不同小麦品种的ssr多态性分析 毕业论文

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1、目录摘要11.材料与方法21.1材料21.1.1实验仪器21.2方法21.2.1DNA的提取与检测21.2.2DNA的扩增与检测31.2.3数据处理32.结果与分析32.1遗传多样性分析32.2遗传差异42.3聚类分析43.讨论4参考文献5致谢6I不同小麦品种的SSR多态性分析摘要:利用SSR技术对10个小麦、1个玉米草、1个玉米品系进行遗传多样性分析,不同位点在品系间的等位基因数为1-7,平均每个位点有4.5个等位变异基因,小麦2F-4、2F-5、2F-7等位基因数目相同,而2F-2与2F-6、2F-5与2F-7、2F-1与2F-3种间的亲缘关系较近。通过用DPS数据处理系统和

2、MEGA5.1软件建立小麦不同品种(系)与玉米草和玉米的遗传进化关系,小麦品系中2F-8在系统进化上与其他小麦品系间的遗传差异比较大,亲缘关系较远。关键词:小麦;进化;SSR;遗传差异SSRPolymorphismAnalysisofdifferentwheatvarietiesAbstract:SSRgeneticdiversityof10wheat,acorngrass,maizelines,differentsitesinthenumberofallelesbetweenstrains1to7,withanaverage4.5perlocusallelesgeneswhea

3、t2F-2F-5,thesamenumberof2F-7allele,and2F-2,and2F-6,5and2F-2F-7,2F-1with2F-3speciesofthephylogeneticrelationshipbetweenthecloser.DPSDataProcessingSystem,andMEGA5.1softwaretoestablishdifferentwheatvarieties(lines)andcorngrassandmaizegeneticevolutionaryrelationshipswheatlines2F-8onphylogenetican

4、dgeneticdifferencesbetweenotherstrainsofwheatisrelativelylarge,kindistantlyrelated.Keywords:wheat;evolution;simplesequencerepeat;geneticdiversity小麦是世界上产量最高、种植面积最大和贸易量最多的粮食作物。在我国小麦的总产量仅次于水稻和玉米,在国家粮食安全中具有重要地位。到2011年,我国粮食产量实现了八连增,小麦起着很重要的作用[1]。SSRS(Simplesequencerepeats)简单序列重复,亦称微卫星DNA(microsate

5、lliteDNA)是近年来发展起来的建立在PCR基础上的第二代分子标记,它是一类短的串连重复序列基序(1-6个核苷酸)组成的简单重复序列,为共显性标记,均匀地分布在整个真核生物基因组中,侧面有保守的DNA序列。由于重复基序的数目变化大,显示出较强的多态性。目前已发展起来的分子标记有RFLP、RAPD、AFLP、SSR和STS等。微卫星DNA已被用于大麦、大豆、水稻、小麦的遗传多样性研究。由于SSRS的等位基因数比其它任何标记所揭示的等位基因都多,且SSR等位基因数目与重复单位数目有明显的正相关,SSR序列位点标记比RFLP和RAPD标记更能有效地揭示遗传多样性,特别适用于其它类型

6、标记所揭示变异水平低的物种。SSRS是较理想的遗传标记,尽管做起来需要设计和合成引物,花费较大,但是由于它具有①异常丰富;②随机均匀地分布在整个基因组;6③多态性强;④可通过PCR迅速测定分析,易于使用;⑤引物序列公开发表易在各实验室中广为传播使用等特点。使得SSRS特别适用于大量样本的研究,为群体及进化研究,提供了强有力的工具[2]。目前,SSR已经成为小麦最为常用和高效的分子标记系统。SSR标记多态性丰富,随机分布在小麦整个基因组中,在小麦近缘种属中SSR标记已被广泛应用[3]。本实验采用CTAB方法对10个小麦品系、1个玉米草、1个玉米的DNA进行提取,采用WMC382引物

7、对不同品系的小麦、玉米草、玉米进行PCR,通过DPS数据处理系统和MEGA5.1软件对不同品系的PCR的结果进行比较、小麦的遗传多样性分析,并探讨不同小麦品种的亲缘关系,从而对不同小麦品种进行归类和分类提供可能,以期为小麦育种、定位目的基因、鉴定和标记染色体片段、鉴定品种、遗传多样分析和标记等方面提供新的依据[4]。1材料与方法1.1材料1.1.1实验仪器冰冻高速离心机(Eppendorf5417C/R基因有限公司生产)、电热恒温水浴锅,电泳仪(DYCZ-40D苏州江东精密仪器有

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