向日葵锈菌夏孢子萌发转录组学研究

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1、＾分类号Ｓ４３２．２２学校代码１０１２９ＵＤＣ６３２学号２０１３０２０７３書本落嗦乂掌硕±学位论文向日葵诱菌夏抱子萌发转录组学研究．？ＴｒａｎｓｃｒｉｔｏｍｅｏｆＵｒｅｄｉｏｓｏｒｅＧｅｒｍｉｎａ村ｏｎｏｆＰＭＣＣｉ？ｉｆｌＡｃ／，。／ｉｆＡｉｐｐ申请人：胡文捷学科名称：农业推广硕±领域：植物巧护指导教师：景魚副教授？■．，，．．．＇？ｉ—论文提交日期：二〇五年六月？？．！一■．＇—．－？？．．．．．？－Ｉ内蒙古农业大学研究生学位论文独创声明本人申明所呈交

2、的学位论文是我本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加Ｌ义标注和致谢的地方外，论文中不包括其他人＆经发表或撰写过的研究成果，也不包括为获得我校或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料一，与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均臣在论文中作了明确的说明并表示谢意。不实之处一申请学位论文与资料若有，本人承担切相关责任。ｒ．论文作者签名：＾，日期：办／内蒙古农业大学研究生学位论文版权使用授权书本人完全了解内蒙古农业大学有关保护知巧产权的规定，印：研究生在攻读学位期间论文工作的知识产权单位属内蒙古农业大学。本人

3、保证毕业离校后，发表论文或使用论文工作成果时署名单位为内蒙古农业大学，且导师为通讯作者，通讯作者单位亦署著为巧蒙古农业大学。学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电＾。１子文档，允许论文被查阅和借锅学校可乂公布学位论文的全部或部、分巧容（保密巧容除外），采用影印缩印或其他手段保存论文。论文作者签笔：Ｌｋ．指导教师签華：寺命日．期：施Ｊ＾１摘要一能不断重复侵染的阶段绣病的大规模爆发夏跑子阶段作为向日葵绣菌唯，对起着决定性作用。因此，开展向日葵绣菌夏抱子不同萌发阶段转录组学的巧究，对筛选与夏抱子萌发相关的基因，明确夏拖子萌

4、发的分子调控方式具有重大意义。本研究向日葵诱菌萌发处理后夏抱子为材料，采用ｎｉｕｍｉｎａ陆扣２５００测序平台对．ｑ向日葵镑菌３３０小种夏抱子萌发过程的转录组进行高通量分析，对测序序列进行基因注释和功能分类。研究，并利用生物信息学检索对差异表达基因的功能化确定主要结论如下：１、向日葵诱苗夏拖子的萌发与外界环境条件密切相关，条件适宜的情况下，抱’？黑子比便开始萌发，化９０％Ｗ上１０２５Ｃ为夏袍子最佳萌发率可达；；萌发温度一定时间暗环境在抱子萌发初期可促进抱子萌发，但达到，光照对新鲜袍子萌发率基本无影响：室温条件下２７０ｄ夏斑子基本丧失萌发能力；夏拖子浓度低于

5、２０ｍｇ／Ｌ时萌发率最窩，超过３０ｍ／Ｌ时萌发率显著巧低ｇ。向日葵绣菌夏袍子琼脂薄膜载玻片上萌发情况最佳，培养８ｈ后萌发率可达９３．５％，芽管平均长度为４巧．８５叫ｎ，侧光照射ＰＶＤＦ膜和亲水滤膜可全方位观察到抱子萌发过程和形态，并且可Ｗ清晰看到芽管内的黄色物质。－Ｓ２、本研究中成功构建了向日葵诱菌夏抱子不同萌发时间的ＲＮＡ巧测序文库，经Ｉｌｌｕｍｉｎａ测序和庇ｎｏｖｅ组装共得到了巧４０９条高质量ｕｎｉｇｅｎｅ序列》其平均长度化一批向日葵镑菌夏抱子萌发过程特有的基因序列为１７３５．９Ｐ。初步获得，为深入研究向日葵诱菌萌发侵染寄主相关基因功能研究提供了理论基

6、础，也为向日葵诱菌生物信息学等研究提供了大量的数据资源。３、对向日葵镑菌萌发夏抱子转录组测序得到的ｍｉｇｅｎｅ进行功能注释，共有４％１０条ｕｎｉｇｅｎｅ序列被注释，其中有４０９４９条ｕｎｉｇｅｎｅ序列披注释到Ｎｒ蛋白数据库３１３条ｕｎｉｅｎｅ序列被注释到Ｎｔ数据库；２７７０２条ｕｎｉｅｎｅ序列被注释到；２２ｇｇＳｗｉｓｓｐｒｏｔ数据库；１９０３２条ｕｎｉｇｅｎｅ序列在ＣＯＧ数据库中的２４条功能分类中得到注释；１７１１４个转录本被注释到ＧＯ数据库的Ｈ大本体类别中；有３４９３８条ｕｎｉｇｅｎｅ序列在ＫＥＧＧ数据库中得到注释。４、通过筛选得到了４５７８个在夏抱

7、子萌发不同阶段存在差异表达的基因，其中有巧３６个ｕｎｉｅｎｅ在ＳＹ０和ＳＹ４之间表达丰度上存在显著差异，２０４５个ｕｎｉｇｅｎｅｇ在ＳＹ０和ＳＹ８之间表达丰度上存在显著差异，而在ＳＹ４和ＳＹ８之间共有６０９个基ｕｎｉｇｅｎｅ在表达丰度上存在显著差异。通过差异表达基因在ＫＥＧＧ代谢通路中的功能富集分析，发现在ＳＹ０、ＳＹ４、ＳＹ８Ｈ个不同时期差异表达基因参与的代谢通路６存在很大差异ＳＹ４时期对应到各类遥路中的ｕ