水稻抗白叶枯病相关基因oscrk1的鉴定和克隆

水稻抗白叶枯病相关基因oscrk1的鉴定和克隆

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1、密级:论文编号:中囯农业科学院学位论文水稻抗白叶枯病相关基因的鉴定和克隆IdentificationandCloningofaBacterial-blightResistance-RelatedGeneOsCRKlinRice硕士研究生:张明伟指导教师:王春连研究员申请学位类别:农学硕士专业:作物遗传育种研究方向:分子育种培养单位:作物科学研究所研究生院2015年5月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研宄工作及取得的研宄成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研宄

2、成果,也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研宄所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研宄生签名:日寸间:丄呢年!T月#关于论文使用授权的声明本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定,目卩:中国农业科学院有权保留送交论文的复印件和磁盘,允许论文被査阅和借阅,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研宄生签名胸件时间:〇j〇/jr年贫月上和中国农业科学院硕士学

3、位论文评阅人、答辩委员会签名表论文题目水稻抗白叶枯病相关基因OsCRKl的鉴定和克隆作物遗传育论文作者张明伟专业研究方向分子育种种中国农iJk科学院作物指导教师王春连培养单位(研宄所)科与^研究所硕(博)姓名职称单位专业签名导师评硕导口博导口阅硕导口人博导口答辩主席硕导口中国农业大学农学与生物植物病理^张忠军教授博导口技术学院学硕导口中国科学院遗传与发育研作传张相岐研究员博导口究所育种硕导口中国农业大学农学与生物作物遗传徐明良教授博导口技术学院育种答硕导口北京市农林科学院植物保植物病理裘季燕研宄员博导口护环境保护研究所学辩硕导口中国

4、农业大学农学与生物植物病理国立耘教授博导口技术学院学委硕导口中国农业科学院农业资源牛永春研究员微生物学博导口与农业区划研宄所员硕导口中国农业科学院作物科学作物遗传夏先春研究员博导口研究所育种硕导口博导口会议记录(秘书)高英论文答辩时间地点2015年5月28日8:30作物科学研宂所国家种质库一楼会议室Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationIdentificationandCloningofaBacterial-blightResistance-Relate

5、dGeneOsCRK1inRiceM.S.Candidate:MingweiZhangSupervisor:Prof.ChunlianWangMajor:CropgeneticsandbreedingSpecialty:MolecularbreedingMay2015摘要由黄单胞杆菌引起的水稻白叶枯病是世界性水稻病害,严重制约水稻的高产稳产。多年的实践证明,种植抗病品种是防治该病最经济有效的途径。虽然已经鉴定出39个水稻抗白叶枯病基因,但被育种利用的并不多。因此挖掘和克隆新的抗白叶枯病基因是水稻抗病育种的客观要求。转录组测序(RNA

6、-seq)技术在新基因的发掘、代谢途径确定、基因家族鉴定及进化分析等多方面显示出极大的效力。我们从野生稻中挖掘出一个高抗白叶枯病资源,并培育出以IR24(感病)为背景的近等基因系5024(抗病)。本研究利用转录组测序技术对这对近等基因系进行测序,通过测序结果分析、qRT-PCR验证、RNAi干扰分析等手段获得抗病相关基因。获得的主要研究结果如下:1.用国内外25个白叶枯病代表菌系对近等基因系5024接种鉴定,结果5024对23个菌系表现高抗。与已知白叶枯病抗性基因比较抗谱,发现5024与其他基因的抗谱均不相同,抗谱上优于Xa21,仅

7、次于Xa23,表明5024可能含有新的抗白叶枯病基因。2.对用强致病菌PXO99(P6)注射接种处理的近等基因系IR24和5024进行转录组测序,分别获得91022599和105644962条序列。通过测序结果分析,发现203个基因的表达有显著差异,其中5024比IR24表达量上调的有114(56.2%)个,下调的有89(43.8%)个。并且差异表达显著基因在第11染色体上的分布明显多于其它染色体。3.生物信息学分析发现在203个差异表达基因中有16个类抗病基因,14个过氧化物代谢相关基因,6个抗病相关转录因子,16个信号传导相关基

8、因。4.对在5024中表达上调而在IR24中下调的6个基因(包括3个预测抗病相关基因,3个未知蛋白)进行RT-PCR与qRT-PCR分析,表达结果与转录组测序结果一致。其中的一个基因(编号ZW22,后命名为OsCRK1)在5024中表

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