普通烟草sbp-box基因的鉴定、系统进化分析和功能研究

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1、分类号：Ｑ２学校代码：１０６９７２０１２２０８７１密级：公开学号：－－－．．，—．．？山＂《．１破±亨恆巧交’ＭＡＳＴＥＲＳＤＩＳＳＥＲＴＡＴＩＯＮ－－．ｒ、評普通烟草ＳＢＰ－ｂｏｘ基因的鉴定统进、系化分析和功能研究．．－：．：＂：．学科違称：细胞生物学作者：韩瑶瑶指导老师：徐子勤西北大学学位评定委员会二〇—五年．．？■■■■■／．■＇■＇－ｌｔｉ．＂ｒｒｔ．西北大学学位论文知识产枚声明书本人完全了解西北大学关于收集、保存、使用学位论文的规定。学校

2、有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版。本人允许论文被查阀和借阅。本人授权西北大学可Ｗ将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。同时授权中国科学技术信息研究所等机构将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》或其它相关数据库。保密论文待解密后适用本声明。学位论文作者签名；指导教师签名；＞冰年ｔ月日年＾月日／Ｉ西北大学学位论文独剑性声明本人声明：所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加标注巧致谢的地方外，本论文

3、不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得西北大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢＇学位论文作者签名；ｉｆＡ从占月Ｊ年曰普通烟草ＳＢＰ－ｂｏｘ基因的鉴定、系统进化分析和功能研究摘要ＳＢＰ（ＳＱＵＡＭＯＳＡＰＲＯＭＯＴＥＲＢＩＮＤＩＮＧＰＲＯＴＥＩＮ）家族是植物特有的转录因子家族。金鱼草ＡｍＳＢＰｌ和ＡｍＳＢＰ２是最早被发现的泌Ｐ家族成员，它们能够在体外实验中结合Ｗ化基因的启动子一６，并因此而得名。ＳＢＰ蛋白都具有个由大约７个氨基酸残基构成的高度

4、保守的ＳＢＰ结构域，其功能为结合祀标基因上游的顺式调控一ＳＢＰ－ｂｏｘ元件。般将ＳＢＰ结构域的编码序列称为，将编码这些转录因子的基因称为－ｂｏｘ基因ＳＢＰ。已有的研究结果表明ＳＢＰ转录因子，在植物生长发育的许多方面发挥着重要的作用。本工作通过对茄科植物基因组信息资源口户网站（ｈｔｐ：／／ｓｏｌｇｅｎｏｍｉｃｓ．ｎｅｔ／）中的普－通烟草基因组数据库进行ＢＬＡＳＴ搜索，找到了多个ＳＢＰｂｏｘ基因的基因组序列，在此一基础上利用ＧＥＮＳＣＡＮ在线工具预测了它们的内含子和外显子结构。进步采用－－ｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎ艮ＴＰＣＲ（ｒｅｖｅｒｓｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ

5、ｉｏｎｐｏｌｙｒｅａｃｔｉｏｎ）技术从普通烟草品种秦烟９５克隆了其中１５个基因的编码序列，并通过序列测定对计算机分析结果进行了验证。为了能够准确地反映普通烟草ＳＢＰ－ｂｏｘ基因可能具有的功能，根据拟南芥和番茄中的直系同一源基因对它们进行了统命名，并作为这些基因的基本名称。在１５个被证■Ａ没ｔ基因／ｎＷ《应。实的Ａｆｅ中，有１３个包含／ｉ答元件为了确定ＭａＭＰＺ基因的起源，对普通烟草（Ａ＆０姑ｎａｆａｂａｃｉ／ｍ）、林烟草（ＡＣ如６／ｓ）和耳状烟草－巧５扣９）、绒烟草渝ｍｚ（ＴＶｌｏ巧的ＳＢＰｂｏｘ直系同源基因的开放阅读框序列进行了多重比对，结果显示有

6、６个ｉＶｂＭＰＺ基因＇－Ｎｔａｂ排ＵｔａｂＳＰＬ６ｌＮｔａｂ沈Ｌ６义ＮｔａｂＳＰＬ６－３骑ＮｔａｂＳＰＬ９ａ）來為馬祗寧货本Ｎ，ｉ母－－私ＭａｂＳ化签思｛ＮｔａｂＳＰＵｂＮｔａｂ沈Ｌ６４ＮｔａｂＳＰＬ６－５ＮｔａｂＳＰＬ６６，吴於９个，，，，＇－ＮｔａｂＳＰＬ７ＮｔａｂＳＰＬ８ＮｔａｂＳＰＬ６７，ＮｔａｂＳＰＬ９ｂ帮ＮｔａｂＳＰＬＩ３）来包缴馆摩父材，，，这表明普通烟草是林烟草和绒烟草祖先通过种间杂交形成的异源四倍体。与Ｗ前有关高度重复序列的研究结果相反，普通烟草在二倍体化过程中更多地保留了父本起源的筑１基因。一为了进步研究普通烟草、

7、番茄和拟南芥中游基因的进化关系，采用ＵＰＧＭＡＵｎｗ－ｅｉｈｔｅｄＰａｉｒＧｒｏｕＭｅｔｈｏｄｗｉｔｈＡｒｉｔｈｍｅｔｉｃｍｅａｎｓ）算法对高度保守的ＳＢＰ（ｇｐｉ结构域的氨基酸序列进行了系统进化分析，结果显示普通烟草、番茄和拟南芥的沿ｔ一亚家族中的Ｓ化基因具有相似的结构特征基因可Ｗ区分为八个亚家族，同，包括外显子数目、基因组序列的长度Ｗ及开放阅读框的大小。值得注意的是，我们在烟草中发一－ＡＧ内含子现了７个