大针茅响应羊啃食的转录组学分析

大针茅响应羊啃食的转录组学分析

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时间:2019-03-20

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1、分巧号Q57学校化码10129UDC己77学号2013211047義走落嗦乂#硕±学位论文大针茅响应羊哨食的转录组学分析Thetranscrit;omeanalsisof况Z幻ra巧成文resonsetosheeeatinpy女各ppg申请人:李春瑞学位类别;工程硕±领域:生物工程指导教师:韩冰教授论文提交日期-:二〇五年六月巧蒙古农业大学研究生学位论文独创声明本人申明所呈交的学位论文是我本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加L义标注和致谢的地方外

2、,论文中不包括其他人巴经发表或撰写过的研究成果,也不包括为获得我校或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在,与我论文中作了明确的说明并表示谢意。一申请学位论文与资料若有不实之处,本人承担切相关责任。〕.忘日期.b论文作者签名:寺啼:!/皮\内蒙古农业大学硏究生学位论文版权使用授权书本人完全了解内蒙古农业大学有关保护知识产权的规定:,巧研究生在攻读学位期间论文工作的知识产权单位属内蒙古农业大学。本人保证毕业离校后,发表论文或使用论文王作成果时署省单位为内蒙古农业大学,且导师为通讯作者

3、,通讯作者单位亦署名为内蒙古农业大学。学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电^公布学位论文的全部或部。1子文档,允许论文被查阅和借阅学校可乂分内容,采用影印、缩印或其他手段保存论文。(保密内容除外)论文作者签《:净秦蛛指导教师签名:媒赤1曰^仅期:2i摘要大针茅(汉皆曰gran油?0,属于针茅属光芒組(iSecf.Ca护7/细曰6),是多年生密丛型旱生未本科牧草,主要分布于我国内蒙古中东部、东北、宁夏、甘肃和青海境内,由于其基生叶丰富且能很好的保存至冬春,因而是牲畜喜好也是非常重要的牧草之0,进行羊哨食

4、控制实验2本研究^1大针茅为研究材料。对大针茅受到羊哨食后小时的DS(实验組)与未哨食处理的大针茅DD(对照组)叶片做的高通量转录组测序(RNAsequences),对得到的转录组数据库随机挑选5个基因,运用实时夷光定量PCR手段对其表达量变化进行验证。对转录组数据进行数据统计、差异表达基因分析、〇〇和〇〇〇功能分析,^及对转录組中的薦糖和淀粉代谢通路相关酶基1^因表达分析。对大针茅受到羊哨食后化、4h、8h、1化和24h和未哨食处理作为对照,分析类黄丽代谢通路中的5个关键基因甘、C甘/、护好、¥CL和化:¥甘,利用实时夷光定量PC民对其进行

5、相对表达量的测定。研究得到如下结果:1W羊哨食后的大针茅为材料,提取总RNA进行Ilhimina平台的转录组测序,共得到147561个reads,組装成64738条Unigenes,Unigenes平均长度为1367.2化口,N50为2017b,构建转录組数据库p。25-随机选取转录组数据库中的个基因,萌发素类蛋白、叶绿素ab结合蛋白-3c-a、叶绿素ab结合蛋白2、酷氨酸激酶和松油醇合成酶,通过qRTPC民检测,5个基因上下调趋势与转录组测序结果相符,证明转录组测序结果可靠。3DS(实验组)与DD(对照组)共有64199个基因表达,其

6、中DS与DD相比.,有49844个基因共同表达,占所有基因的7762%DS(;只在实验组)中的表达基因有3273个,占所有基因的5.1%;只在DDC对照组)中的表达基因有11093<=>=如<=..i.个,占所有基因的1728%。转录组数据库中满足p001&&ratio2orro05()17513301914494的差异表达的基因共有个,其中上调的基因有个,下调的有个。'4类黄丽代谢通路中的5个基因C4町、0?/、巧5町、C化和化乂巿在24小时之,内均表现为在羊哨食处理的叶片中基因表达量下调;与类黄酬含量相关性分析表明,’’Fj5甘和斯

7、王为黄丽类化合物代谢通路中的关键调节酶。5羊哨食后大针茅中类黄丽的含量与对照組相比均有所下降,表明大针茅响应羊哨食次生代谢物质含量下降,与昆虫哨食植物后的应微反应不同。关键词:大针茅;羊哨食;转录组测序;实时夷光定量;类黄丽Thetranscritomeanalsisof汾'如ra巧cforesonsesheeeatinpygppgAbstract况少幻raMfi/5isadenseclu巧erteeren打ialherb,belo打i打to口gyppg

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