gc-ms代谢组学方法筛选造血干细胞移植后的agvhd代谢标志物的研究

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1、SOOCHOWUNIVERSITY七年制专业学位论文论文题目GC-MS代谢组学方法筛选造血干细胞移植后的aGVHD代谢标志物的研究研究生姓名周萌指导教师姓名孙爱宁专业名称临床医学研究方向填血干细胞移植论文提交日期2015年5月苏州大学学位论文独创性声明本人郑重声明:所提交的学位论文是本人在导师的指导下,独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外,本论文不含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,也不含为获得苏州大学或其它教育机构的学位证书而使用过的材料。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体,均已在文中以明确方式标明。本人承担本

2、声明的法律责任。论文作者签名:同咐日期:山/a:r苏州大学学位论文使用授权声明本人完全了解苏州大学关于收集、保存和使用学位论文的规定,即:学位论文著作权归属苏州大学。本学位论文电子文档的内容和纸质论文的内容相一致。苏州大学有权向国家图书馆、中国社科院文献信息情报中心、中国科学技术信息研宄所(含万方数据电子出版社)、中国学术期刊(光盘版)电子杂志社送交本学位论文的复印件和电子文挡,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或其他复制手段保存和汇编学位论文,可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索。涉密论文口本学位论文属在年―—月解密后

3、适用本规定。非涉密论文E7论文作者签名:同弟日期:丨导师签名:日期:loiC.CGC-MS代谢组学方法筛选造血干细胞移植后的aGVHD代谢标志物的研究中文摘要GC-MS代谢组代谢组学方法筛选造血干细胞移植后的代谢组学方法筛选造血干细胞移植后的aGVHD代谢标志物的研究中文摘要目目的的基于气象色谱质谱联用(GC-MS)的方法,探究造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病(aGVHD)的血浆代谢标志物。方法本文采用GC-MS的研究方法分别对移植后7天内、移植后14天、28天及移植后29天至60天四个时间点的61位患者174例血浆样本进行处理,利用自动质

4、谱退卷积定性系统(AMDIS)和美国国家标准与技术研究院(NIST)标准库并结合保留指数对血浆中的化合物进行鉴定,再应用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)、t检验、遗传算法(GA)等多种统计学方法选取特征代谢物,并应用Logistic回归合并受试者工作特征曲线(ROC曲线)对代谢标志物组合进行最终筛选与评价。结果(1)建立了稳定、可靠的适用于人血浆的GC-MS代谢组学分析方法。本研究对该分析方法的日内稳定性、日间稳定性和预处理的重现性进行考察。实验结果表明上述三项考察中共有峰面积相对标准偏差(RSD)<15%的数目占到所有共有峰的95%

5、以上,说明该方法能能够满足血浆中代谢物相对定量的需要。(2)GC-MS扫描获得的总离子图(TIC)凭借AMDIS的解析合并NIST11库的检索并联合保留指数的比对共鉴定出54种化合物,包括氨基酸、脂肪酸和糖类等。(3)应用OPLS-DA方法分别对不同时间点的所有化合物信息进行分析,各个时间点阴性组阳性组分界清晰,联合OPLS-DA模型下的散点图(S-Plot)和变异权重参数值(VIP)值选取出不同时间点的aGVHD血浆特征代谢物,分别是:移植后7天内:尿素;移植后14天:尿素,棕榈酸;移植后28天:尿素;移植后29天至60天:乳酸,羟基乙酸,

6、果糖,塔罗糖。(4)分别对4个时间点所有鉴定出的化合物行独立样本t检验,以p≤0.05为标准选取出相应时间点的数个aGVHD血浆特征代谢物,分别为:移植后7天内:丙氨酸;移植后14天:山梨醇,甘油酸;移植后28天:甘氨酸,山梨醇;移植后29天I中文摘要GC-MS代谢组学方法筛选造血干细胞移植后的aGVHD代谢标志物的研究至60天:乳酸,丙酸,缬氨酸,尿素,甘氨酸,丝氨酸,山梨醇,葡萄糖,肌醇,丙二醇,α-生育酚,羟基乙酸,2,3-二羟基丁酸乙酯。(5)应用GA算法分别对不同时间点所有化合物信息进行计算,每个时间点计算5次,取位次靠前的十种化合

7、物,其结果分别是:移植后7天内:丙氨酸,3-羟丁酸,甘油,苯丙氨酸,山梨醇,酪氨酸,油酸,鸟氨酸,磷酸,甘油酸;移植后14天:丙氨酸,尿素,山梨醇,尿酸,棕榈酸单甘油酯,门冬氨酸,甘油酸,甘露糖,十五酸,花生酸;移植后28天:甘油,脯氨酸,甘氨酸,丝氨酸,山梨醇,亚油酸,油酸,色氨酸,磷酸,甘油酸;移植后29天至60天:乳酸,草酸,缬氨酸,甘氨酸,苏氨酸,山梨醇,肌醇,丙二醇,α-生育酚,甘油酸。(6)将4个时间点所有化合物分别用Logistic回归方程进行计算,以α入=0.05,α出=0.10为标准选取各个时间点的特征代谢物,其结果为:移植

8、后7天内:丙氨酸,尿素,酪氨酸;移植后14天:山梨醇,甘油酸,十五酸;移植后28天:甘氨酸,山梨醇,甘油酸;移植后29天至60天:乳酸,草酸,苏氨酸,丙二醇。(7)

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