《CR的种类及应用》PPT课件

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1、PCR的种类及应用学号:21014017王志慧序2021/9/141PCR的历史操作过程引物步骤PCR的各种变体PCR的应用鉴定基因亲子鉴定诊断遗传病克隆基因诱变分析远古DNA鉴定特定表型的突变体基因比较基因表达量目录2021/9/143PCR这项技术是由凯利·穆利斯(KaryMullis)发明,并因此在七年之后,1993年10月,获得了诺贝尔化学奖该项殊荣。穆利斯的想法是,利用一种人工方法,和反复相同程序的方法,并利用一种特殊的酶——即DNA聚合酶来扩增特定的DNA片段。PCR历史2021/9/14DNA的复制DNA在复制时,双链DNA解旋成两股分别

2、进行。其复制过程的复制起点呈现叉子的形式,故称复制叉。以复制叉向前移动的方向为标准,一条模板链为3’—〉5’走向,在其上DNA能以5’—〉3’方向连续合成,称为前导链(leadingstrand);另一条模板链为5’—〉3’走向,在其上DNA也是5’—〉3’方向合成,但与复制叉移动的方向正好相反,故随着复制叉的移动形成许多不连续的冈崎片段,最后在连成一条完整的DNA链,该链称为后随链(laggingstrand)。2021/9/145①5’→3’的聚合作用:不是复制染色体而是修补DNA,填补DNA上的空隙或是切除RNA引物后留下的空隙。②3’→5’的外

3、切酶活性:消除在聚合作用中掺入的错误核苷酸。③5’→3’外切酶活性:切除受损伤的DNA,可用于切口平移(nicktranslation).大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ的Klenow片段是完整的DNA聚合酶Ⅰ的一个片段,只有在5’→3聚合酶活性和3’→5’外切酶活性,失去了5’→3外切酶活性。它可用于填补DNA单链末端成为双链。DNA聚合酶TaqDNA聚合酶是从一种水生栖热菌(Thermusaquaticus)yT1株分离提取的.yT是一种嗜热真菌,能在70-75℃生长.存在于水生嗜热菌(Thermusaquaticus)的嗜热DNA聚合酶,可在74℃复制DN

4、A,在95℃仍具有酶活力。该酶可在离体条件下,以DNA为模板,延伸引物,合成双链DNA。这个酶只有5′→3′DNA聚合酶活性和5′→3′的外切酶活性,缺少3′→5′的外切酶活性。该酶基因全长2496个碱基,编码832个氨基酸,酶蛋白分子为94KDa.其比活性为200000单位/mg.75~80℃时每个酶分子每秒钟可延伸约150个核苷酸,70℃延伸率大于60个核苷酸/秒,55℃时为24个核苷酸/秒.温度过高(90℃以上)或过低(22℃)都可影响TaqDNA聚合酶的活性,该酶虽然在90℃以上几乎无DNA合成,但确有良好的热稳定性,在PCR循环的高温条件下仍

5、能保持较高的活性.TaqDNA聚合酶2021/9/147PCR(PolymeraseChainReaction)即聚合酶链式反应,是一种在体外快速扩增特定基因或DNA序列的方法,故又称为基因的体外扩增。它可以在试管里建立反应,经过数小时之后,就能将极微量的目的基因或者某一特定的DNA片段扩增数十万倍,乃至千百万倍,而无需通过繁琐费时的基因克隆程序,便可获得足够数量的精确的DNA拷贝,所以有人亦称为无细胞的分子克隆法。PCR的定义PCR操作过程1、预变性(Initialdenaturation).  模板DNA完全变性对PCR能否成功至关重要,一般95℃

6、加热3-5分钟。2、引物退火(Primerannealing)  退火温度一般需要凭实验(经验)决定。  退火温度对PCR的特异性有较大影响。3、引物延伸  引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。  延伸时间随扩增片段长短而定。4、循环中的变性步骤  循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列完全变性:  变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败。5、循环数  大多数PCR含25-35循环,过多易产生非特炖条带6、最后延伸  在最后一个循环后,反应在72℃维持5-15分钟.使引物延伸完全,并使单链产物退火成双链。引物设计

7、设计引物可以采取以下原则:GC所占比例为40%-60%两个引物的Tm,相差小于5℃,并且扩增产物的Tm与引物的相差不超过10℃。黏合温度通常比计算的最低Tm低5℃,但是要根据经验为不同条件下的PCR选择不同的黏合温度。内部的具有自身互补性的发卡结构不超过4个,其二聚体中不超过8个。3‘末端尤其重要,必须不含有与其他引物互补的序列,并且要与模板完全互补。倒数第二个最好是G/CPCR的各种变体反向PCR(InversePCR,IPCR)不对称PCR(asymmetricPCR)多重PCR荧光定量PCR(Q-PCR)反转录PCR(reversetranscr

8、iption,RT-PCR)巢式PCR(NESTPCR)递减PCR(TouchdownPCR)

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