珠江沉积物甲烷厌氧氧化菌群群落结构研究

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1、硕士学位论文珠江沉积物甲烷厌氧氧化菌群群落结构研究作者姓名黄晓燕学科专业微生物学指导教师林炜铁教授所在学院生物科学与工程学院论文提交日期2015年6月ReserchonAnaerobicMethane-OxidizingCommunitiesintheSedimentofPearlRiverADissertationSubmittedfortheDegreeofMasterCandidate：HuangXiaoyanSupervisor：Prof.LinWeitieSouthChinaUniversityofTechnologyGuangzhou,Chin

2、a分类号：Q93学校代号：10561学号：201220123344华南理工大学硕士学位论文珠江沉积物甲烷厌氧氧化菌群群落结构研究作者姓名：黄晓燕指导教师姓名、职称：林炜铁教授申请学位级别：理学硕士学科专业名称：微生物学研究方向：工业微生物与发酵技术论文提交日期：2015年6月11日论文答辩日期：2015年6月5日学位授予单位：华南理工大学学位授予日期：2015年月日答辩委员会成员：王菊芳李杉杜红丽罗晓春罗剑飞主席：王菊芳委员：李杉杜红丽罗晓春罗剑飞华南理工大学学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的论文是本人在导师的指导下独立进行研宄所取得的研宄成果。除了

3、文中特别加以标注引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体己经发表或撰写的成果作品。对本文的研宄做出重要贡献的个人和集体，均己在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。作者签名：m日期：年/月m日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，艮p:研宄生在校攻读学位期间论文工作的知识产权单位属华南理工大学。学校有权保存并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许学位论文被查阅（除在保密期内的保密论文外）；学校可以公布学位论文的全部或部分内容，可以允许采用影印、缩印或其它复制手段保存、汇编学位论

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5、SAMO）和反硝化型甲烷厌氧氧化（DAMO）。SAMO的关键菌群为ANME，DAMO的关键菌群为NC10门细菌。本文以ANME的关键基因mcrA和NC10门菌的关键基因pmoA、NC1016SrRNA基因作为分子标记，以珠江广州段白蚬壳、穗石、中大三个码头的沉积物、中大的水样为研究对象，通过构建关键基因的克隆文库和系统发育树，以及结合PCR-DGGE技术、绝对荧光定量技术分析了珠江环境中SAMO、DAMO过程的主要菌群ANME和NC10门细菌的群落结构与丰度。得到以下结论：1.白蚬壳和中大两点共获得了41个OTUs，20个OTUs是S-Ⅰ型mcrA基因，属

6、于ANME-1；21个OTUs的S-Ⅱ型mcrA基因，属于ANME-2。证明了样品中存在不同种类的ANME。其中，白蚬壳获得的24个OTUs，包括3个S-Ⅰ型mcrA基因，21个S-Ⅱ型mcrA基因。中大样品17个OTUs都是ANME-1。白蚬壳的物种多样性和均匀度均高于中大点。2.从NC1016SrRNA基因、pmoA基因的克隆文库各获得12个OTUs。基因文库多样性指数分析表明，穗石沉积泥的NC1016SrRNA的克隆文库的物种多样性、均匀度均高于其他两点。pmoA基因的克隆文库的多样性最高的是中大，均匀度则与穗石点基本一致。进化发育树分析表明：所有的

7、NC1016SrRNA基因、pmoA基因的克隆序列均来自NC10门细菌，NC1016SrRNA的系统发育树则表明珠江沉积物中的NC10菌主要是NC10菌的GroupB。83.白蚬壳和中大码头每克沉积泥样品中大aprA、mcrA基因的拷贝数浓度在10；穗石点不能扩增出mcrA基因，穗石点的aprA拷贝数比其他两点浓度低一个数量级。三点7沉积泥的NC1016SrRNA的拷贝数浓度在均在10数量级，没有明显的丰度差异。4.比对了不同时间采集的中大沉积泥和不同深度的中大水样中的mcrA、NC1016SrRNA基因的分布和丰度。DGGE图谱分析表明：3月采集的泥样Z

8、3和7月的Z7的相似度极高，聚成一类，但5月的Z5中mcrA基因的