见，RAPD和SSR产生的偏分离标记主要偏向T12．19。从整体来看，3种标记产生的149个偏分离标记中，偏向91．112的有72个，偏向T12．19的有77个，分别占48．3％和51．7％，基本持平y(5)利用JoinMap3．0软件和区间作图法分析，共检测到4个抗北京TuMV．C4株系的QTLs位点。f其中2个QTLs与白菜苗期抗性(人工接种鉴定)有关，命名为TuI和Tl过一个位于连锁群LG5a上，能解释表型变异的61．O％，当Tul表现亲本9l-112(高抗TuMV)的基因型时，具有降低病情指数lO．61％的加性效应。另～个位于LG9上

7、，能解释表型变异的14．7％，当Tu2表现亲本T12．19基因型时，具有增加病情指数5．22％的加性效应。表明除该2个QTLs位点外，可能还有许多效应值较小的QTLs没有检测到。田间成株期自然接种鉴定时检测到了另外的2个QTLs位点，一个位于LG3上，命名为Tu3，能解释表型变异的48．S％，当它表现亲本91-112的基因型时，能导致病情指数降低26．33％。另一个位于LG4上，命名为Tu4，能解释表型变异的32．0％，当它表现亲本T12．19