转录组测序揭示山羊和绵羊疼痛应答遗传机制研究

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1、分类号S813.3学校代码10129^PiWH?—'一*UDC631学号2011311001^書本蓉"東攀博dr学位论文转录组测巧揭示山羊和绵羊疼痛应答遗传机制硏究studyonGoatandSheepPainResponseGeneticMechanismbTranscri化meSeuencinypqg申请人:邓秀玲学科n类;农学学科专业:动物发育生物学与生物技术研究方向:动物细胞发育与调控指导教师:周欢敏教授^59

2、'二〇-论文提交日期:五年六AIHm'i内蒙古农业大学研究生学位论文独创声明本人申明所呈交的学位论文是我本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研巧成果。据我所知,除了文中特别加W标注和致谢的地方外,论文中不包括其他人己经发表或撰写过的研究成果,也不包巧为获得我校或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在,与我论文中作了明确的说明并表示谢意。申请学位论文与资料若有不实之处一切相关责,本人承担任。论文作者签名’//

3、:5^旅日期:万)化户巧蒙古农业大学研巧生学位论文版权使用授权书本人完全了解内蒙古农业大学有关保护知识产权的规定,目P;研究生在攻读学位期间论文工作的知识产权单位属内蒙古农业大学。本人保证毕业离校后,发表论文或使用论文工作成果时署名单位为内蒙古农业大学,且导师为通讯作者,通讯作者单位亦署名为内蒙古农业大学。学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子文档,允许论文被查阅和借阅。学校可W公布学位论文的全部或部分内容(保密内容除外),采用影印、缩印或其他手段保存论文。

4、论文作者签名;珠*於指导獅签名:、‘I日期;城《!摘要慢性疼痛是常见的复杂的神经病理与主观感受症状,在不同物种之间对疼痛的感受存在着明显的差别。脊髓背根神经节(dorsalrootanlion,DRG)是痛觉gg产生、维持和传导的初级中枢。因此研究DRG的转录组有助于系统认识慢性疼痛发生的调控机制和疼痛致病基因的筛选。本研究选择CFA疼痛处理(实验组)-,每组3只和未处理(对照姐)的绵羊和山羊各2组,取其DRG組织,通过RNAseq高通量测序与生物信息学分析,揭示不

5、同物种间疼痛响应的基因调拉模式,取得如下主要结果:1.疼痛的调控发生在转录水平、转录后水平和可变剪接水平。2.差异基因聚类结果显示,实验组山羊和绵羊的基因表达模式发生了显著变化。3.DEG分析,实验组山羊获得差异表运基因1748个,绵羊2,441个;种间,差异基因2,935个,其中,仅在绵羊DRG表达的基因426个,仅在山羊表达353个。4.GO分析显示Jl及,山羊参与炎症应答、免疫应答、损伤应答和防御应答tn控离子通道、神经递质及其受体等相关基因表达变化显著,如:CCL2

6、7、PRKACA、GABRA4、G民IA2、GRIK3、CACNA1E、SCN3A、KCNK1等基因通过上调或下调参与疼痛应答,发挥了关键调控作用,该结果提示炎性疼痛发生时山羊的免疫系统发生了显著变化。这些差异基因参与了Chemokinesignalingathwa、Retroradeendocannabinoidsinaling、Calciumsinalinathwa、pyggggpyGlutamatergicsynapse、MAPKsignalingathwa等途径,

7、它们的激活在山羊疼痛py应答中起了关键作用。5.GO分析显示,绵羊抑制性神经递质及其受体基因如GAB民G3、GABRB2、GABRB1、GLRA3、CLCN7表达活跃;疼痛应答过程中SCN9A、SCN4B、SCN-11A、SCN8A、SCN7A、SCN10A、TRPV1等编码电压n;空钢离子通道及参与納寓子运输、神经营养因子信号途径相关基因表达下调,其中SCN9A、TRPV1表达下调与疼痛耐雙相关。差异基因參与GABAergicsynapse、Neurotrophinsigna

8、lingpathway.Retrogradeendocannabinoidsignaling、Morphine---addiction、Nicotineaddiction、Neurotransmitterga化dionchannelligandbindin呂等迎路,衷明这些迪路可能参与了绵卞疼滿应答过程。6,.种间差异基因GO分析显示电压口挖离子通道、损伤化答

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