秦川牛脂肪组织转录组学研究及长链非编码rna的筛选与鉴定

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1、分类号：S813.3学校代码：10712UDC：636.03研究生学号：2012060131密级：公开2015届攻读博士学位研究生学位（毕业）论文秦川牛脂肪组织转录组学研究及长链非编码RNA的筛选与鉴定学科专业动物遗传育种与繁殖研究方向：动物育种原理与方法研究生刘宇指导教师：刘小林教授完成时间：2015年4月中国陕西杨凌Classificationcode:S813.3Universitycode:10712UDC:636.03Postgraduatenumber:2012060131Confidentialitylevel:PublicDissertationforDoctorDegre

2、eNorthwestA＆FUniversityin2015TRANSCRIPTOMEANALYSISANDIDENTIFICATIONOFLONGNONCODINGRNAINADIPOSETISUUESOFQINCHUANBEEFCATTLEMajor:AnimalAnimalGenetics,BreedingandReproductionResearchfield:PrincipleandMethodofAnimalBreedingNameofPostgraduate:LiuYuAdviser:Prof.XiaolinLiuDateofsubmission:May2015Yangling

3、ShaanxiChina本研究由以下项目资助完成国家“十二五”科技计划重大项目（编号：2011AA100307）国家科技计划重大项目“863”课题（编号：2008AA101010）陕西省“13115”科技创新工程项目（编号：2008ZDKG-11）研究生学位（毕业）论文的独创性声明本人声明：所呈交的博士学位（毕业）论文是我个人在导师指导下独立进行的研究工作及取得的研究结果；论文中的研究数据及结杲的获得完全符合学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》，如果违反此规定，一切后果与法律责任均由本人承担。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写

4、过的研究结果，也不包含其他人和自己本人已获得西北农林科技大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同事对本研究所做的任何贡献均已在论文的致谢中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:时间：tWI年#月'^曰导师指导研究生学位（毕业）论文的承诺所呈交的博士学位（毕业）论文是在我指导乂71取^九九^果，属于我现岗职务工作的结杲，并严格按照学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》而获得的研究结果。如果违反学校《关于规范西北农林科技大学研究生学术道德的暂行规定》，我愿接受按学校有关规定的处罚处理并承担相应导师连带责任。关于研究生学位（毕业）论文使用授权的说明本学位

5、（毕业）论文的知识产权归属西北农林科技大学。本人同意西北农林科技大学保存或向国家有关部门或机构送交论文的纸质版和电子版，允许论文被查阅和借阅；同意西北农林科技大学将本学位（毕业）论文的全部或部分内容授权汇编录入《中国博士学位论文全文数据库》进行出版，并享受相关权益。本人保证，在毕业离开（或者工作调离）西北农林科技大学后，发表或者使用本学位（毕业）论文及其相关的工作成果时，将以西北农林科技大学为第一署名单位，否则，愿意按《中华人民共和国著作权法》等有关规定接受处理并承担法律责任。任何收存和保管本论文各种版本的其他单位和个人(包括研究生本人)未经本论文作者的导师同意，不得有对本论文进行复制、修

6、改、发行、出租、改编等侵犯著作权的行为，否则，按违背《中华人民共和国著作权法》等有关规定处理并追究法律责任。(保密的学位论文在保密期限内，不得以任何方式发表、借阅、复印、缩印或扫描复制手段保存、汇编论文）时间：79$年办月L日研究生签名:叫!导师签名：f时间：年谷月义曰秦川牛脂肪组织转录组学研究及长链非编码RNA的筛选与鉴定摘要牛脂肪生成过程受到多种调节因子的共同作用，通过对参与脂肪生成过程的关键调节基因以及功能元件的进一步挖掘，能够帮助研究人员更好的理解牛脂肪生成过程中的分子调控机制，从而为肉牛育种工作服务。基于此，本研究以20月龄秦川母牛皮下脂肪组织、内脏脂肪组织，以及6月龄犊牛皮下脂

7、肪组织为研究对象，采用链特异性转录组测序技术筛选鉴定在秦川牛不同部位脂肪组织中以及不同发育阶段皮下脂肪组织中差异表达的基因和长链非编码RNA，并对其进行了功能注释；利用实时定量实验对筛选到的差异表达基因以及长链非编码RNA进行了验证，并分析其在牛脂肪组织中的表达模式；对筛选获得的牛脂肪组织长链非编码RNA的类型、染色体分布、序列结构、表达特征以及小RNA结合位点等信息进行了分析；利用双荧光素酶报告系统验证了长链非编码RN