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1、教學日誌銘傳大學生物科技學系教學日誌九十六學年度第二學期課程名稱：39314生物資訊學二[必修]上課班級：39302生科三乙編號：96TB-39314-a02授課教師：李御賢第30頁教學日誌課程名稱：生物資訊學二(三乙)日誌編號：96TB-39314-a02授課日期：2008/2/20週次節次：第1週7,8,9節授課教師：李御賢出席學生：55/55授課內容摘要1.課程進度：Molecularbiologyandbiologicalchemistry課程內容重點：分生簡介2.評量：到NCBIdownload序列資料，全班同學的要download的gene序列資料是不一樣，以防止同學抄襲。同
2、學上傳結果到ftp站PLD1HomosapiensmRNAforphospholipaseD1variantprotein.NM_002662cttgttagcccacagcctgtaatagaatggacagatgccaccctagttgtgtcttaagaaMPWHDIASAVHGKAARDVARHFIQRWNFTKIMKSKYRSLSYPFLLPKSQTTAHELRYQVP。3.作業：Q1.說明DNA與RNA的不同?(SketchthechemicalstructuresofDNAandRNA).Q2.Whatisthecomplementarysequenceof5-GGATCG
3、TAGCCTA-3’並以三種Alternativewaystorepresentnucleicacidchains.Q3.Diagramthe“centraldogma”ofmolecularbiologyin真核細胞andin原核細胞.Q4.真核細胞的Genestructure包括Promoter,intron,exon,第30頁教學日誌terminator,分別說明之.Q5.真核細胞的mRNAprocessing包括Capping,PolyAdenylation,RNAsplicing分別說明之.Q6.說明的Primary,Secondary,TertiaryandQuaternar
4、yStructureofProteinstructure.Q7.(a)化學鍵可分為：共價鍵、離子鍵及金屬鍵三大類，說明之．(b)物理鍵包括氫鍵與凡得瓦爾力，說明之．(c)比較上述各鍵能之大小．Q8.說明Radiocarbondating的原理．Q9.HowdoesacDNAlibrarydifferfromagenomiclibrary?Q10.AcircularpieceofDNAknowntobe4000bplongiscutintotwopieceswhentreatedwiththerestrictionenzymeEcoRI:Onepiecesis3000bplongandth
5、eotheris1000bplong.Anotherrestrictionenzyme,BamHI,cutsthesameDNAmoleculeintothreepiecesofthefollowinglengths:2500,1200and300bp.WhenbothEcoRIanBamHIareusedtocuttheDNAmoleculetogether,fragmentsofthefollowingsizesaregenerated:1600,1200,900,200,and100bp.Usethisinformationtomakearestrictionenzymemapof
6、thiscircularDNAmolecule,1.回應：none記錄者：李御賢教師：李御賢第30頁教學日誌課程名稱：生物資訊學二(三乙)日誌編號：96TB-39314-a02授課日期：2008/2/27週次節次：第2週7,8,9節授課教師：李御賢出席學生：55/55授課內容摘要1.課程進度：DataSearchesandPairwiseAlignments課程內容重點：FetchsequencesandDotplot的分析2.評量：到NCBIdownload序列資料，包括exon，intron的資料，全班同學的要download的gene序列資料是不一樣，以防止同學抄襲。同學上傳結果到
7、ftp站。NM_003753GGGAGAGCAGTTTACGACAGCGCCGGTCGTGTTTACGGCGGCGCCCGCTGCGCGCATTTTGGAAGATGGCAAAGTTCATGACACCC15803.作業：Q1.Downloadgene“DEFA3”的DNA,RNA與protein序列.並標示出genomicDNA的exon與intron的位置。Q2.說明dotplots中,WindowSize與MismatchLimi
