蛋白质相互作用界面热点残基的预测研究方法

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1、‘．密级！．保密巧巧：ｙ告Ａ乂爹硕±学位论文蛋白质相互作用巧面热点残基的预測研究方法Ｔｈｅｒｅｓｅａｒｃｈｏｆｔｈｅｍｅｔｈｏｄｔｏｒｅｄｉｃｔｈｏｔｓｏｔｓｉｎｐｐｒｏｔｅｎ－ｒｏｎｎｐｉｐｔｅｉｉｔｅｒｆａｃｅ学号Ｚ１３２０１０３９一－—－名邸巧扩学位类别工学硕±模式识别与智能系统ｆ工黯造指导教师郑春厚完成时间２０１６年５月答辩委员会；主席签名４（１Ｍ？５独创性声明本人声明巧呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除

2、了义中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人巨经发表或撰写过的巧究成果，化不包含为获得或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与巧一同工作的罔志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论义作者签名＊：签字日期：７＾＾年＾月０日／＾学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解有关保留、使用学位论文的规定，有权巧留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和碰盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权可Ｗ将学位论文的全部式部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保巧、汇编学位论文。（保密的学位论文在解密后适用

3、本授权书）学化论文作者签名：师签名畔之旅导：多良糸唇。签字日期：＞／《年夕月日签字日期：曰学位论文作者毕业去向：工作单位：电话：通讯地址：邮编：＾摘要蛋白质－蛋白质之间相互作用在细胞功能的各个方面如新陈代谢和信号传导中起着至关重要的作用。对蛋白质相互作用的分子机制的研究表明蛋白质界面上小部分残基对结合自由能的贡献很大，并且它们对维持蛋白质的稳定起着积极的作用。鉴别蛋白质作用界面的热点残基对于药物设计和研究癌症具有非常重要的意义。目前通过生物实验技术来发现热点残基的方法，因其代价高不能被广泛，的应用，因此，需要利用机器学习的方

4、法来研究热点残基预测的问题。一１０８本文提出了种可靠的热点残基预测的方法。针对每个残基，本文提取种序列、结构和残基的微环境特征（包括传统的恃征及本文中提出的伪疏水性，包括最小冗余最大相关性算法和穷举法特征）。然后利用两步特征选择法，选择出最佳的３个特征。本文利用支持向量机来构建模型。和其他预测方法比较，本文的预测结果是最好的，Ｆ１和ＭＣＣ分别达到了０．７０和０．４６。预测结果表明，通过本文的方法选取的３个特征比那些传统的特征更加有效，同时表明，结构和物理化学方面的特征是区分热点残基的重要特征。：热点残基关键词；蛋白质界面；伪疏水性；支持向量Ｉ

5、ＡＢＳＴＲＡＣＴＡｂｓｔｒａｃｔｔ－ｔｔＰｒｏｅｉｎｒｏｔｅｉｎｉｎｔｅｒａｃｉｏｎｓｌａｙａｃｒｉｉｃａｌｒｏｌｅｉｎｎｅａｒｌａｌｌａｓｅｃｔｓｏｆｃｅｌｌｕｌａｒｐｐｙｐｆｕｎｃｔｉｏｎｓｓｕｃｈａｓｍｅｔａｂｏｌｉｓｍａｎｄｓｉｎａｌｔｒａｎｓｄｕｃｔｉｏｎ．Ｓｔｕｄｉｅｓｏｆｍｏｌｅｃｕｌａｒｇｔ－ｔｔｍｅｃｈａｎｉｓｍｓｆｏｒｐｒｏｅｉｎｐｒｏｅｉｎｉｎｅｒａｃｔｉｏｎｓｒｅｖｅａｌｅｄｔｈａｔｏｎｌｙａｓｍａｌｌｓｕｂｓｅｔｏｆｂｉｎｄｉｎｎｔｅｒｎａｍｅｔｓｏｔｓａｃｃｏｕｎｔｆｏｒ

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