鲌鲂杂交品系线粒体基因组及5s rdna的结构分析和遗传特征

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1、？间或却提尖等硕±学位论文鱼白妨杂交品系线粒体基因绝及５ＳｒＤＮＡ的结构分析和遗传特征学科专业发育生物学学位类型囚科学学位□专业学位研究生姓名朱镇导师姓名、职称刘少军教授论文编号湖商师范大学学位评定委员会为、公室二零一五年五月湖南师苑大学学位论文原创胜声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究王作所取得的成果。除文中臣经注明引用的内容外，本论文不含任何其他个人或集体己经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究

2、做出重要贡献的个人和集体，均己在文中明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：＞ｉｒ年《月ｉ曰顿湖南师范大学学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，研究生在校攻读学位期间论文工作的知识产权单位属湖南师范大学。同意学校保留并向圃家有关部口或机构送交论文的复巧件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权湖南师范大学可Ｗ将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据岸进行检索，可Ｌ乂采巧影印、缩印或担描等复

3、制手段保存和汇编本学位论文。本学位论文属于１、保密□，在年解密后适用本授权书。２、不保密ｆｇｒｒ＂Ｖ’。（请在从上相应方框内打）￣々作者签苗奪日期：立５年（月ｒ日导师签省：曰期：Ｗ肢午备月主曰分类号密级学校代码10542学号201202141193鲌鲂杂交品系线粒体基因组及5SrDNA的结构分析和遗传特征Studiesonthestructureandgeneticcharacteristicsofcompletemitochondrialgenomesand5SrDN

4、Aintopmouthculter(TC♀)×bluntsnoutbream(BSB♂)hybrids研究生姓名朱镔指导教师姓名、职称刘少军教授学科专业发育生物学研究方向水生经济动物繁殖与育种湖南师范大学学位评定委员会办公室二零一五年五月摘要鱼类的远缘杂交指的是不同种间、属间或亚科间鱼类的杂交，它能结合不同鱼的优势特征，从而扩大遗传变异并获得新的物种。人工远缘杂交的研究在生理学基础理论研究及水产育种方面具有重要的意义。对于远缘杂交所获得的子代的分子生物学研究能帮助理解远缘杂交过程中新物种相比于原始亲本

5、的分子遗传状况。线粒体是真核生物的能量工厂，具有自己独特的遗传系统。线粒体基因组具有小型性、多态性和自主性等特点，适合于研究分子进化规律、物种起源及分化。5SrDNA是真核生物中一类高度保守的串联重复序列，对于生命功能及其重要，其NTS多态性已经成为一种合适的分子遗传标记来研究物种进化、种群分化和遗传多样性。本次研究中，我们对鲌鲂杂交品系的线粒体全基因组进行了测序，并利用生物信息学知识对它们进行了系统的结构及遗传特征的分析；此外，我们还对鲌鲂杂交品系及原始亲本翘嘴红鲌和团头鲂的5SrDNA进行了研究。

6、本文的主要研究内容如下：1.对鲌鲂F1代、F2代及F3代的线粒体全基因组进行了测序，并利用各种生物信息学软件，系统地分析了它们的DNA分子结构、碱基组成、基因组成及排列等特点。鲌鲂F1代、F2代及F3代的线粒体全基因组长度分别为16619bp、16620bp、16620bp，世代之间不同，推测为种群间具有多态性引起，且相比于原始母本翘嘴红鲌的线粒体全基因组（16622bp）均存在不同程度的缺失，推测远缘杂交过程中I出现了缺失现象。通过与原始亲本翘嘴红鲌及团头鲂的线粒体全基因组序列比较，我们发现鲌鲂杂交

7、品系的线粒体全基因组均与原始母本翘嘴红鲌更相似，研究表明尽管经历了远缘杂交，杂交子代的线粒体DNA仍严格遵循母系遗传规律。2.系统地对鲌鲂杂交品系的线粒体全基因组进行了分析。其结构与其他脊椎动物的较为一致，包括2个非编码区(1个控制区和1个轻链复制起始区)，2个rRNA基因，22个tRNA基因和13个蛋白编码基因。我们对其碱基组成、tRNA及rRNA的二级结构预测、编码蛋白质基因的密码子使用率进行了详细的分析，并通过与其他几种鱼类线粒体控制区的比较识别了控制区的3个保守区域和相关序列。我们将鲌鲂杂交品

8、系及其原始亲本的线粒体全基因组，与8中鲌亚科其他鱼类，以及2种亚科外鱼类为外群构建了NJ系统树，系统树表明鲌鲂杂交品系在线粒体方面依旧保持了较为严格的母系遗传，也侧面证明鲌鲂杂交品系是远缘杂交的产物。3.对鲌鲂杂交品系及其原始亲本的5SrDNA的结构及变异情况进行了分析。我们发现原始母本翘嘴红鲌中具有两种5SrDNA结构单元（188bp和286bp），而原始父本团头鲂及子代鲌鲂杂交品系中则只有一种(188bp)。我们推测远缘杂交过程中子代鲌鲂遗失了原始母